RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324659.12

NLRC3-201, Transcript of NLR family CARD domain containing 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NLRC3, Length 3,414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3-201ENST00000324659 BAALC-AS2P0C853 105 aa8.72□□□□□ -1.01
NLRC3-201ENST00000324659 ZNF415Q09FC8 603 aa8.72□□□□□ -1.01
NLRC3-201ENST00000324659 TRACP01848 142 aa8.71□□□□□ -1.01
NLRC3-201ENST00000324659 COX6A2Q02221 97 aa8.71□□□□□ -1.01
NLRC3-201ENST00000324659 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa8.71□□□□□ -1.01
NLRC3-201ENST00000324659 UNC79Q9P2D8 2635 aa8.71□□□□□ -1.01
NLRC3-201ENST00000324659 Q9H8V8 135 aa8.71□□□□□ -1.01
NLRC3-201ENST00000324659 Q9HAA7 133 aa8.71□□□□□ -1.01
NLRC3-201ENST00000324659 PEMTQ9UBM1 199 aa8.71□□□□□ -1.01
NLRC3-201ENST00000324659 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa8.71□□□□□ -1.02
NLRC3-201ENST00000324659 A0A1B0GX51 115 aa8.71□□□□□ -1.02
NLRC3-201ENST00000324659 COX7CP15954 63 aa8.71□□□□□ -1.02
NLRC3-201ENST00000324659 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
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NLRC3-201ENST00000324659 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.7□□□□□ -1.02
NLRC3-201ENST00000324659 ACYP1P07311 99 aa8.69□□□□□ -1.02
NLRC3-201ENST00000324659 STHQ8IWL8 128 aa8.69□□□□□ -1.02
NLRC3-201ENST00000324659 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa8.69□□□□□ -1.02
NLRC3-201ENST00000324659 RNF152Q8N8N0 203 aa8.69□□□□□ -1.02
NLRC3-201ENST00000324659 SMR3AQ99954 134 aa8.69□□□□□ -1.02
NLRC3-201ENST00000324659 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.69□□□□□ -1.02
NLRC3-201ENST00000324659 SPANXCQ9NY87 97 aa8.69□□□□□ -1.02
NLRC3-201ENST00000324659 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
NLRC3-201ENST00000324659 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa8.69□□□□□ -1.02
NLRC3-201ENST00000324659 IMUPQ9GZP8 106 aa8.69□□□□□ -1.02
NLRC3-201ENST00000324659 CYSTM1Q9H1C7 97 aa8.69□□□□□ -1.02
NLRC3-201ENST00000324659 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa8.68□□□□□ -1.02
NLRC3-201ENST00000324659 C4orf26Q17RF5 130 aa8.68□□□□□ -1.02
NLRC3-201ENST00000324659 A0A087WVE0 104 aa8.68□□□□□ -1.02
NLRC3-201ENST00000324659 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa8.68□□□□□ -1.02
NLRC3-201ENST00000324659 TIRAPP58753 221 aa8.68□□□□□ -1.02
NLRC3-201ENST00000324659 MAP6D1Q9H9H5 199 aa8.68□□□□□ -1.02
NLRC3-201ENST00000324659 TMEM89A2RUT3 159 aa8.67□□□□□ -1.02
NLRC3-201ENST00000324659 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
NLRC3-201ENST00000324659 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
NLRC3-201ENST00000324659 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
NLRC3-201ENST00000324659 Q8N2B8 174 aa8.66□□□□□ -1.02
NLRC3-201ENST00000324659 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
NLRC3-201ENST00000324659 DNAL4O96015 105 aa8.66□□□□□ -1.02
NLRC3-201ENST00000324659 PRIMA1Q86XR5 153 aa8.66□□□□□ -1.02
NLRC3-201ENST00000324659 AKAP9Q99996 3911 aa8.66□□□□□ -1.02
NLRC3-201ENST00000324659 C11orf72Q8NBR9 251 aa8.66□□□□□ -1.02
NLRC3-201ENST00000324659 WFDC10AQ9H1F0 79 aa8.66□□□□□ -1.02
NLRC3-201ENST00000324659 CCL24O00175 119 aa8.65□□□□□ -1.02
NLRC3-201ENST00000324659 INSP01308 110 aa8.65□□□□□ -1.02
NLRC3-201ENST00000324659 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.65□□□□□ -1.02
NLRC3-201ENST00000324659 A0A096LNT2 108 aa8.65□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 F5H768 121 aa8.64□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 ATOX1O00244 68 aa8.64□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 LINC00242Q5T6M2 205 aa8.64□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 J3QKU1 62 aa8.64□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 DEFB121Q5J5C9 76 aa8.64□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa8.64□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 NDUFA1O15239 70 aa8.64□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.64□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.64□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 COX7A2LO14548 114 aa8.63□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 Q6ZTI0 123 aa8.63□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 TOMM7Q9P0U1 55 aa8.63□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 DPH3Q96FX2 82 aa8.62□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 ESM1Q9NQ30 184 aa8.62□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 TRGV2A0A075B6R0 118 aa8.61□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 PF4P02776 101 aa8.61□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 SMIM1B2RUZ4 78 aa8.61□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 DEFB114Q30KQ6 69 aa8.61□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 TENM4Q6N022 2769 aa8.61□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 CRYGAP11844 174 aa8.61□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 C2orf48Q96LS8 159 aa8.61□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 FAM218AQ96MZ4 157 aa8.61□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 ATP5G1P05496 136 aa8.6□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 INAFM2P0DMQ5 153 aa8.6□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.6□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 LINC01600Q96MT4 127 aa8.6□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 ODF3L2Q3SX64 289 aa8.6□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa8.6□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 CR1P17927 2039 aa8.6□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 UBE2L6O14933 153 aa8.59□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 C1orf158Q8N1D5 194 aa8.59□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 C4orf3Q8WVX3 66 aa8.59□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 PLA2G2AP14555 144 aa8.59□□□□□ -1.03
NLRC3-201ENST00000324659 F8P00451 2351 aa8.59□□□□□ -1.04
NLRC3-201ENST00000324659 TIMM17BO60830 172 aa8.58□□□□□ -1.04
NLRC3-201ENST00000324659 C5orf38Q86SI9 138 aa8.58□□□□□ -1.04
NLRC3-201ENST00000324659 WFDC9Q8NEX5 89 aa8.58□□□□□ -1.04
NLRC3-201ENST00000324659 BEAN1Q3B7T3 259 aa8.58□□□□□ -1.04
NLRC3-201ENST00000324659 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
NLRC3-201ENST00000324659 K7EQD1 137 aa8.58□□□□□ -1.04
NLRC3-201ENST00000324659 DEFB130BP0DP73 79 aa8.58□□□□□ -1.04
NLRC3-201ENST00000324659 DEFB130AP0DP74 79 aa8.58□□□□□ -1.04
NLRC3-201ENST00000324659 MALP21145 153 aa8.58□□□□□ -1.04
NLRC3-201ENST00000324659 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.57□□□□□ -1.04
NLRC3-201ENST00000324659 OXTP01178 125 aa8.57□□□□□ -1.04
NLRC3-201ENST00000324659 LINC01006Q8NI28 216 aa8.57□□□□□ -1.04
NLRC3-201ENST00000324659 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa8.57□□□□□ -1.04
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