RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427658.1

AFG3L1P-208, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,758 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KLKP1	Q107X0	134 aa		7.54	□□□□□ -1.2
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ECSCR	Q19T08	205 aa		7.54	□□□□□ -1.2
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		7.54	□□□□□ -1.2
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TENM4	Q6N022	2769 aa		7.54	□□□□□ -1.2
AFG3L1P-208	ENST00000427658	COPS9	Q8WXC6	57 aa		7.54	□□□□□ -1.2
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		7.53	□□□□□ -1.2
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		7.53	□□□□□ -1.2
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLPI	P03973	132 aa		7.53	□□□□□ -1.2
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SIRPD	Q9H106	197 aa		7.53	□□□□□ -1.2
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		7.52	□□□□□ -1.2
AFG3L1P-208	ENST00000427658	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	COX6A2	Q02221	97 aa		7.52	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		7.52	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KLLN	B2CW77	178 aa		7.52	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		7.52	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		7.52	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		7.51	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LECT2	O14960	151 aa		7.51	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		7.51	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		7.51	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		7.51	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NOTCH2	Q04721	2471 aa		7.51	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		7.51	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		7.51	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		7.51	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CUBN	O60494	3623 aa		7.5	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		7.5	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658		G3V318	75 aa		7.5	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		7.5	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		7.49	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658		A0A1W2PRX2	142 aa		7.49	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CRP	P02741	224 aa		7.49	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PF4	P02776	101 aa		7.49	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		7.49	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658		Q8N6K4	173 aa		7.49	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658		Q9UF83	564 aa		7.49	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		7.49	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		7.49	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IGKV2D-28	P01615	120 aa		7.49	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PROK1	P58294	105 aa		7.49	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PMAIP1	Q13794	54 aa		7.49	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		7.49	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		7.49	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FBN2	P35556	2912 aa		7.49	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		7.48	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		7.48	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		7.48	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ATP6V0E1	O15342	81 aa		7.48	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BLCAP	P62952	87 aa		7.48	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658		Q8N9W7	124 aa		7.48	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658		H0YGX0	51 aa		7.48	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		7.48	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		7.48	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		7.47	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BCE1	O60756	84 aa		7.47	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KLK9	Q2XQG4	91 aa		7.46	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		7.46	□□□□□ -1.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CFHR3	Q02985	330 aa		7.46	□□□□□ -1.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		7.46	□□□□□ -1.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ODF3B	A8MYP8	253 aa		7.45	□□□□□ -1.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		7.45	□□□□□ -1.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		7.45	□□□□□ -1.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCL19	Q99731	98 aa		7.45	□□□□□ -1.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UBL5	Q9BZL1	73 aa		7.45	□□□□□ -1.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ITPR2	Q14571	2701 aa		7.45	□□□□□ -1.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		7.45	□□□□□ -1.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		7.45	□□□□□ -1.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		7.45	□□□□□ -1.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658		Q6ZTI0	123 aa		7.44	□□□□□ -1.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		7.43	□□□□□ -1.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IGKV3-20	P01619	116 aa		7.43	□□□□□ -1.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NDUFC1	O43677	76 aa		7.43	□□□□□ -1.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LY6H	O94772	140 aa		7.43	□□□□□ -1.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		7.43	□□□□□ -1.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		7.42	□□□□□ -1.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RETN	Q9HD89	108 aa		7.42	□□□□□ -1.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		7.42	□□□□□ -1.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		7.42	□□□□□ -1.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658		Q6ZSN1	163 aa		7.42	□□□□□ -1.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MIF	P14174	115 aa		7.41	□□□□□ -1.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SAA4	P35542	130 aa		7.41	□□□□□ -1.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	7.41	□□□□□ -1.22	3e-11	■■■■■ 36.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PRR15	Q8IV56	129 aa		7.41	□□□□□ -1.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		7.41	□□□□□ -1.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		7.4	□□□□□ -1.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DSCR9	P59020	149 aa		7.4	□□□□□ -1.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658		Q96MF0	132 aa		7.4	□□□□□ -1.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ACAN	P16112	2415 aa		7.4	□□□□□ -1.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP10-9	P60411	292 aa		7.4	□□□□□ -1.23

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