RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635614.1

CD55-211, Transcript of CD55 molecule (Cromer blood group), humanhuman

TSL 5

Gene CD55, Length 1,145 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD55-211ENST00000635614 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.81□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.8□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 S100A8P05109 93 aa6.8□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.8□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.79□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 PRSS47A8MTI9 375 aa6.79□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 PPP1R2P9O14990 202 aa6.79□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 TCAPO15273 167 aa6.79□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.79□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 ISOC2Q96AB3 205 aa6.79□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.79□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.79□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 LINC00862A6NCI5 91 aa6.78□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 VCYO14598 125 aa6.78□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 RAB14P61106 215 aa6.78□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 ADIRFQ15847 76 aa6.78□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.78□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 TMEM18Q96B42 140 aa6.78□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 KIR2DL4Q99706 377 aa6.78□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 HSPG2P98160 4391 aa6.78□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.77□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.77□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 hDV102S1A0JD36 115 aa6.77□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 F8W036 122 aa6.77□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 CCL25O15444 150 aa6.77□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 PRSS1P07477 247 aa6.77□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 RAB4AP20338 218 aa6.77□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 FCER1GP30273 86 aa6.77□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.77□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 NUP35Q8NFH5 326 aa6.77□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.77□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 V9GYV3 84 aa6.77□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 RYR1P21817 5038 aa6.77□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.76□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 A0A1B0GVG6 124 aa6.76□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 FGF6P10767 208 aa6.76□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.76□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.76□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.75□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.75□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.75□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 C7orf77A4D0Y5 90 aa6.75□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 SS18Q15532 418 aa6.75□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 SCXQ7RTU7 201 aa6.75□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 AMN1Q8IY45 258 aa6.75□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.74□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 SCGB1D1O95968 90 aa6.74□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 PPBPP02775 128 aa6.74□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 ESDP10768 282 aa6.74□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 DPH3Q96FX2 82 aa6.74□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 RNF185Q96GF1 192 aa6.74□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 C20orf78Q9BR46 151 aa6.74□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 CKS2P33552 79 aa6.73□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 HBBP68871 147 aa6.73□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 HAMPP81172 84 aa6.73□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 LINC01620Q4KN68 170 aa6.73□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.73□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.73□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.72□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 PHOX2AO14813 284 aa6.72□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 TSHBP01222 138 aa6.72□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 RPS10P46783 165 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 CAMPP49913 170 aa6.72□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.72□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.72□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.72□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.72□□□□□ -1.33
CD55-211ENST00000635614 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.71□□□□□ -1.34
CD55-211ENST00000635614 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.71□□□□□ -1.34
CD55-211ENST00000635614 MT-ND4LP03901 98 aa6.71□□□□□ -1.34
CD55-211ENST00000635614 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.71□□□□□ -1.34
CD55-211ENST00000635614 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.71□□□□□ -1.34
CD55-211ENST00000635614 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.71□□□□□ -1.34
CD55-211ENST00000635614 A0A0A0MQY5 61 aa6.7□□□□□ -1.34
CD55-211ENST00000635614 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.7□□□□□ -1.34
CD55-211ENST00000635614 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CD55-211ENST00000635614 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.7□□□□□ -1.34
CD55-211ENST00000635614 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.7□□□□□ -1.34
CD55-211ENST00000635614 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CD55-211ENST00000635614 C9JQL5 133 aa6.69□□□□□ -1.34
CD55-211ENST00000635614 APOMO95445 188 aa6.69□□□□□ -1.34
CD55-211ENST00000635614 RAB5AP20339 215 aa6.69□□□□□ -1.34
CD55-211ENST00000635614 XCL1P47992 114 aa6.69□□□□□ -1.34
CD55-211ENST00000635614 NRACQ8N912 160 aa6.69□□□□□ -1.34
CD55-211ENST00000635614 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa6.69□□□□□ -1.34
CD55-211ENST00000635614 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100 ms