RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 CRYGDP07320 174 aa5.86□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 Q6ZS46 218 aa5.86□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 NEGR1Q7Z3B1 354 aa5.86□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 WFDC3Q8IUB2 231 aa5.86□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 RNF183Q96D59 192 aa5.86□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 TIMM21Q9BVV7 248 aa5.86□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa5.86□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.86□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 LRP2P98164 4655 aa5.86□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa5.85□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 FXYD7P58549 80 aa5.85□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 FHL3Q13643 280 aa5.85□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 SPINK13Q1W4C9 94 aa5.85□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 FAM74A4Q5TZK3 123 aa5.85□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 ZNF479Q96JC4 524 aa5.85□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 DUX3Q96PT4 197 aa5.85□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa5.84□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 LEPROTO15243 131 aa5.84□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 CDK2AP2O75956 126 aa5.84□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 DEFB131AP59861 70 aa5.84□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 RRN3P1Q2M238 152 aa5.84□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 C12orf74Q32Q52 190 aa5.84□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 TMEM95Q3KNT9 176 aa5.84□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 LCNL1Q6ZST4 164 aa5.84□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 PPDPFQ9H3Y8 114 aa5.84□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa5.83□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 A0A087WWL8 130 aa5.83□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 H7C423 109 aa5.83□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 J3QQQ9 107 aa5.83□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 TSHBP01222 138 aa5.83□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 IGHV3-53P01767 116 aa5.83□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 PF4P02776 101 aa5.83□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 FXYD2P54710 66 aa5.83□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 TCTAP57738 103 aa5.83□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 COTL1Q14019 142 aa5.83□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 DEFB114Q30KQ6 69 aa5.83□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 TMEM170BQ5T4T1 132 aa5.83□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 STHQ8IWL8 128 aa5.83□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 SLC25A29Q8N8R3 303 aa5.83□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa5.83□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa5.83□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 MAP6D1Q9H9H5 199 aa5.83□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 A0A0J9YXY3 114 aa5.82□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa5.82□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 IGLL5B9A064 214 aa5.82□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 M0QXV9 152 aa5.82□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 TIMM17BO60830 172 aa5.82□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 UBE2D1P51668 147 aa5.82□□□□□ -1.48
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GGA3-218ENST00000584243 SFTA2Q6UW10 78 aa5.82□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 TMEM61Q8N0U2 210 aa5.82□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 AMELXQ99217 191 aa5.82□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 VPS25Q9BRG1 176 aa5.82□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa5.81□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 A0A0B4J2C4 111 aa5.81□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 A0A0J9YY99 117 aa5.81□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 TMEM223A0PJW6 202 aa5.81□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 RS1O15537 224 aa5.81□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 INAFM2P0DMQ5 153 aa5.81□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 IFITM1P13164 125 aa5.81□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa5.81□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 LINC01587Q99440 93 aa5.81□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa5.8□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 SLURP1P55000 103 aa5.8□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 TIRAPP58753 221 aa5.8□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 HERVK_113P63121 156 aa5.8□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 GAGE13Q4V321 117 aa5.8□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 CFAP126Q5VTH2 177 aa5.8□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 Q6ZQT7 251 aa5.8□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 LINC00336Q6ZUF6 198 aa5.8□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 RAB37Q96AX2 223 aa5.8□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 C16orf74Q96GX8 76 aa5.8□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 TRAV4A0A0B4J268 109 aa5.79□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 CCL24O00175 119 aa5.79□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 IGKV3-20P01619 116 aa5.79□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 SCGB1A1P11684 91 aa5.79□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 TNP2Q05952 138 aa5.79□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa5.79□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 C10orf126Q8N4M7 172 aa5.79□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 C11orf72Q8NBR9 251 aa5.79□□□□□ -1.48
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