RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637671.1

SYNGAP1-223, Transcript of synaptic Ras GTPase activating protein 1, human

TSL 5

Gene SYNGAP1, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SYNGAP1-223	ENST00000637671	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SYNGAP1-223	ENST00000637671	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
SYNGAP1-223	ENST00000637671	SMIM12	Q96EX1	92 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SYNGAP1-223	ENST00000637671	BIN3	Q9NQY0	253 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SYNGAP1-223	ENST00000637671		A0A087WZ39	114 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SYNGAP1-223	ENST00000637671		I3L3M4	83 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SYNGAP1-223	ENST00000637671	COX7A2L	O14548	114 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SYNGAP1-223	ENST00000637671	PMCH	P20382	165 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SYNGAP1-223	ENST00000637671	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
SYNGAP1-223	ENST00000637671	NUP35	Q8NFH5	326 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SYNGAP1-223	ENST00000637671	MRAP2	Q96G30	205 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SYNGAP1-223	ENST00000637671	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SYNGAP1-223	ENST00000637671	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
SYNGAP1-223	ENST00000637671	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		7.09	□□□□□ -1.27
SYNGAP1-223	ENST00000637671	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
SYNGAP1-223	ENST00000637671	C2orf48	Q96LS8	159 aa		7.09	□□□□□ -1.27
SYNGAP1-223	ENST00000637671	CNFN	Q9BYD5	112 aa		7.09	□□□□□ -1.27
SYNGAP1-223	ENST00000637671	GNG13	Q9P2W3	67 aa		7.09	□□□□□ -1.27
SYNGAP1-223	ENST00000637671	BCL2L11	O43521	198 aa		7.08	□□□□□ -1.28
SYNGAP1-223	ENST00000637671	CCL20	P78556	96 aa		7.08	□□□□□ -1.28
SYNGAP1-223	ENST00000637671	FAM210A	Q96ND0	272 aa		7.08	□□□□□ -1.28
SYNGAP1-223	ENST00000637671	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		7.08	□□□□□ -1.28
SYNGAP1-223	ENST00000637671	RAB19	A4D1S5	217 aa		7.07	□□□□□ -1.28
SYNGAP1-223	ENST00000637671	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		7.07	□□□□□ -1.28
SYNGAP1-223	ENST00000637671	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
SYNGAP1-223	ENST00000637671	ESD	P10768	282 aa		7.06	□□□□□ -1.28
SYNGAP1-223	ENST00000637671	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
SYNGAP1-223	ENST00000637671	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
SYNGAP1-223	ENST00000637671	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
SYNGAP1-223	ENST00000637671	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		7.06	□□□□□ -1.28
SYNGAP1-223	ENST00000637671	PDE6D	O43924	150 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SYNGAP1-223	ENST00000637671	TSHB	P01222	138 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SYNGAP1-223	ENST00000637671	SPAG11B	Q08648	103 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SYNGAP1-223	ENST00000637671	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SYNGAP1-223	ENST00000637671	RNF151	Q2KHN1	245 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SYNGAP1-223	ENST00000637671	ST20	Q9HBF5	79 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SYNGAP1-223	ENST00000637671	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SYNGAP1-223	ENST00000637671	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SYNGAP1-223	ENST00000637671		G3V3Q6	166 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SYNGAP1-223	ENST00000637671	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SYNGAP1-223	ENST00000637671	NUDT11	Q96G61	164 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SYNGAP1-223	ENST00000637671	IMMP2L	Q96T52	175 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SYNGAP1-223	ENST00000637671	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SYNGAP1-223	ENST00000637671	TEX46	H3BTG2	121 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SYNGAP1-223	ENST00000637671	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
SYNGAP1-223	ENST00000637671	UBE2B	P63146	152 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SYNGAP1-223	ENST00000637671	ZNF345	Q14585	488 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SYNGAP1-223	ENST00000637671	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
SYNGAP1-223	ENST00000637671	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SYNGAP1-223	ENST00000637671	MED9	Q9NWA0	146 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SYNGAP1-223	ENST00000637671	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
SYNGAP1-223	ENST00000637671	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SYNGAP1-223	ENST00000637671	FAM168B	A1KXE4	195 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SYNGAP1-223	ENST00000637671		F8WDY8	70 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SYNGAP1-223	ENST00000637671	C5orf38	Q86SI9	138 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SYNGAP1-223	ENST00000637671	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
SYNGAP1-223	ENST00000637671	NDUFA1	O15239	70 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SYNGAP1-223	ENST00000637671	FCER1G	P30273	86 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SYNGAP1-223	ENST00000637671	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
SYNGAP1-223	ENST00000637671	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		7	□□□□□ -1.29
SYNGAP1-223	ENST00000637671		M0QXV9	152 aa		7	□□□□□ -1.29
SYNGAP1-223	ENST00000637671	TSPAN13	O95857	204 aa		7	□□□□□ -1.29
SYNGAP1-223	ENST00000637671	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
SYNGAP1-223	ENST00000637671	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		7	□□□□□ -1.29
SYNGAP1-223	ENST00000637671	BORCS7	Q96B45	105 aa		7	□□□□□ -1.29
SYNGAP1-223	ENST00000637671	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
SYNGAP1-223	ENST00000637671	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		6.99	□□□□□ -1.29
SYNGAP1-223	ENST00000637671	GAGE2E	Q4V326	116 aa		6.99	□□□□□ -1.29
SYNGAP1-223	ENST00000637671	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		6.99	□□□□□ -1.29
SYNGAP1-223	ENST00000637671	SMLR1	H3BR10	107 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SYNGAP1-223	ENST00000637671	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SYNGAP1-223	ENST00000637671	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
SYNGAP1-223	ENST00000637671	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SYNGAP1-223	ENST00000637671		A8MWL6	223 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SYNGAP1-223	ENST00000637671	VCY	O14598	125 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SYNGAP1-223	ENST00000637671	TMEM18	Q96B42	140 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SYNGAP1-223	ENST00000637671	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SYNGAP1-223	ENST00000637671		K7EN84	100 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SYNGAP1-223	ENST00000637671	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
SYNGAP1-223	ENST00000637671		Q6ZUT4	128 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SYNGAP1-223	ENST00000637671	OCC1	Q8TAD7	63 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KIR2DL4	Q99706	377 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SYNGAP1-223	ENST00000637671	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SYNGAP1-223	ENST00000637671	HMSD	A8MTL9	139 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SYNGAP1-223	ENST00000637671	ZNF861P	O60384	105 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SYNGAP1-223	ENST00000637671	PPP1R17	O96001	155 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SYNGAP1-223	ENST00000637671	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
SYNGAP1-223	ENST00000637671	C10orf25	Q5T742	122 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SYNGAP1-223	ENST00000637671	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SYNGAP1-223	ENST00000637671	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SYNGAP1-223	ENST00000637671	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SYNGAP1-223	ENST00000637671		A0A1B0GUT8	65 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SYNGAP1-223	ENST00000637671	RAB4A	P20338	218 aa		6.93	□□□□□ -1.3
SYNGAP1-223	ENST00000637671	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
SYNGAP1-223	ENST00000637671	CT83	Q5H943	113 aa		6.93	□□□□□ -1.3
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		6.93	□□□□□ -1.3
SYNGAP1-223	ENST00000637671	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		6.93	□□□□□ -1.3

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