RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465846.6

HOXB-AS3-203, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 434 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RPL39P62891 51 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NPYP01303 97 aa11.39□□□□□ -0.59
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PTTG1IPP53801 180 aa11.39□□□□□ -0.59
HOXB-AS3-203ENST00000465846 C5orf38Q86SI9 138 aa11.39□□□□□ -0.59
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa11.38□□□□□ -0.59
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CAMK2N2Q96S95 79 aa11.38□□□□□ -0.59
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FAM104AQ969W3 186 aa11.37□□□□□ -0.59
HOXB-AS3-203ENST00000465846 C2orf48Q96LS8 159 aa11.37□□□□□ -0.59
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SPANXA1Q9NS26 97 aa11.37□□□□□ -0.59
HOXB-AS3-203ENST00000465846 APOMO95445 188 aa11.36□□□□□ -0.59
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PPBPP02775 128 aa11.36□□□□□ -0.59
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GAGE2BQ13066 116 aa11.36□□□□□ -0.59
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa11.36□□□□□ -0.59
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SPAG11BQ08648 103 aa11.35□□□□□ -0.59
HOXB-AS3-203ENST00000465846 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ORMDL3Q8N138 153 aa11.34□□□□□ -0.59
HOXB-AS3-203ENST00000465846 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
HOXB-AS3-203ENST00000465846 OR10D4PQ8NGN7 298 aa11.33□□□□□ -0.6
HOXB-AS3-203ENST00000465846 IFITM10A6NMD0 228 aa11.32□□□□□ -0.6
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TMEM136Q6ZRR5 245 aa11.32□□□□□ -0.6
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PRELID3AQ96N28 172 aa11.32□□□□□ -0.6
HOXB-AS3-203ENST00000465846 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa11.31□□□□□ -0.6
HOXB-AS3-203ENST00000465846 A0A1W2PNN7 141 aa11.31□□□□□ -0.6
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LRP2P98164 4655 aa11.31□□□□□ -0.6
HOXB-AS3-203ENST00000465846 Q6ZRP5 223 aa11.31□□□□□ -0.6
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ORAOV1Q8WV07 137 aa11.31□□□□□ -0.6
HOXB-AS3-203ENST00000465846 A0A0J9YXV3 536 aa11.3□□□□□ -0.6
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RAB5AP20339 215 aa11.3□□□□□ -0.6
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LINC01600Q96MT4 127 aa11.3□□□□□ -0.6
HOXB-AS3-203ENST00000465846 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RNF151Q2KHN1 245 aa11.29□□□□□ -0.6
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SPINK6Q6UWN8 80 aa11.29□□□□□ -0.6
HOXB-AS3-203ENST00000465846 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
HOXB-AS3-203ENST00000465846 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa11.27□□□□□ -0.61
HOXB-AS3-203ENST00000465846 F8WDY8 70 aa11.27□□□□□ -0.61
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ANAPC16Q96DE5 110 aa11.27□□□□□ -0.61
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa11.27□□□□□ -0.61
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa11.27□□□□□ -0.61
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa11.26□□□□□ -0.61
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa11.26□□□□□ -0.61
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PRSS47A8MTI9 375 aa11.26□□□□□ -0.61
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NDUFA1O15239 70 aa11.26□□□□□ -0.61
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP11.26□□□□□ -0.61
HOXB-AS3-203ENST00000465846 REG3GQ6UW15 175 aa11.26□□□□□ -0.61
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MAP1LC3AQ9H492 121 aa11.26□□□□□ -0.61
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MT-ND4LP03901 98 aa11.25□□□□□ -0.61
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RAB14P61106 215 aa11.25□□□□□ -0.61
HOXB-AS3-203ENST00000465846 C10orf25Q5T742 122 aa11.25□□□□□ -0.61
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TMEM141Q96I45 108 aa11.25□□□□□ -0.61
HOXB-AS3-203ENST00000465846 IMMP2LQ96T52 175 aa11.24□□□□□ -0.61
HOXB-AS3-203ENST00000465846 A0A087WZ39 114 aa11.23□□□□□ -0.61
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LINC00242Q5T6M2 205 aa11.23□□□□□ -0.61
HOXB-AS3-203ENST00000465846 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa11.23□□□□□ -0.61
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
HOXB-AS3-203ENST00000465846 Q8N8P6 123 aa11.23□□□□□ -0.61
HOXB-AS3-203ENST00000465846 C6orf48Q9UBA6 75 aa11.23□□□□□ -0.61
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa11.23□□□□□ -0.61
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MT-ND6P03923 174 aa11.22□□□□□ -0.61
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TLX1NBP0CAT3 122 aa11.22□□□□□ -0.61
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TEX43Q6ZNM6 134 aa11.22□□□□□ -0.61
HOXB-AS3-203ENST00000465846 UBE2D1P51668 147 aa11.21□□□□□ -0.61
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KIAA0087Q14695 138 aa11.21□□□□□ -0.61
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ODF1Q14990 250 aa11.21□□□□□ -0.61
HOXB-AS3-203ENST00000465846 C2orf66Q6UXQ4 117 aa11.21□□□□□ -0.61
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CYSLTR1Q9Y271 337 aa11.21□□□□□ -0.61
HOXB-AS3-203ENST00000465846 C2orf88Q9BSF0 95 aa11.2□□□□□ -0.62
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FAM168BA1KXE4 195 aa11.19□□□□□ -0.62
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP10-8P60410 259 aa11.19□□□□□ -0.62
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa11.19□□□□□ -0.62
HOXB-AS3-203ENST00000465846 Q6ZN92 141 aa11.19□□□□□ -0.62
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LINC00173Q6ZV60 143 aa11.19□□□□□ -0.62
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ORMDL2Q53FV1 153 aa11.18□□□□□ -0.62
HOXB-AS3-203ENST00000465846 C1orf137Q5JT78 98 aa11.18□□□□□ -0.62
HOXB-AS3-203ENST00000465846 AMELXQ99217 191 aa11.18□□□□□ -0.62
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GAGE2EQ4V326 116 aa11.17□□□□□ -0.62
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CLLU1Q5K131 121 aa11.17□□□□□ -0.62
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LINC01561Q8N1V8 128 aa11.17□□□□□ -0.62
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CTDSP1Q9GZU7 261 aa11.17□□□□□ -0.62
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GAGE2DQ9UEU5 116 aa11.17□□□□□ -0.62
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa11.16□□□□□ -0.62
HOXB-AS3-203ENST00000465846 K7EMI3 77 aa11.16□□□□□ -0.62
HOXB-AS3-203ENST00000465846 C2orf82Q6UX34 121 aa11.16□□□□□ -0.62
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
HOXB-AS3-203ENST00000465846 VCX2Q9H322 139 aa11.16□□□□□ -0.62
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
HOXB-AS3-203ENST00000465846 IGIPA6NJ69 53 aa11.15□□□□□ -0.62
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NPSP0C0P6 89 aa11.15□□□□□ -0.62
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ADCYAP1P18509 176 aa11.14□□□□□ -0.63
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa11.13□□□□□ -0.63
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa11.13□□□□□ -0.63
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa11.13□□□□□ -0.63
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa11.13□□□□□ -0.63
HOXB-AS3-203ENST00000465846 IGLV7-43P04211 117 aa11.12□□□□□ -0.63
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa11.12□□□□□ -0.63
HOXB-AS3-203ENST00000465846 M0QXV9 152 aa11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 117.3 ms