RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR5A1Q8NGJ0 315 aa8.18□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CARD19Q96LW7 228 aa8.18□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LPAP08519 4548 aa8.17□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.17□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LOC100996750A0A140TA64 210 aa8.17□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 S100A2P29034 98 aa8.17□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 XCL1P47992 114 aa8.17□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q6ZRP5 223 aa8.17□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIST3H2BBQ8N257 126 aa8.17□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BORCS7Q96B45 105 aa8.17□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa8.17□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.16□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.16□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC00518Q8N0U6 118 aa8.16□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.16□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCL25O15444 150 aa8.15□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HBBP68871 147 aa8.15□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDZD11Q5EBL8 140 aa8.15□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.14□□□□□ -1.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1B0GXF2 115 aa8.14□□□□□ -1.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CAMPP49913 170 aa8.14□□□□□ -1.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMIM15Q7Z3B0 74 aa8.14□□□□□ -1.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM101Q96IK0 257 aa8.14□□□□□ -1.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IFITM10A6NMD0 228 aa8.13□□□□□ -1.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 I3L3M4 83 aa8.13□□□□□ -1.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMIM6P0DI80 62 aa8.13□□□□□ -1.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RIGQ13278 110 aa8.13□□□□□ -1.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.13□□□□□ -1.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1B0GUT8 65 aa8.13□□□□□ -1.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1B0GW15 77 aa8.13□□□□□ -1.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.13□□□□□ -1.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GAS8-AS1O95177 125 aa8.13□□□□□ -1.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTTG1IPP53801 180 aa8.13□□□□□ -1.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SYCNQ0VAF6 134 aa8.13□□□□□ -1.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.12□□□□□ -1.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ESDP10768 282 aa8.12□□□□□ -1.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FABP4P15090 132 aa8.12□□□□□ -1.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PMCHP20382 165 aa8.12□□□□□ -1.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SS18Q15532 418 aa8.12□□□□□ -1.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIAA1644Q3SXP7 199 aa8.12□□□□□ -1.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.12□□□□□ -1.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BAGE3Q86Y29 109 aa8.12□□□□□ -1.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR10D4PQ8NGN7 298 aa8.12□□□□□ -1.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM18Q96B42 140 aa8.12□□□□□ -1.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRAP2Q96G30 205 aa8.12□□□□□ -1.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C12orf57Q99622 126 aa8.12□□□□□ -1.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIST1H2BLQ99880 126 aa8.12□□□□□ -1.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSHBP01222 138 aa8.11□□□□□ -1.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.1□□□□□ -1.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GAGE2BQ13066 116 aa8.1□□□□□ -1.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.1□□□□□ -1.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.08□□□□□ -1.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1W2PNN7 141 aa8.08□□□□□ -1.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERF1AO75920 110 aa8.08□□□□□ -1.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF664Q8N3J9 261 aa8.08□□□□□ -1.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ST20Q9HBF5 79 aa8.08□□□□□ -1.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa8.07□□□□□ -1.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUPR1O60356 82 aa8.06□□□□□ -1.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MALP21145 153 aa8.06□□□□□ -1.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.06□□□□□ -1.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.06□□□□□ -1.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.06□□□□□ -1.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COX7A2LO14548 114 aa8.06□□□□□ -1.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APOMO95445 188 aa8.06□□□□□ -1.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC00310P59036 64 aa8.06□□□□□ -1.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PYY3Q5JQD4 70 aa8.06□□□□□ -1.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1orf137Q5JT78 98 aa8.05□□□□□ -1.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H3BS24 57 aa8.04□□□□□ -1.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C2orf48Q96LS8 159 aa8.04□□□□□ -1.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM191AQ9H0A3 160 aa8.04□□□□□ -1.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.03□□□□□ -1.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSBP1O75506 76 aa8.02□□□□□ -1.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB4AP20338 218 aa8.02□□□□□ -1.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FCER1GP30273 86 aa8.02□□□□□ -1.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.02□□□□□ -1.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa8.01□□□□□ -1.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP1R17O96001 155 aa8.01□□□□□ -1.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPAG11BQ08648 103 aa8.01□□□□□ -1.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.01□□□□□ -1.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C5orf38Q86SI9 138 aa8.01□□□□□ -1.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AMN1Q8IY45 258 aa8.01□□□□□ -1.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCP4L1A6NKN8 68 aa8□□□□□ -1.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VCYO14598 125 aa8□□□□□ -1.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q6ZUT4 128 aa8□□□□□ -1.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ORMDL3Q8N138 153 aa8□□□□□ -1.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRR26Q8N8Z3 221 aa8□□□□□ -1.13
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