RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589631.5

GIPC1-211, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3

Gene GIPC1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-211ENST00000589631 C7orf77A4D0Y5 90 aa12.96□□□□□ -0.33
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GIPC1-211ENST00000589631 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa12.96□□□□□ -0.33
GIPC1-211ENST00000589631 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.34
GIPC1-211ENST00000589631 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa12.95□□□□□ -0.34
GIPC1-211ENST00000589631 KIR2DL4Q99706 377 aa12.95□□□□□ -0.34
GIPC1-211ENST00000589631 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
GIPC1-211ENST00000589631 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa12.94□□□□□ -0.34
GIPC1-211ENST00000589631 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa12.94□□□□□ -0.34
GIPC1-211ENST00000589631 S100A8P05109 93 aa12.94□□□□□ -0.34
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GIPC1-211ENST00000589631 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
GIPC1-211ENST00000589631 C20orf78Q9BR46 151 aa12.94□□□□□ -0.34
GIPC1-211ENST00000589631 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF664Q8N3J9 261 aa12.93□□□□□ -0.34
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GIPC1-211ENST00000589631 SMAGPQ0VAQ4 97 aa12.92□□□□□ -0.34
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GIPC1-211ENST00000589631 SS18Q15532 418 aa12.91□□□□□ -0.34
GIPC1-211ENST00000589631 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
GIPC1-211ENST00000589631 XCL1P47992 114 aa12.9□□□□□ -0.34
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GIPC1-211ENST00000589631 CD164L2Q6UWJ8 174 aa12.89□□□□□ -0.35
GIPC1-211ENST00000589631 TMEM18Q96B42 140 aa12.89□□□□□ -0.35
GIPC1-211ENST00000589631 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa12.89□□□□□ -0.35
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GIPC1-211ENST00000589631 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa12.88□□□□□ -0.35
GIPC1-211ENST00000589631 TIMM21Q9BVV7 248 aa12.88□□□□□ -0.35
GIPC1-211ENST00000589631 MYCBP2O75592 4640 aa12.87□□□□□ -0.35
GIPC1-211ENST00000589631 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa12.87□□□□□ -0.35
GIPC1-211ENST00000589631 D6R8Y8 96 aa12.87□□□□□ -0.35
GIPC1-211ENST00000589631 PHOX2AO14813 284 aa12.87□□□□□ -0.35
GIPC1-211ENST00000589631 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
GIPC1-211ENST00000589631 C1orf196B1AJZ1 125 aa12.86□□□□□ -0.35
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GIPC1-211ENST00000589631 SMIM2Q9BVW6 85 aa12.86□□□□□ -0.35
GIPC1-211ENST00000589631 SPACA4Q8TDM5 124 aa12.85□□□□□ -0.35
GIPC1-211ENST00000589631 ANAPC16Q96DE5 110 aa12.85□□□□□ -0.35
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GIPC1-211ENST00000589631 TMEM136Q6ZRR5 245 aa12.81□□□□□ -0.36
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GIPC1-211ENST00000589631 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa12.8□□□□□ -0.36
GIPC1-211ENST00000589631 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
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GIPC1-211ENST00000589631 COX7A2LO14548 114 aa12.79□□□□□ -0.36
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GIPC1-211ENST00000589631 LINC00474Q9P2X8 69 aa12.76□□□□□ -0.37
GIPC1-211ENST00000589631 A0A096LNI7 61 aa12.75□□□□□ -0.37
GIPC1-211ENST00000589631 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa12.75□□□□□ -0.37
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GIPC1-211ENST00000589631 STPG4Q8N801 248 aa12.73□□□□□ -0.37
GIPC1-211ENST00000589631 IMMP2LQ96T52 175 aa12.73□□□□□ -0.37
GIPC1-211ENST00000589631 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
GIPC1-211ENST00000589631 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa12.73□□□□□ -0.37
GIPC1-211ENST00000589631 C7orf33Q8WU49 177 aa12.72□□□□□ -0.37
GIPC1-211ENST00000589631 C2orf48Q96LS8 159 aa12.72□□□□□ -0.37
GIPC1-211ENST00000589631 MAP1LC3AQ9H492 121 aa12.72□□□□□ -0.37
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