RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460328.5

TTC3-211, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 3

Gene TTC3, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-211ENST00000460328 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP-0.95□□□□□ -2.56
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TTC3-211ENST00000460328 MEIG1Q5JSS6 88 aa-0.95□□□□□ -2.56
TTC3-211ENST00000460328 C10orf113Q5VZT2 155 aa-0.95□□□□□ -2.56
TTC3-211ENST00000460328 SONP18583 2426 aaKnown RBP-0.95□□□□□ -2.56
TTC3-211ENST00000460328 HMGXB3Q12766 1538 aa-0.95□□□□□ -2.56
TTC3-211ENST00000460328 TULP4Q9NRJ4 1543 aa-0.95□□□□□ -2.56
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TTC3-211ENST00000460328 SHANK2Q9UPX8 1470 aa-0.96□□□□□ -2.56
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TTC3-211ENST00000460328 ARHGEF5Q12774 1597 aa-0.96□□□□□ -2.56
TTC3-211ENST00000460328 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa-0.97□□□□□ -2.56
TTC3-211ENST00000460328 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa-0.97□□□□□ -2.56
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TTC3-211ENST00000460328 SHROOM2Q13796 1616 aa-1□□□□□ -2.57
TTC3-211ENST00000460328 TET3O43151 1660 aa-1□□□□□ -2.57
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TTC3-211ENST00000460328 SPTA1P02549 2419 aa-1.02□□□□□ -2.57
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TTC3-211ENST00000460328 ZFHX3Q15911 3703 aa-1.02□□□□□ -2.57
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TTC3-211ENST00000460328 SELENOWP63302 87 aa-1.03□□□□□ -2.57
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TTC3-211ENST00000460328 C1orf167Q5SNV9 1468 aa-1.05□□□□□ -2.58
TTC3-211ENST00000460328 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
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TTC3-211ENST00000460328 UQCR10Q9UDW1 63 aa-1.05□□□□□ -2.58
TTC3-211ENST00000460328 URB1O60287 2271 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
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TTC3-211ENST00000460328 DSPP15924 2871 aaKnown RBP-1.06□□□□□ -2.58
TTC3-211ENST00000460328 FAM223BA6NKX1 122 aa-1.06□□□□□ -2.58
TTC3-211ENST00000460328 BTG2P78543 158 aa-1.06□□□□□ -2.58
TTC3-211ENST00000460328 MANBALQ9NQG1 85 aa-1.06□□□□□ -2.58
TTC3-211ENST00000460328 DNAJC13O75165 2243 aa-1.06□□□□□ -2.58
TTC3-211ENST00000460328 NLRP1Q9C000 1473 aa-1.06□□□□□ -2.58
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