RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 CRPP02741 224 aa10.2□□□□□ -0.78
SPCS1-201ENST00000233025 ANGP03950 147 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
SPCS1-201ENST00000233025 LINC00614P0C842 121 aa10.2□□□□□ -0.78
SPCS1-201ENST00000233025 MRAP2Q96G30 205 aa10.2□□□□□ -0.78
SPCS1-201ENST00000233025 CHCHD5Q9BSY4 110 aa10.2□□□□□ -0.78
SPCS1-201ENST00000233025 MAP1LC3AQ9H492 121 aa10.2□□□□□ -0.78
SPCS1-201ENST00000233025 PRR34Q9NV39 138 aa10.2□□□□□ -0.78
SPCS1-201ENST00000233025 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa10.19□□□□□ -0.78
SPCS1-201ENST00000233025 LINC00310P59036 64 aa10.19□□□□□ -0.78
SPCS1-201ENST00000233025 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP10.19□□□□□ -0.78
SPCS1-201ENST00000233025 PPP1R17O96001 155 aa10.18□□□□□ -0.78
SPCS1-201ENST00000233025 MGPP08493 103 aa10.18□□□□□ -0.78
SPCS1-201ENST00000233025 MIAQ16674 131 aa10.18□□□□□ -0.78
SPCS1-201ENST00000233025 CLPSL2Q6UWE3 100 aa10.18□□□□□ -0.78
SPCS1-201ENST00000233025 F5H697 171 aa10.17□□□□□ -0.78
SPCS1-201ENST00000233025 SMKR1H3BMG3 65 aa10.17□□□□□ -0.78
SPCS1-201ENST00000233025 NCR2O95944 276 aa10.17□□□□□ -0.78
SPCS1-201ENST00000233025 PKIAP61925 76 aa10.17□□□□□ -0.78
SPCS1-201ENST00000233025 RBX1P62877 108 aa10.17□□□□□ -0.78
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM97Q5BJF2 176 aa10.17□□□□□ -0.78
SPCS1-201ENST00000233025 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
SPCS1-201ENST00000233025 AP5S1Q9NUS5 200 aa10.17□□□□□ -0.78
SPCS1-201ENST00000233025 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa10.16□□□□□ -0.78
SPCS1-201ENST00000233025 M0QY20 66 aa10.16□□□□□ -0.78
SPCS1-201ENST00000233025 TNFRSF6BO95407 300 aa10.16□□□□□ -0.78
SPCS1-201ENST00000233025 NPYP01303 97 aa10.16□□□□□ -0.78
SPCS1-201ENST00000233025 GAGE6Q13070 117 aa10.16□□□□□ -0.78
SPCS1-201ENST00000233025 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
SPCS1-201ENST00000233025 SCGB1D1O95968 90 aa10.15□□□□□ -0.78
SPCS1-201ENST00000233025 SLPIP03973 132 aa10.15□□□□□ -0.78
SPCS1-201ENST00000233025 PYY3Q5JQD4 70 aa10.15□□□□□ -0.78
SPCS1-201ENST00000233025 LINC00269Q8N2A0 174 aa10.15□□□□□ -0.78
SPCS1-201ENST00000233025 FAM19A2Q8N3H0 131 aa10.15□□□□□ -0.78
SPCS1-201ENST00000233025 NIT2Q9NQR4 276 aa10.15□□□□□ -0.78
SPCS1-201ENST00000233025 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa10.14□□□□□ -0.79
SPCS1-201ENST00000233025 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
SPCS1-201ENST00000233025 S100A12P80511 92 aa10.14□□□□□ -0.79
SPCS1-201ENST00000233025 SUMO4Q6EEV6 95 aa10.14□□□□□ -0.79
SPCS1-201ENST00000233025 H7C1H1 209 aa10.13□□□□□ -0.79
SPCS1-201ENST00000233025 KRTDAPP60985 99 aa10.13□□□□□ -0.79
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa10.13□□□□□ -0.79
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SPCS1-201ENST00000233025 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa10.12□□□□□ -0.79
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SPCS1-201ENST00000233025 C20orf203Q8NBC4 194 aa10.12□□□□□ -0.79
SPCS1-201ENST00000233025 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa10.12□□□□□ -0.79
SPCS1-201ENST00000233025 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa10.11□□□□□ -0.79
SPCS1-201ENST00000233025 hDV102S1A0JD36 115 aa10.11□□□□□ -0.79
SPCS1-201ENST00000233025 PRSS47A8MTI9 375 aa10.11□□□□□ -0.79
SPCS1-201ENST00000233025 Q8N8P6 123 aa10.11□□□□□ -0.79
SPCS1-201ENST00000233025 C20orf78Q9BR46 151 aa10.11□□□□□ -0.79
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SPCS1-201ENST00000233025 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
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SPCS1-201ENST00000233025 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa10.09□□□□□ -0.79
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SPCS1-201ENST00000233025 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa10.09□□□□□ -0.79
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SPCS1-201ENST00000233025 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa10.08□□□□□ -0.8
SPCS1-201ENST00000233025 C3orf79P0CE67 100 aa10.08□□□□□ -0.8
SPCS1-201ENST00000233025 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
SPCS1-201ENST00000233025 MAJINQ3KP22 176 aa10.08□□□□□ -0.8
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SPCS1-201ENST00000233025 SMIM2Q9BVW6 85 aa10.08□□□□□ -0.8
SPCS1-201ENST00000233025 ST20Q9HBF5 79 aa10.08□□□□□ -0.8
SPCS1-201ENST00000233025 LINC01546A6NGU7 62 aa10.07□□□□□ -0.8
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SPCS1-201ENST00000233025 COX6A2Q02221 97 aa10.07□□□□□ -0.8
SPCS1-201ENST00000233025 STPG4Q8N801 248 aa10.07□□□□□ -0.8
SPCS1-201ENST00000233025 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa10.07□□□□□ -0.8
SPCS1-201ENST00000233025 MUC17Q685J3 4493 aa10.07□□□□□ -0.8
SPCS1-201ENST00000233025 G0S2P27469 103 aa10.06□□□□□ -0.8
SPCS1-201ENST00000233025 FCER1GP30273 86 aa10.06□□□□□ -0.8
SPCS1-201ENST00000233025 RPL32P62910 135 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
SPCS1-201ENST00000233025 PRR4Q16378 134 aa10.06□□□□□ -0.8
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SPCS1-201ENST00000233025 ZNF664Q8N3J9 261 aa10.06□□□□□ -0.8
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SPCS1-201ENST00000233025 LCE3BQ5TA77 95 aa10.05□□□□□ -0.8
SPCS1-201ENST00000233025 Q6ZRP5 223 aa10.05□□□□□ -0.8
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SPCS1-201ENST00000233025 PCP4L1A6NKN8 68 aa10.04□□□□□ -0.8
SPCS1-201ENST00000233025 VCYO14598 125 aa10.04□□□□□ -0.8
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SPCS1-201ENST00000233025 PET117Q6UWS5 81 aa10.04□□□□□ -0.8
SPCS1-201ENST00000233025 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa10.03□□□□□ -0.8
SPCS1-201ENST00000233025 LINC01549A6NIU2 74 aa10.03□□□□□ -0.8
SPCS1-201ENST00000233025 TSTD3H0UI37 97 aa10.03□□□□□ -0.8
SPCS1-201ENST00000233025 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa10.03□□□□□ -0.8
SPCS1-201ENST00000233025 KIR2DL4Q99706 377 aa10.03□□□□□ -0.8
SPCS1-201ENST00000233025 COTL1Q14019 142 aa10.02□□□□□ -0.81
SPCS1-201ENST00000233025 C15orf56Q8N910 161 aa10.02□□□□□ -0.81
SPCS1-201ENST00000233025 VAMP8Q9BV40 100 aa10.02□□□□□ -0.81
SPCS1-201ENST00000233025 ATP5LO75964 103 aa10.01□□□□□ -0.81
SPCS1-201ENST00000233025 TEX43Q6ZNM6 134 aa10.01□□□□□ -0.81
SPCS1-201ENST00000233025 PRR26Q8N8Z3 221 aa10.01□□□□□ -0.81
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