RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481875.1

GARNL3-217, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-217ENST00000481875 RMI2Q96E14 147 aa7.57□□□□□ -1.2
GARNL3-217ENST00000481875 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.57□□□□□ -1.2
GARNL3-217ENST00000481875 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa7.56□□□□□ -1.2
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GARNL3-217ENST00000481875 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
GARNL3-217ENST00000481875 PMCHL1Q16048 86 aa7.56□□□□□ -1.2
GARNL3-217ENST00000481875 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.56□□□□□ -1.2
GARNL3-217ENST00000481875 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.56□□□□□ -1.2
GARNL3-217ENST00000481875 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.56□□□□□ -1.2
GARNL3-217ENST00000481875 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.56□□□□□ -1.2
GARNL3-217ENST00000481875 CHAC1Q9BUX1 264 aa7.56□□□□□ -1.2
GARNL3-217ENST00000481875 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.56□□□□□ -1.2
GARNL3-217ENST00000481875 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
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GARNL3-217ENST00000481875 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-217ENST00000481875 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-217ENST00000481875 NUPR1O60356 82 aa7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-217ENST00000481875 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
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GARNL3-217ENST00000481875 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.54□□□□□ -1.2
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GARNL3-217ENST00000481875 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-217ENST00000481875 BAALCQ8WXS3 180 aa7.54□□□□□ -1.2
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GARNL3-217ENST00000481875 VCX2Q9H322 139 aa7.53□□□□□ -1.2
GARNL3-217ENST00000481875 PRR34Q9NV39 138 aa7.53□□□□□ -1.2
GARNL3-217ENST00000481875 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.52□□□□□ -1.21
GARNL3-217ENST00000481875 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.52□□□□□ -1.21
GARNL3-217ENST00000481875 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
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GARNL3-217ENST00000481875 ATP5LO75964 103 aa7.52□□□□□ -1.21
GARNL3-217ENST00000481875 NPSP0C0P6 89 aa7.52□□□□□ -1.21
GARNL3-217ENST00000481875 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
GARNL3-217ENST00000481875 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.51□□□□□ -1.21
GARNL3-217ENST00000481875 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.51□□□□□ -1.21
GARNL3-217ENST00000481875 S100A6P06703 90 aa7.51□□□□□ -1.21
GARNL3-217ENST00000481875 SS18Q15532 418 aa7.51□□□□□ -1.21
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GARNL3-217ENST00000481875 CCL25O15444 150 aa7.49□□□□□ -1.21
GARNL3-217ENST00000481875 PRSS1P07477 247 aa7.49□□□□□ -1.21
GARNL3-217ENST00000481875 LINC01620Q4KN68 170 aa7.49□□□□□ -1.21
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GARNL3-217ENST00000481875 PMVKQ15126 192 aa7.48□□□□□ -1.21
GARNL3-217ENST00000481875 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
GARNL3-217ENST00000481875 AMELXQ99217 191 aa7.48□□□□□ -1.21
GARNL3-217ENST00000481875 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.47□□□□□ -1.21
GARNL3-217ENST00000481875 LINC00173Q6ZV60 143 aa7.47□□□□□ -1.21
GARNL3-217ENST00000481875 CST9LQ9H4G1 147 aa7.47□□□□□ -1.21
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GARNL3-217ENST00000481875 A0A0J9YXV3 536 aa7.44□□□□□ -1.22
GARNL3-217ENST00000481875 SEC11AP67812 179 aa7.44□□□□□ -1.22
GARNL3-217ENST00000481875 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.44□□□□□ -1.22
GARNL3-217ENST00000481875 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
GARNL3-217ENST00000481875 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
GARNL3-217ENST00000481875 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.43□□□□□ -1.22
GARNL3-217ENST00000481875 HERVK_113P63121 156 aa7.43□□□□□ -1.22
GARNL3-217ENST00000481875 COX6A2Q02221 97 aa7.43□□□□□ -1.22
GARNL3-217ENST00000481875 FOXI1Q12951 378 aa7.43□□□□□ -1.22
GARNL3-217ENST00000481875 ODF1Q14990 250 aa7.43□□□□□ -1.22
GARNL3-217ENST00000481875 C5orf38Q86SI9 138 aa7.43□□□□□ -1.22
GARNL3-217ENST00000481875 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.43□□□□□ -1.22
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