RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436289.6

NELFE-204, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5

Gene NELFE, Length 906 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-204ENST00000436289 CTDSP1Q9GZU7 261 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-204ENST00000436289 GNG13Q9P2W3 67 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-204ENST00000436289 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa8.69□□□□□ -1.02
NELFE-204ENST00000436289 PPP1R17O96001 155 aa8.69□□□□□ -1.02
NELFE-204ENST00000436289 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.69□□□□□ -1.02
NELFE-204ENST00000436289 ARPC5O15511 151 aa8.68□□□□□ -1.02
NELFE-204ENST00000436289 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.68□□□□□ -1.02
NELFE-204ENST00000436289 KIR2DL4Q99706 377 aa8.68□□□□□ -1.02
NELFE-204ENST00000436289 TEX46H3BTG2 121 aa8.67□□□□□ -1.02
NELFE-204ENST00000436289 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa8.67□□□□□ -1.02
NELFE-204ENST00000436289 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
NELFE-204ENST00000436289 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
NELFE-204ENST00000436289 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
NELFE-204ENST00000436289 MED9Q9NWA0 146 aa8.67□□□□□ -1.02
NELFE-204ENST00000436289 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa8.66□□□□□ -1.02
NELFE-204ENST00000436289 SMLR1H3BR10 107 aa8.66□□□□□ -1.02
NELFE-204ENST00000436289 BCE1O60756 84 aa8.66□□□□□ -1.02
NELFE-204ENST00000436289 LINC00337Q8N6G1 96 aa8.66□□□□□ -1.02
NELFE-204ENST00000436289 BORCS7Q96B45 105 aa8.66□□□□□ -1.02
NELFE-204ENST00000436289 C22orf24Q9Y442 160 aa8.66□□□□□ -1.02
NELFE-204ENST00000436289 TMEM191AQ9H0A3 160 aa8.65□□□□□ -1.02
NELFE-204ENST00000436289 A8MWL6 223 aa8.64□□□□□ -1.03
NELFE-204ENST00000436289 TCAPO15273 167 aa8.64□□□□□ -1.03
NELFE-204ENST00000436289 Q6ZUT4 128 aa8.64□□□□□ -1.03
NELFE-204ENST00000436289 TP73-AS1Q9UF72 201 aa8.64□□□□□ -1.03
NELFE-204ENST00000436289 ATP6V1G1O75348 118 aa8.63□□□□□ -1.03
NELFE-204ENST00000436289 ZNF345Q14585 488 aa8.63□□□□□ -1.03
NELFE-204ENST00000436289 KIAA0087Q14695 138 aa8.63□□□□□ -1.03
NELFE-204ENST00000436289 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.63□□□□□ -1.03
NELFE-204ENST00000436289 LINC00242Q5T6M2 205 aa8.63□□□□□ -1.03
NELFE-204ENST00000436289 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
NELFE-204ENST00000436289 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.62□□□□□ -1.03
NELFE-204ENST00000436289 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa8.62□□□□□ -1.03
NELFE-204ENST00000436289 PPP1R2P9O14990 202 aa8.62□□□□□ -1.03
NELFE-204ENST00000436289 RAB4AP20338 218 aa8.62□□□□□ -1.03
NELFE-204ENST00000436289 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
NELFE-204ENST00000436289 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
NELFE-204ENST00000436289 ZNF727A8MUV8 499 aa8.61□□□□□ -1.03
NELFE-204ENST00000436289 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
NELFE-204ENST00000436289 HBBP68871 147 aa8.6□□□□□ -1.03
NELFE-204ENST00000436289 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
NELFE-204ENST00000436289 OCC1Q8TAD7 63 aa8.6□□□□□ -1.03
NELFE-204ENST00000436289 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.6□□□□□ -1.03
NELFE-204ENST00000436289 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.6□□□□□ -1.03
NELFE-204ENST00000436289 A0A1B0GUT8 65 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-204ENST00000436289 GATCO43716 136 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
NELFE-204ENST00000436289 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
NELFE-204ENST00000436289 NDUFA5Q16718 116 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-204ENST00000436289 CT83Q5H943 113 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-204ENST00000436289 SPAG11AQ6PDA7 123 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-204ENST00000436289 IFITM10A6NMD0 228 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-204ENST00000436289 K7EN84 100 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-204ENST00000436289 FAM231DQ6ZW35 169 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-204ENST00000436289 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-204ENST00000436289 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-204ENST00000436289 HMSDA8MTL9 139 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-204ENST00000436289 CFC1BP0CG36 223 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-204ENST00000436289 C2orf82Q6UX34 121 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-204ENST00000436289 S100A1P23297 94 aa8.56□□□□□ -1.04
NELFE-204ENST00000436289 AMN1Q8IY45 258 aa8.56□□□□□ -1.04
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NELFE-204ENST00000436289 C20orf78Q9BR46 151 aa8.56□□□□□ -1.04
NELFE-204ENST00000436289 UBE2AP49459 152 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-204ENST00000436289 RPL32P62910 135 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
NELFE-204ENST00000436289 FAM104AQ969W3 186 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-204ENST00000436289 PRSS2P07478 247 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-204ENST00000436289 CKS1BP61024 79 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-204ENST00000436289 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-204ENST00000436289 LINC00862A6NCI5 91 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-204ENST00000436289 HIGD1CA8MV81 97 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-204ENST00000436289 RPL39P62891 51 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
NELFE-204ENST00000436289 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-204ENST00000436289 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-204ENST00000436289 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-204ENST00000436289 SMKR1H3BMG3 65 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-204ENST00000436289 RIGQ13278 110 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-204ENST00000436289 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-204ENST00000436289 AKAP14Q86UN6 197 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-204ENST00000436289 LINC00469Q8N7U9 141 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-204ENST00000436289 LINC00167Q96N53 147 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-204ENST00000436289 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-204ENST00000436289 RPL37AP8A6NKH3 93 aa8.5□□□□□ -1.05
NELFE-204ENST00000436289 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
NELFE-204ENST00000436289 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.5□□□□□ -1.05
NELFE-204ENST00000436289 Q6ZN92 141 aa8.5□□□□□ -1.05
NELFE-204ENST00000436289 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa8.49□□□□□ -1.05
NELFE-204ENST00000436289 Q8IZM0 81 aa8.48□□□□□ -1.05
NELFE-204ENST00000436289 TMEM250H0YL14 139 aa8.47□□□□□ -1.05
NELFE-204ENST00000436289 TNFRSF6BO95407 300 aa8.47□□□□□ -1.05
NELFE-204ENST00000436289 LCE2CQ5TA81 110 aa8.47□□□□□ -1.05
NELFE-204ENST00000436289 F8VRH5 84 aa8.46□□□□□ -1.06
NELFE-204ENST00000436289 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.46□□□□□ -1.06
NELFE-204ENST00000436289 TMEM141Q96I45 108 aa8.46□□□□□ -1.06
NELFE-204ENST00000436289 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
NELFE-204ENST00000436289 TOMM7Q9P0U1 55 aa8.46□□□□□ -1.06
NELFE-204ENST00000436289 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-204ENST00000436289 CKS2P33552 79 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-204ENST00000436289 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
NELFE-204ENST00000436289 TEX43Q6ZNM6 134 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-204ENST00000436289 C2orf88Q9BSF0 95 aa8.45□□□□□ -1.06
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