RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000155840.9

KCNQ1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 3,245 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-201ENST00000155840 SPANXCQ9NY87 97 aa12.42□□□□□ -0.42
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KCNQ1-201ENST00000155840 DEFB130AP0DP74 79 aa12.41□□□□□ -0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 C1orf158Q8N1D5 194 aa12.41□□□□□ -0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 YAE1D1Q9NRH1 226 aa12.41□□□□□ -0.42
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KCNQ1-201ENST00000155840 DEFB114Q30KQ6 69 aa12.41□□□□□ -0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa12.41□□□□□ -0.42
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KCNQ1-201ENST00000155840 IGHV4-31P0DP07 118 aa12.35□□□□□ -0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 HERV-K104P63124 156 aa12.35□□□□□ -0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 K7EQD1 137 aa12.35□□□□□ -0.43
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KCNQ1-201ENST00000155840 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa12.33□□□□□ -0.44
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KCNQ1-201ENST00000155840 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa12.32□□□□□ -0.44
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KCNQ1-201ENST00000155840 LINC00526Q96FQ7 95 aa12.29□□□□□ -0.44
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KCNQ1-201ENST00000155840 C6orf226Q5I0X4 101 aa12.26□□□□□ -0.45
KCNQ1-201ENST00000155840 A0A096LNT2 108 aa12.26□□□□□ -0.45
KCNQ1-201ENST00000155840 C9orf153Q5TBE3 101 aa12.26□□□□□ -0.45
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KCNQ1-201ENST00000155840 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa12.25□□□□□ -0.45
KCNQ1-201ENST00000155840 IGKV2D-28P01615 120 aa12.25□□□□□ -0.45
KCNQ1-201ENST00000155840 CCL18P55774 89 aa12.24□□□□□ -0.45
KCNQ1-201ENST00000155840 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
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KCNQ1-201ENST00000155840 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa12.23□□□□□ -0.45
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KCNQ1-201ENST00000155840 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa12.22□□□□□ -0.45
KCNQ1-201ENST00000155840 A8MTW9 85 aa12.22□□□□□ -0.45
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KCNQ1-201ENST00000155840 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
KCNQ1-201ENST00000155840 C22orf24Q9Y442 160 aa12.22□□□□□ -0.45
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KCNQ1-201ENST00000155840 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.46
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KCNQ1-201ENST00000155840 HTN3P15516 51 aa12.2□□□□□ -0.46
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KCNQ1-201ENST00000155840 HIVEP1P15822 2718 aa12.19□□□□□ -0.46
KCNQ1-201ENST00000155840 J3QLI3 93 aa12.18□□□□□ -0.46
KCNQ1-201ENST00000155840 PPDPFQ9H3Y8 114 aa12.18□□□□□ -0.46
KCNQ1-201ENST00000155840 GYPEP15421 78 aa12.17□□□□□ -0.46
KCNQ1-201ENST00000155840 hADV29S1A0JD25 119 aa12.16□□□□□ -0.46
KCNQ1-201ENST00000155840 TENM4Q6N022 2769 aa12.16□□□□□ -0.46
KCNQ1-201ENST00000155840 LINC00482Q8N8I6 264 aa12.16□□□□□ -0.46
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KCNQ1-201ENST00000155840 LINC00846Q9NV44 126 aa12.16□□□□□ -0.46
KCNQ1-201ENST00000155840 TENM1Q9UKZ4 2725 aa12.16□□□□□ -0.46
KCNQ1-201ENST00000155840 DEFB113Q30KQ7 82 aa12.16□□□□□ -0.46
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