RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489617.5

CDK18-211, Transcript of cyclin dependent kinase 18, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CDK18, Length 3,190 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18-211ENST00000489617 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa8.48□□□□□ -1.05
CDK18-211ENST00000489617 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa8.48□□□□□ -1.05
CDK18-211ENST00000489617 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa8.48□□□□□ -1.05
CDK18-211ENST00000489617 PAX4O43316 350 aa8.48□□□□□ -1.05
CDK18-211ENST00000489617 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa8.47□□□□□ -1.05
CDK18-211ENST00000489617 CCKP06307 115 aa8.47□□□□□ -1.05
CDK18-211ENST00000489617 BAALC-AS2P0C853 105 aa8.47□□□□□ -1.05
CDK18-211ENST00000489617 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa8.47□□□□□ -1.05
CDK18-211ENST00000489617 DAND5Q8N907 189 aa8.47□□□□□ -1.05
CDK18-211ENST00000489617 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa8.47□□□□□ -1.05
CDK18-211ENST00000489617 NXPH4O95158 308 aa8.47□□□□□ -1.05
CDK18-211ENST00000489617 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa8.47□□□□□ -1.05
CDK18-211ENST00000489617 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.47□□□□□ -1.05
CDK18-211ENST00000489617 TSHBP01222 138 aa8.47□□□□□ -1.05
CDK18-211ENST00000489617 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.47□□□□□ -1.05
CDK18-211ENST00000489617 ZNF580Q9UK33 172 aa8.46□□□□□ -1.05
CDK18-211ENST00000489617 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 CLEC19AQ6UXS0 136 aa8.46□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 Q8N6K4 173 aa8.46□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 WFDC9Q8NEX5 89 aa8.46□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.46□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 MOB4Q9Y3A3 225 aa8.45□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 DNAL4O96015 105 aa8.45□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 IGHV3-11P01762 117 aa8.45□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 Q6JHZ5 121 aa8.45□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 LINC00846Q9NV44 126 aa8.45□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa8.45□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 A0A0J9YXY3 114 aa8.45□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 M0R381 172 aa8.45□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 CLPSL1A2RUU4 121 aa8.44□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 ATP6V0E1O15342 81 aa8.44□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 Q8N9W7 124 aa8.44□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 SNURFQ9Y675 71 aa8.44□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa8.44□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 INAFM2P0DMQ5 153 aa8.44□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 S100A4P26447 101 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa8.43□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 C22orf24Q9Y442 160 aa8.43□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 RPL39P62891 51 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 MINOS1Q5TGZ0 78 aa8.43□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 C11orf45Q8TAV5 145 aa8.43□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa8.43□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 LEPROTO15243 131 aa8.43□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.42□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 CCDC140Q96MF4 163 aa8.42□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 F8WEM9 126 aa8.42□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 A8MZ25 164 aa8.41□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 MGPP08493 103 aa8.41□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 DEFB136Q30KP8 78 aa8.41□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 Q6YL49 198 aa8.41□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 C18orf65Q6ZTR6 163 aa8.41□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 FSHBP01225 129 aa8.41□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 TRBV12-3P01733 135 aa8.41□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 PRR9Q5T870 116 aa8.41□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 TMEM61Q8N0U2 210 aa8.41□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 RMI2Q96E14 147 aa8.41□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.41□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa8.41□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 IGF1P05019 195 aa8.4□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 PRR15Q8IV56 129 aa8.4□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 C5orf56Q8N8D9 126 aa8.4□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 Q6ZRU5 148 aa8.4□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 LITAFQ99732 161 aa8.4□□□□□ -1.06
CDK18-211ENST00000489617 Q9HAA7 133 aa8.4□□□□□ -1.07
CDK18-211ENST00000489617 A6NDX4 124 aa8.39□□□□□ -1.07
CDK18-211ENST00000489617 TRAV21A0A0B4J279 112 aa8.39□□□□□ -1.07
CDK18-211ENST00000489617 IGIPA6NJ69 53 aa8.39□□□□□ -1.07
CDK18-211ENST00000489617 COPS9Q8WXC6 57 aa8.39□□□□□ -1.07
CDK18-211ENST00000489617 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CDK18-211ENST00000489617 Q8N2B8 174 aa8.38□□□□□ -1.07
CDK18-211ENST00000489617 LENEPQ9Y5L5 61 aa8.38□□□□□ -1.07
CDK18-211ENST00000489617 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.38□□□□□ -1.07
CDK18-211ENST00000489617 ZNF876PQ49A33 203 aa8.38□□□□□ -1.07
CDK18-211ENST00000489617 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CDK18-211ENST00000489617 COX7A2LO14548 114 aa8.38□□□□□ -1.07
CDK18-211ENST00000489617 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CDK18-211ENST00000489617 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa8.37□□□□□ -1.07
CDK18-211ENST00000489617 C1orf158Q8N1D5 194 aa8.37□□□□□ -1.07
CDK18-211ENST00000489617 PPP1R17O96001 155 aa8.36□□□□□ -1.07
CDK18-211ENST00000489617 BEAN1Q3B7T3 259 aa8.36□□□□□ -1.07
CDK18-211ENST00000489617 A0A087WZ39 114 aa8.36□□□□□ -1.07
CDK18-211ENST00000489617 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CDK18-211ENST00000489617 DEFB1P60022 68 aa8.36□□□□□ -1.07
CDK18-211ENST00000489617 Q9UF83 564 aa8.36□□□□□ -1.07
CDK18-211ENST00000489617 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CDK18-211ENST00000489617 KLK9Q2XQG4 91 aa8.36□□□□□ -1.07
CDK18-211ENST00000489617 C6orf223Q8N319 242 aa8.36□□□□□ -1.07
CDK18-211ENST00000489617 KLK9Q9UKQ9 250 aa8.36□□□□□ -1.07
CDK18-211ENST00000489617 PLAC8L1A1L4L8 177 aa8.35□□□□□ -1.07
CDK18-211ENST00000489617 RPL11P62913 178 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CDK18-211ENST00000489617 FAM218AQ96MZ4 157 aa8.35□□□□□ -1.07
CDK18-211ENST00000489617 GNRH2O43555 120 aa8.35□□□□□ -1.07
CDK18-211ENST00000489617 MIAQ16674 131 aa8.35□□□□□ -1.07
CDK18-211ENST00000489617 ZNF702PQ9H963 129 aa8.35□□□□□ -1.07
CDK18-211ENST00000489617 DNHD1Q96M86 4753 aa8.35□□□□□ -1.07
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