RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393193.6

NME1-NME2-202, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 1,021 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-202ENST00000393193 SYCNQ0VAF6 134 aa10.28□□□□□ -0.76
NME1-NME2-202ENST00000393193 Q6ZRU5 148 aa10.28□□□□□ -0.76
NME1-NME2-202ENST00000393193 K7EMI3 77 aa10.27□□□□□ -0.77
NME1-NME2-202ENST00000393193 RAB5AP20339 215 aa10.27□□□□□ -0.77
NME1-NME2-202ENST00000393193 C2orf48Q96LS8 159 aa10.27□□□□□ -0.77
NME1-NME2-202ENST00000393193 IGIPA6NJ69 53 aa10.26□□□□□ -0.77
NME1-NME2-202ENST00000393193 IFITM10A6NMD0 228 aa10.26□□□□□ -0.77
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa10.26□□□□□ -0.77
NME1-NME2-202ENST00000393193 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
NME1-NME2-202ENST00000393193 LINC00242Q5T6M2 205 aa10.26□□□□□ -0.77
NME1-NME2-202ENST00000393193 C2orf66Q6UXQ4 117 aa10.26□□□□□ -0.77
NME1-NME2-202ENST00000393193 AMELXQ99217 191 aa10.26□□□□□ -0.77
NME1-NME2-202ENST00000393193 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa10.25□□□□□ -0.77
NME1-NME2-202ENST00000393193 LINC01546A6NGU7 62 aa10.25□□□□□ -0.77
NME1-NME2-202ENST00000393193 MALP21145 153 aa10.25□□□□□ -0.77
NME1-NME2-202ENST00000393193 KIAA1644Q3SXP7 199 aa10.25□□□□□ -0.77
NME1-NME2-202ENST00000393193 OR10D4PQ8NGN7 298 aa10.25□□□□□ -0.77
NME1-NME2-202ENST00000393193 GNB1LQ9BYB4 327 aa10.25□□□□□ -0.77
NME1-NME2-202ENST00000393193 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
NME1-NME2-202ENST00000393193 NPSP0C0P6 89 aa10.24□□□□□ -0.77
NME1-NME2-202ENST00000393193 UBE2D1P51668 147 aa10.24□□□□□ -0.77
NME1-NME2-202ENST00000393193 MAJINQ3KP22 176 aa10.24□□□□□ -0.77
NME1-NME2-202ENST00000393193 ORMDL2Q53FV1 153 aa10.24□□□□□ -0.77
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa10.24□□□□□ -0.77
NME1-NME2-202ENST00000393193 TMEM141Q96I45 108 aa10.24□□□□□ -0.77
NME1-NME2-202ENST00000393193 CYSLTR1Q9Y271 337 aa10.24□□□□□ -0.77
NME1-NME2-202ENST00000393193 A0A087WZ39 114 aa10.23□□□□□ -0.77
NME1-NME2-202ENST00000393193 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
NME1-NME2-202ENST00000393193 PTTG1IPP53801 180 aa10.23□□□□□ -0.77
NME1-NME2-202ENST00000393193 SPAG11BQ08648 103 aa10.23□□□□□ -0.77
NME1-NME2-202ENST00000393193 KIAA0087Q14695 138 aa10.23□□□□□ -0.77
NME1-NME2-202ENST00000393193 RHEBQ15382 184 aa10.23□□□□□ -0.77
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa10.23□□□□□ -0.77
NME1-NME2-202ENST00000393193 APOMO95445 188 aa10.22□□□□□ -0.77
NME1-NME2-202ENST00000393193 RNF151Q2KHN1 245 aa10.22□□□□□ -0.77
NME1-NME2-202ENST00000393193 STPG4Q8N801 248 aa10.22□□□□□ -0.77
NME1-NME2-202ENST00000393193 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
NME1-NME2-202ENST00000393193 CAMK2N2Q96S95 79 aa10.21□□□□□ -0.77
NME1-NME2-202ENST00000393193 PKIGQ9Y2B9 76 aa10.21□□□□□ -0.77
NME1-NME2-202ENST00000393193 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa10.2□□□□□ -0.78
NME1-NME2-202ENST00000393193 F8WDY8 70 aa10.2□□□□□ -0.78
NME1-NME2-202ENST00000393193 C10orf25Q5T742 122 aa10.2□□□□□ -0.78
NME1-NME2-202ENST00000393193 ORAOV1Q8WV07 137 aa10.2□□□□□ -0.78
NME1-NME2-202ENST00000393193 TOMM6Q96B49 74 aa10.2□□□□□ -0.78
NME1-NME2-202ENST00000393193 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
NME1-NME2-202ENST00000393193 LINC00474Q9P2X8 69 aa10.2□□□□□ -0.78
NME1-NME2-202ENST00000393193 TNXBP22105 4242 aa10.19□□□□□ -0.78
NME1-NME2-202ENST00000393193 OXTP01178 125 aa10.19□□□□□ -0.78
NME1-NME2-202ENST00000393193 S100PP25815 95 aa10.19□□□□□ -0.78
NME1-NME2-202ENST00000393193 COX19Q49B96 90 aa10.19□□□□□ -0.78
NME1-NME2-202ENST00000393193 TEX43Q6ZNM6 134 aa10.19□□□□□ -0.78
NME1-NME2-202ENST00000393193 LINC01561Q8N1V8 128 aa10.19□□□□□ -0.78
NME1-NME2-202ENST00000393193 TIMM17AQ99595 171 aa10.19□□□□□ -0.78
NME1-NME2-202ENST00000393193 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa10.18□□□□□ -0.78
NME1-NME2-202ENST00000393193 MT-ND6P03923 174 aa10.18□□□□□ -0.78
NME1-NME2-202ENST00000393193 DPH3Q96FX2 82 aa10.18□□□□□ -0.78
NME1-NME2-202ENST00000393193 RPS10P5Q9NQ39 176 aa10.18□□□□□ -0.78
NME1-NME2-202ENST00000393193 A0A0J9YXV3 536 aa10.17□□□□□ -0.78
NME1-NME2-202ENST00000393193 A0A1W2PNN7 141 aa10.17□□□□□ -0.78
NME1-NME2-202ENST00000393193 PRR3P79522 188 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
NME1-NME2-202ENST00000393193 C6orf48Q9UBA6 75 aa10.17□□□□□ -0.78
NME1-NME2-202ENST00000393193 TLX1NBP0CAT3 122 aa10.16□□□□□ -0.78
NME1-NME2-202ENST00000393193 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa10.16□□□□□ -0.78
NME1-NME2-202ENST00000393193 YPEL4Q96NS1 127 aa10.16□□□□□ -0.78
NME1-NME2-202ENST00000393193 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
NME1-NME2-202ENST00000393193 J3QL48 77 aa10.15□□□□□ -0.78
NME1-NME2-202ENST00000393193 C7orf33Q8WU49 177 aa10.15□□□□□ -0.78
NME1-NME2-202ENST00000393193 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa10.15□□□□□ -0.78
NME1-NME2-202ENST00000393193 C2orf88Q9BSF0 95 aa10.15□□□□□ -0.78
NME1-NME2-202ENST00000393193 VCX2Q9H322 139 aa10.15□□□□□ -0.78
NME1-NME2-202ENST00000393193 NDUFA1O15239 70 aa10.14□□□□□ -0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 MT1HL1P0DM35 61 aa10.14□□□□□ -0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 GAGE2BQ13066 116 aa10.14□□□□□ -0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 Q6ZN92 141 aa10.14□□□□□ -0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 ERASQ7Z444 233 aa10.14□□□□□ -0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 HMCN2Q8NDA2 5059 aa10.14□□□□□ -0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 A0A096LNJ9 63 aa10.13□□□□□ -0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 G0S2P27469 103 aa10.13□□□□□ -0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 Q6ZRP5 223 aa10.13□□□□□ -0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa10.13□□□□□ -0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 APOC3P02656 99 aa10.12□□□□□ -0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 FABP9Q0Z7S8 132 aa10.12□□□□□ -0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 C2orf82Q6UX34 121 aa10.12□□□□□ -0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa10.11□□□□□ -0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 C18orf32Q8TCD1 76 aa10.11□□□□□ -0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa10.11□□□□□ -0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa10.1□□□□□ -0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa10.1□□□□□ -0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 SVBPQ8N300 66 aa10.1□□□□□ -0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 SCGB3A1Q96QR1 104 aa10.1□□□□□ -0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 LINC01549A6NIU2 74 aa10.09□□□□□ -0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 SNAPINO95295 136 aa10.09□□□□□ -0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 HERVK_113P63121 156 aa10.09□□□□□ -0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP10.09□□□□□ -0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 Q8IZM0 81 aa10.08□□□□□ -0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 CST9LQ9H4G1 147 aa10.08□□□□□ -0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa10.07□□□□□ -0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM168BA1KXE4 195 aa10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms