RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 CHCHD7Q9BUK0 85 aa3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 CDK2AP2O75956 126 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 SPINK8P0C7L1 97 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 MED14OSP0DP75 135 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 IQCJQ1A5X6 159 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 LINC01556Q5JQF7 62 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 SPANXA1Q9NS26 97 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 NPYP01303 97 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00614P0C842 121 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 RPL39P62891 51 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 FAM19A2Q8N3H0 131 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 C20orf78Q9BR46 151 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 GNB1LQ9BYB4 327 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 C1orf137Q5JT78 98 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 COX8CQ7Z4L0 72 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 RAB37Q96AX2 223 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 IFI27L1Q96BM0 104 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 CUBNO60494 3623 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 C5orf52A6NGY3 159 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 GATD1Q8NB37 220 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 FBN3Q75N90 2809 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0J9YXV3 536 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 H3BNG1 76 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 INAFM2P0DMQ5 153 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 UBE2D3P61077 147 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 UBE2D2P62837 147 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 PMCHL1Q16048 86 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 DEFB105AQ8NG35 78 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 FAM19A4Q96LR4 140 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 IGLC6P0CF74 106 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 A0A087WTM6 91 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 HIST1H2BKO60814 126 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 HIST1H2BJP06899 126 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 HIST1H2BOP23527 126 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 HIST1H2BBP33778 126 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 CTRLP40313 264 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 HIST1H2BDP58876 126 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 HIST1H2BCP62807 126 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 HIST2H2BEQ16778 126 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 C9orf153Q5TBE3 101 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 Q6ZUT4 128 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 HIST1H2BHQ93079 126 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 YPEL4Q96NS1 127 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 HIST1H2BNQ99877 126 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 HIST1H2BMQ99879 126 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 DNAL4O96015 105 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 PLNP26678 52 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 Q8N8P6 123 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 M0QY20 66 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 DLEU1O43261 78 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 PRR4Q16378 134 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 PLEKHB2Q96CS7 222 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 VPS25Q9BRG1 176 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 PRO1933Q9H354 126 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 VWFP04275 2813 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 TSPAN13O95857 204 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 REG3GQ6UW15 175 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 CD164L2Q6UWJ8 174 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1B0GXF2 115 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF815PA8K554 130 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 M0R143 59 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 RNF151Q2KHN1 245 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 C20orf203Q8NBC4 194 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 HIST1H4GQ99525 98 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 SNAI2O43623 268 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 DPM2O94777 84 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 ERASQ7Z444 233 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 C11orf72Q8NBR9 251 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 PPDPFQ9H3Y8 114 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 COX6CP09669 75 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 SMIM13P0DJ93 91 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 COX7B2Q8TF08 81 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 FABP2P12104 132 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 ATOH7Q8N100 152 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 NDUFA12Q9UI09 145 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 PLAC8L1A1L4L8 177 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 A8MTW9 85 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 RPL32P62910 135 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 DNLZQ5SXM8 178 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 OR10D4PQ8NGN7 298 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 RPL37AP8A6NKH3 93 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 SERF1AO75920 110 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 NPSP0C0P6 89 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms