RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486812.5

PRDM15-212, Transcript of PR/SET domain 15, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM15, Length 7,072 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM15-212ENST00000486812 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.49□□□□□ -1.21
PRDM15-212ENST00000486812 A0A1B0GU69 56 aa7.49□□□□□ -1.21
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PRDM15-212ENST00000486812 IGFL3Q6UXB1 125 aa7.49□□□□□ -1.21
PRDM15-212ENST00000486812 ODF3BA8MYP8 253 aa7.49□□□□□ -1.21
PRDM15-212ENST00000486812 A8MUN3 132 aa7.48□□□□□ -1.21
PRDM15-212ENST00000486812 TM2D3Q9BRN9 247 aa7.48□□□□□ -1.21
PRDM15-212ENST00000486812 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa7.48□□□□□ -1.21
PRDM15-212ENST00000486812 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa7.48□□□□□ -1.21
PRDM15-212ENST00000486812 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.47□□□□□ -1.21
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PRDM15-212ENST00000486812 C2orf48Q96LS8 159 aa7.47□□□□□ -1.21
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PRDM15-212ENST00000486812 POLEQ07864 2286 aa7.47□□□□□ -1.21
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PRDM15-212ENST00000486812 IGKV2D-28P01615 120 aa7.46□□□□□ -1.21
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PRDM15-212ENST00000486812 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.45□□□□□ -1.22
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PRDM15-212ENST00000486812 H3BS24 57 aa7.43□□□□□ -1.22
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PRDM15-212ENST00000486812 C14orf177Q52M58 125 aa7.42□□□□□ -1.22
PRDM15-212ENST00000486812 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.42□□□□□ -1.22
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PRDM15-212ENST00000486812 A6NDX4 124 aa7.42□□□□□ -1.22
PRDM15-212ENST00000486812 MSMPQ1L6U9 139 aa7.42□□□□□ -1.22
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PRDM15-212ENST00000486812 MED13Q9UHV7 2174 aa7.42□□□□□ -1.22
PRDM15-212ENST00000486812 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.41□□□□□ -1.22
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PRDM15-212ENST00000486812 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.38□□□□□ -1.23
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PRDM15-212ENST00000486812 Q96MF0 132 aa7.37□□□□□ -1.23
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PRDM15-212ENST00000486812 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.36□□□□□ -1.23
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PRDM15-212ENST00000486812 IGFL2Q6UWQ7 119 aa7.36□□□□□ -1.23
PRDM15-212ENST00000486812 PLCE1Q9P212 2302 aa7.35□□□□□ -1.23
PRDM15-212ENST00000486812 DEFB114Q30KQ6 69 aa7.35□□□□□ -1.23
PRDM15-212ENST00000486812 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.35□□□□□ -1.23
PRDM15-212ENST00000486812 DEFB135Q30KP9 77 aa7.35□□□□□ -1.23
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PRDM15-212ENST00000486812 Q5XG85 94 aa7.35□□□□□ -1.23
PRDM15-212ENST00000486812 A0A087WSZ3 146 aa7.35□□□□□ -1.23
PRDM15-212ENST00000486812 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
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PRDM15-212ENST00000486812 COA5Q86WW8 74 aa7.34□□□□□ -1.23
PRDM15-212ENST00000486812 PRR14LQ5THK1 2151 aa7.34□□□□□ -1.23
PRDM15-212ENST00000486812 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.34□□□□□ -1.23
PRDM15-212ENST00000486812 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.33□□□□□ -1.24
PRDM15-212ENST00000486812 DEFB4AO15263 64 aa7.33□□□□□ -1.24
PRDM15-212ENST00000486812 TNCP24821 2201 aa7.33□□□□□ -1.24
PRDM15-212ENST00000486812 CEP192Q8TEP8 1941 aa7.33□□□□□ -1.24
PRDM15-212ENST00000486812 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.33□□□□□ -1.24
PRDM15-212ENST00000486812 COL4A6Q14031 1691 aa7.33□□□□□ -1.24
PRDM15-212ENST00000486812 Q1T7F1 81 aa7.32□□□□□ -1.24
PRDM15-212ENST00000486812 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.32□□□□□ -1.24
PRDM15-212ENST00000486812 THSD7BQ9C0I4 1608 aa7.32□□□□□ -1.24
PRDM15-212ENST00000486812 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa7.32□□□□□ -1.24
PRDM15-212ENST00000486812 C2orf16Q68DN1 1984 aa7.32□□□□□ -1.24
PRDM15-212ENST00000486812 REG3GQ6UW15 175 aa7.31□□□□□ -1.24
PRDM15-212ENST00000486812 CDSNQ15517 529 aa7.31□□□□□ -1.24
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