RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 C11orf86A6NJI1 115 aa2.04□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 SMIM1B2RUZ4 78 aa2.04□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 BPY2O14599 106 aa2.04□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 PSCAO43653 123 aa2.04□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 SPINK4O60575 86 aa2.04□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 TFF1P04155 84 aa2.04□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 COX6B1P14854 86 aa2.04□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 CD24P25063 80 aa2.04□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 Q1RN00 199 aa2.04□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 LYZL1Q6UWQ5 148 aa2.04□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 Q6ZR03 302 aa2.04□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 LINC01560Q8TB33 94 aa2.04□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 S4R3C0 116 aa2.04□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 A0A087WVE0 104 aa2.03□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa2.03□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 A0A0J9YX75 114 aa2.03□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 A0A0J9YY99 117 aa2.03□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa2.03□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa2.03□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 C10orf142B7Z368 130 aa2.03□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 LOC730098B7Z3J9 87 aa2.03□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 F8VRH5 84 aa2.03□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 PPP1R17O96001 155 aa2.03□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 DNAL4O96015 105 aa2.03□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 LHBP01229 141 aa2.03□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 IGHV1-46P01743 117 aa2.03□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 ARL14EPLP0DKL9 152 aa2.03□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 DEFA4P12838 97 aa2.03□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 MIR22HGQ0VDD5 57 aa2.03□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 LINC01590Q5TEZ4 76 aa2.03□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 Q6ZQT0 140 aa2.03□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 C1orf64Q8NEQ6 169 aa2.03□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 IMMP1LQ96LU5 166 aa2.03□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa2.03□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 C14orf132Q9NPU4 83 aa2.03□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 SPTBP11277 2137 aa2.03□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa2.02□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 ABCA7Q8IZY2 2146 aa2.02□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa2.02□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa2.02□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa2.02□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa2.02□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1B0GUT8 65 aa2.02□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 A6NDX4 124 aa2.02□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 PMS2P5A8MQ11 134 aa2.02□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 A8MU10 97 aa2.02□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 HMGN4O00479 90 aa2.02□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 CISD3P0C7P0 127 aa2.02□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 BAALC-AS2P0C853 105 aa2.02□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 FXYD3Q14802 87 aa2.02□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 Q8N9W7 124 aa2.02□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM254Q8TBM7 123 aa2.02□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 C22orf24Q9Y442 160 aa2.02□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP2.02□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 ICOSQ9Y6W8 199 aa2.02□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa2.02□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 MUC4Q99102 2169 aa2.02□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 TET1Q8NFU7 2136 aa2.02□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 A0A087WSZ3 146 aa2.01□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 TRAV40A0A0B4J280 105 aa2.01□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1B0GVX0 72 aa2.01□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 PRAC2D3DTV9 90 aa2.01□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 H7C2G1 150 aa2.01□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 CLPSP04118 112 aa2.01□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP10-8P60410 259 aa2.01□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 NNATQ16517 81 aa2.01□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 FAM27BQ5VT28 67 aa2.01□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa2.01□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 PRR15LQ9BU68 103 aa2.01□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 MYO7BQ6PIF6 2116 aa2□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa2□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa2□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 C17orf98A8MV24 154 aa2□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 H3BPC8 53 aa2□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 M0R135 149 aa2□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 IGKV3-11P04433 115 aa2□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 DNAH10OSP0CZ25 163 aa2□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 FAM74A4Q5TZK3 123 aa2□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 SMIM29Q86T20 159 aa2□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 Q8NBF4 154 aa2□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 LINC01006Q8NI28 216 aa2□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 MUC7Q8TAX7 377 aa2□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa2□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa2□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 ORMDL1Q9P0S3 153 aa2□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 FAM215AQ9Y5M1 114 aa2□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 R4GMQ9 66 aa2□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF831Q5JPB2 1677 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 SVILO95425 2214 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa1.99□□□□□ -2.09
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