RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616173.4

MFSD4A-210, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 4A, humanhuman

TSL 5

Gene MFSD4A, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD4A-210ENST00000616173 XKRY2A2RUG3 117 aa6.66□□□□□ -1.34
MFSD4A-210ENST00000616173 SMLR1H3BR10 107 aa6.66□□□□□ -1.34
MFSD4A-210ENST00000616173 APOMO95445 188 aa6.66□□□□□ -1.34
MFSD4A-210ENST00000616173 PMCHP20382 165 aa6.66□□□□□ -1.34
MFSD4A-210ENST00000616173 MALP21145 153 aa6.66□□□□□ -1.34
MFSD4A-210ENST00000616173 CTRLP40313 264 aa6.66□□□□□ -1.34
MFSD4A-210ENST00000616173 CCL20P78556 96 aa6.66□□□□□ -1.34
MFSD4A-210ENST00000616173 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
MFSD4A-210ENST00000616173 C11orf52Q96A22 123 aa6.66□□□□□ -1.34
MFSD4A-210ENST00000616173 ISOC2Q96AB3 205 aa6.66□□□□□ -1.34
MFSD4A-210ENST00000616173 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.66□□□□□ -1.34
MFSD4A-210ENST00000616173 GNG13Q9P2W3 67 aa6.66□□□□□ -1.34
MFSD4A-210ENST00000616173 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.65□□□□□ -1.34
MFSD4A-210ENST00000616173 BCL2L11O43521 198 aa6.65□□□□□ -1.34
MFSD4A-210ENST00000616173 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.65□□□□□ -1.34
MFSD4A-210ENST00000616173 GNG4P50150 75 aa6.65□□□□□ -1.34
MFSD4A-210ENST00000616173 UBE2D1P51668 147 aa6.65□□□□□ -1.34
MFSD4A-210ENST00000616173 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.64□□□□□ -1.35
MFSD4A-210ENST00000616173 A0A1B0GVG6 124 aa6.64□□□□□ -1.35
MFSD4A-210ENST00000616173 TSPAN13O95857 204 aa6.64□□□□□ -1.35
MFSD4A-210ENST00000616173 TSHBP01222 138 aa6.64□□□□□ -1.35
MFSD4A-210ENST00000616173 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
MFSD4A-210ENST00000616173 C9orf62Q8N4C0 152 aa6.64□□□□□ -1.35
MFSD4A-210ENST00000616173 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.64□□□□□ -1.35
MFSD4A-210ENST00000616173 NUDT11Q96G61 164 aa6.64□□□□□ -1.35
MFSD4A-210ENST00000616173 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.64□□□□□ -1.35
MFSD4A-210ENST00000616173 I3L3M4 83 aa6.63□□□□□ -1.35
MFSD4A-210ENST00000616173 COX7A2LO14548 114 aa6.63□□□□□ -1.35
MFSD4A-210ENST00000616173 ESDP10768 282 aa6.63□□□□□ -1.35
MFSD4A-210ENST00000616173 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
MFSD4A-210ENST00000616173 C5orf38Q86SI9 138 aa6.63□□□□□ -1.35
MFSD4A-210ENST00000616173 MRAP2Q96G30 205 aa6.63□□□□□ -1.35
MFSD4A-210ENST00000616173 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
MFSD4A-210ENST00000616173 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.62□□□□□ -1.35
MFSD4A-210ENST00000616173 UMAD1C9J7I0 102 aa6.62□□□□□ -1.35
MFSD4A-210ENST00000616173 CNFNQ9BYD5 112 aa6.62□□□□□ -1.35
MFSD4A-210ENST00000616173 MANBALQ9NQG1 85 aa6.62□□□□□ -1.35
MFSD4A-210ENST00000616173 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.61□□□□□ -1.35
MFSD4A-210ENST00000616173 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa6.61□□□□□ -1.35
MFSD4A-210ENST00000616173 SPAG11BQ08648 103 aa6.61□□□□□ -1.35
MFSD4A-210ENST00000616173 C2orf48Q96LS8 159 aa6.61□□□□□ -1.35
MFSD4A-210ENST00000616173 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
MFSD4A-210ENST00000616173 C7orf77A4D0Y5 90 aa6.6□□□□□ -1.35
MFSD4A-210ENST00000616173 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.6□□□□□ -1.35
MFSD4A-210ENST00000616173 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
MFSD4A-210ENST00000616173 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.59□□□□□ -1.35
MFSD4A-210ENST00000616173 K7EN84 100 aa6.59□□□□□ -1.35
MFSD4A-210ENST00000616173 UBE2BP63146 152 aa6.59□□□□□ -1.35
MFSD4A-210ENST00000616173 GAGE2EQ4V326 116 aa6.59□□□□□ -1.35
MFSD4A-210ENST00000616173 C10orf25Q5T742 122 aa6.59□□□□□ -1.35
MFSD4A-210ENST00000616173 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.59□□□□□ -1.35
MFSD4A-210ENST00000616173 SMIM12Q96EX1 92 aa6.59□□□□□ -1.35
MFSD4A-210ENST00000616173 ST20Q9HBF5 79 aa6.59□□□□□ -1.35
MFSD4A-210ENST00000616173 MED9Q9NWA0 146 aa6.59□□□□□ -1.35
MFSD4A-210ENST00000616173 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.59□□□□□ -1.35
MFSD4A-210ENST00000616173 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.58□□□□□ -1.36
MFSD4A-210ENST00000616173 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
MFSD4A-210ENST00000616173 TEX261Q6UWH6 196 aa6.58□□□□□ -1.36
MFSD4A-210ENST00000616173 Q6ZUT4 128 aa6.58□□□□□ -1.36
MFSD4A-210ENST00000616173 BIN3Q9NQY0 253 aa6.58□□□□□ -1.36
MFSD4A-210ENST00000616173 M0QXV9 152 aa6.57□□□□□ -1.36
MFSD4A-210ENST00000616173 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
MFSD4A-210ENST00000616173 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.57□□□□□ -1.36
MFSD4A-210ENST00000616173 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.57□□□□□ -1.36
MFSD4A-210ENST00000616173 SMKR1H3BMG3 65 aa6.56□□□□□ -1.36
MFSD4A-210ENST00000616173 ZNF345Q14585 488 aa6.56□□□□□ -1.36
MFSD4A-210ENST00000616173 RNF151Q2KHN1 245 aa6.56□□□□□ -1.36
MFSD4A-210ENST00000616173 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.56□□□□□ -1.36
MFSD4A-210ENST00000616173 OCC1Q8TAD7 63 aa6.56□□□□□ -1.36
MFSD4A-210ENST00000616173 TSKUQ8WUA8 353 aa6.56□□□□□ -1.36
MFSD4A-210ENST00000616173 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.56□□□□□ -1.36
MFSD4A-210ENST00000616173 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.56□□□□□ -1.36
MFSD4A-210ENST00000616173 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa6.55□□□□□ -1.36
MFSD4A-210ENST00000616173 PDE6DO43924 150 aa6.55□□□□□ -1.36
MFSD4A-210ENST00000616173 IMMP2LQ96T52 175 aa6.55□□□□□ -1.36
MFSD4A-210ENST00000616173 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
MFSD4A-210ENST00000616173 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.54□□□□□ -1.36
MFSD4A-210ENST00000616173 NDUFA1O15239 70 aa6.54□□□□□ -1.36
MFSD4A-210ENST00000616173 FCER1GP30273 86 aa6.54□□□□□ -1.36
MFSD4A-210ENST00000616173 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.54□□□□□ -1.36
MFSD4A-210ENST00000616173 A0A087X002 238 aa6.53□□□□□ -1.36
MFSD4A-210ENST00000616173 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
MFSD4A-210ENST00000616173 AMN1Q8IY45 258 aa6.53□□□□□ -1.36
MFSD4A-210ENST00000616173 SMDT1Q9H4I9 107 aa6.53□□□□□ -1.36
MFSD4A-210ENST00000616173 MUC17Q685J3 4493 aa6.53□□□□□ -1.36
MFSD4A-210ENST00000616173 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD4A-210ENST00000616173 RAB4AP20338 218 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD4A-210ENST00000616173 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
MFSD4A-210ENST00000616173 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
MFSD4A-210ENST00000616173 A8MWL6 223 aa6.51□□□□□ -1.37
MFSD4A-210ENST00000616173 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
MFSD4A-210ENST00000616173 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
MFSD4A-210ENST00000616173 AKAP14Q86UN6 197 aa6.51□□□□□ -1.37
MFSD4A-210ENST00000616173 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.5□□□□□ -1.37
MFSD4A-210ENST00000616173 HMSDA8MTL9 139 aa6.5□□□□□ -1.37
MFSD4A-210ENST00000616173 TEX46H3BTG2 121 aa6.5□□□□□ -1.37
MFSD4A-210ENST00000616173 VCYO14598 125 aa6.5□□□□□ -1.37
MFSD4A-210ENST00000616173 ZNF861PO60384 105 aa6.5□□□□□ -1.37
MFSD4A-210ENST00000616173 C2orf82Q6UX34 121 aa6.5□□□□□ -1.37
MFSD4A-210ENST00000616173 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms