RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428892.1

APOBEC3C-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

TSL 3

Gene APOBEC3C, Length 1,056 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 Q6ZN92 141 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 TEX43Q6ZNM6 134 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 LINC00173Q6ZV60 143 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 Q8N814 137 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 Q9HAA7 133 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 CYSLTR1Q9Y271 337 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A096LNJ9 63 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 TOMM6Q96B49 74 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 LINC01545Q5VT33 79 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 Q8N976 141 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.18□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 RNF151Q2KHN1 245 aa7.18□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM97Q5BJF2 176 aa7.18□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 ERASQ7Z444 233 aa7.18□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.18□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM141Q96I45 108 aa7.18□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.18□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 PTTG1IPP53801 180 aa7.17□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.17□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 COTL1Q14019 142 aa7.17□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 SPATA45Q537H7 98 aa7.17□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRO1933Q9H354 126 aa7.17□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.16□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 MPV17L2Q567V2 206 aa7.16□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.16□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 ATOH7Q8N100 152 aa7.16□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 TM2D2Q9BX73 214 aa7.16□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A087WX48 190 aa7.15□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.15□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 TSHBP01222 138 aa7.15□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.15□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 TIMM17AQ99595 171 aa7.15□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 KLK12Q9UKR0 248 aa7.15□□□□□ -1.26
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.14□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 DPM2O94777 84 aa7.14□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 ENHOQ6UWT2 76 aa7.14□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 PMCHL2Q9BQD1 86 aa7.14□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.14□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGKCP01834 107 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 NPSP0C0P6 89 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 PLNP26678 52 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 RBX1P62877 108 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 WFDC2Q14508 124 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 PMVKQ15126 192 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRR34Q9NV39 138 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGIPA6NJ69 53 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM262E9PQX1 116 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 F8VRH5 84 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 LECT2O14960 151 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 DDTP30046 118 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 GAGE6Q13070 117 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 BAALCQ8WXS3 180 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 UBE2WQ96B02 151 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 VCX2Q9H322 139 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 HMCN2Q8NDA2 5059 aa7.11□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A1B0GUV1 79 aa7.11□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 hDV102S1A0JD36 115 aa7.11□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 OXTP01178 125 aa7.11□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 Q6ZSA8 131 aa7.11□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 SCXQ7RTU7 201 aa7.11□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM243Q9BU79 118 aa7.11□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.11□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.1□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 UBE2L6O14933 153 aa7.1□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 ANGP03950 147 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 MAJINQ3KP22 176 aa7.1□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.1□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 RMI2Q96E14 147 aa7.1□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 CST9LQ9H4G1 147 aa7.1□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 COX11Q9Y6N1 276 aa7.1□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.09□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 H7C423 109 aa7.09□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGLC3P0DOY3 106 aa7.09□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 MIAQ16674 131 aa7.09□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.09□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 C2orf88Q9BSF0 95 aa7.09□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.09□□□□□ -1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
APOBEC3C-202ENST00000428892 HERVK_113P61574 105 aa7.08□□□□□ -1.28
APOBEC3C-202ENST00000428892 LINC01620Q4KN68 170 aa7.08□□□□□ -1.28
APOBEC3C-202ENST00000428892 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa7.08□□□□□ -1.28
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