RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488774.1

PTPRD-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRD, Length 420 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-212ENST00000488774 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 A0A0J9YXV3 536 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 CNBPP62633 177 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 FABP9Q0Z7S8 132 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 LINC00242Q5T6M2 205 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 C10orf25Q5T742 122 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 Q5VSD8 79 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 C2orf66Q6UXQ4 117 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 C18orf32Q8TCD1 76 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 AMELXQ99217 191 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 COX11Q9Y6N1 276 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 A0A096LNI7 61 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 NUPR1O60356 82 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 PPP1R17O96001 155 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 UBE2D1P51668 147 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 KIAA0087Q14695 138 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 CD164L2Q6UWJ8 174 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 SVBPQ8N300 66 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 TOMM6Q96B49 74 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 TMEM101Q96IK0 257 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 SPANXA1Q9NS26 97 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 IFITM10A6NMD0 228 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 COLCA2A8K830 154 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 SNAPINO95295 136 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 Q6ZRU5 148 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 CHAC1Q9BUX1 264 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 S100PP25815 95 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 SS18Q15532 418 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 C2orf82Q6UX34 121 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 SPACA4Q8TDM5 124 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 TMEM141Q96I45 108 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 A0A087WYN8 130 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 C1orf196B1AJZ1 125 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 COX7A2LO14548 114 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 TRGC2P03986 189 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 RAB5AP20339 215 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 PDZD11Q5EBL8 140 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 CYSLTR1Q9Y271 337 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 A0A087WZ39 114 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 A0A1W2PNN7 141 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 FAM168BA1KXE4 195 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 EPM2AB3EWF7 344 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 MT-ND6P03923 174 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 C14orf177Q52M58 125 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 ORMDL2Q53FV1 153 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 ORAOV1Q8WV07 137 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 C6orf48Q9UBA6 75 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRD-212ENST00000488774 SPAG11BQ08648 103 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRD-212ENST00000488774 SYCNQ0VAF6 134 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRD-212ENST00000488774 TEX43Q6ZNM6 134 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRD-212ENST00000488774 ERASQ7Z444 233 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRD-212ENST00000488774 FAM19A2Q8N3H0 131 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRD-212ENST00000488774 TMEM18Q96B42 140 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRD-212ENST00000488774 CARD19Q96LW7 228 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRD-212ENST00000488774 SCGB3A1Q96QR1 104 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRD-212ENST00000488774 TIMM17AQ99595 171 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRD-212ENST00000488774 CST9LQ9H4G1 147 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRD-212ENST00000488774 SMCO4Q9NRQ5 59 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRD-212ENST00000488774 SMIM1B2RUZ4 78 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRD-212ENST00000488774 LINC00614P0C842 121 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRD-212ENST00000488774 ODF1Q14990 250 aa4.07□□□□□ -1.76
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PTPRD-212ENST00000488774 Q6ZRP5 223 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRD-212ENST00000488774 FA2HQ7L5A8 372 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRD-212ENST00000488774 VCX2Q9H322 139 aa4.07□□□□□ -1.76
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PTPRD-212ENST00000488774 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
PTPRD-212ENST00000488774 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRD-212ENST00000488774 K7EMI3 77 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRD-212ENST00000488774 SPINK8P0C7L1 97 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRD-212ENST00000488774 INAFM2P0DMQ5 153 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRD-212ENST00000488774 MALP21145 153 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRD-212ENST00000488774 PTTG1IPP53801 180 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRD-212ENST00000488774 MAJINQ3KP22 176 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRD-212ENST00000488774 COX19Q49B96 90 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRD-212ENST00000488774 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
PTPRD-212ENST00000488774 CFAP161Q6P656 301 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRD-212ENST00000488774 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRD-212ENST00000488774 AP5S1Q9NUS5 200 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRD-212ENST00000488774 C11orf86A6NJI1 115 aa4.05□□□□□ -1.76
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