RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476784.5

TTC3-215, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 2

Gene TTC3, Length 7,425 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-215	ENST00000476784	ADCYAP1	P18509	176 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	C20orf197	Q8N268	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	UTRN	P46939	3433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784		B5MCH6	92 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	ACYP2	P14621	99 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	CACNA1A	O00555	2505 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	ODF3	Q96PU9	254 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	COLCA2	A8K830	154 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	CELA1	Q9UNI1	258 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	OBSL1	O75147	1896 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784		E9PLD3	99 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	CHTF8	P0CG12	524 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	SNURF	Q9Y675	71 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784		A0A0U1RQV1	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	AVP	P01185	164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	CDSN	Q15517	529 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784		M0R2T5	61 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784		A8MZ25	164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	MOBP	Q13875	183 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	RTL8C	O15255	209 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	LINC00208	Q96KT6	92 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	NOTCH4	Q99466	2003 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	SPRY4	Q9C004	299 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	PYY3	Q5JQD4	70 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC3-215	ENST00000476784	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		4.84	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		4.84	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	FXYD2	P54710	66 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	PLXNB1	O43157	2135 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784		A0A087WSZ3	146 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784		M0QY20	66 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	CRYGA	P11844	174 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	RNF185	Q96GF1	192 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	PLXNA2	O75051	1894 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	HCG22	E2RYF7	251 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	IGLV1-51	P01701	117 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	PTH2	Q96A98	100 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784		Q96NJ1	140 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	LINC00575	Q6W349	94 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	C16orf95	Q9H693	158 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784		H3BT86	120 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784		V9GYY9	64 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	COX17	Q14061	63 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784		Q6JHZ5	121 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	WFDC2	Q14508	124 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	SIPA1L1	O43166	1804 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784		J3KT08	172 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784		Q6ZRP5	223 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	LINC00315	P59091	139 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784		Q8IZM0	81 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	C9orf92	A6NGG3	77 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TTC3-215	ENST00000476784	LINC00643	Q86TS7	51 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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