RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576589.1

NOMO3-217, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

TSL 5

Gene NOMO3, Length 683 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-217ENST00000576589 TMEM136Q6ZRR5 245 aa18.41■□□□□ 0.54
NOMO3-217ENST00000576589 IMMP2LQ96T52 175 aa18.41■□□□□ 0.54
NOMO3-217ENST00000576589 PRSS1P07477 247 aa18.4■□□□□ 0.54
NOMO3-217ENST00000576589 LINC01620Q4KN68 170 aa18.4■□□□□ 0.54
NOMO3-217ENST00000576589 SMIM2Q9BVW6 85 aa18.4■□□□□ 0.54
NOMO3-217ENST00000576589 GAGE12HA6NDE8 117 aa18.38■□□□□ 0.53
NOMO3-217ENST00000576589 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa18.38■□□□□ 0.53
NOMO3-217ENST00000576589 PRELID3AQ96N28 172 aa18.38■□□□□ 0.53
NOMO3-217ENST00000576589 FAM30AQ9NZY2 134 aa18.38■□□□□ 0.53
NOMO3-217ENST00000576589 TCAPO15273 167 aa18.37■□□□□ 0.53
NOMO3-217ENST00000576589 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
NOMO3-217ENST00000576589 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa18.37■□□□□ 0.53
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NOMO3-217ENST00000576589 ZNF664Q8N3J9 261 aa18.36■□□□□ 0.53
NOMO3-217ENST00000576589 CLRN3Q8NCR9 226 aa18.36■□□□□ 0.53
NOMO3-217ENST00000576589 HAMPP81172 84 aa18.35■□□□□ 0.53
NOMO3-217ENST00000576589 TMEM18Q96B42 140 aa18.35■□□□□ 0.53
NOMO3-217ENST00000576589 EPM2AB3EWF7 344 aa18.34■□□□□ 0.53
NOMO3-217ENST00000576589 C10orf91Q5T1B1 145 aa18.34■□□□□ 0.53
NOMO3-217ENST00000576589 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa18.34■□□□□ 0.53
NOMO3-217ENST00000576589 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
NOMO3-217ENST00000576589 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa18.33■□□□□ 0.52
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NOMO3-217ENST00000576589 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa18.32■□□□□ 0.52
NOMO3-217ENST00000576589 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
NOMO3-217ENST00000576589 HERC1Q15751 4861 aa18.31■□□□□ 0.52
NOMO3-217ENST00000576589 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa18.3■□□□□ 0.52
NOMO3-217ENST00000576589 XCL1P47992 114 aa18.3■□□□□ 0.52
NOMO3-217ENST00000576589 SS18Q15532 418 aa18.3■□□□□ 0.52
NOMO3-217ENST00000576589 Q6ZSA8 131 aa18.3■□□□□ 0.52
NOMO3-217ENST00000576589 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa18.29■□□□□ 0.52
NOMO3-217ENST00000576589 CCL25O15444 150 aa18.29■□□□□ 0.52
NOMO3-217ENST00000576589 S100PP25815 95 aa18.29■□□□□ 0.52
NOMO3-217ENST00000576589 CFAP161Q6P656 301 aa18.29■□□□□ 0.52
NOMO3-217ENST00000576589 TIMM21Q9BVV7 248 aa18.29■□□□□ 0.52
NOMO3-217ENST00000576589 MAP1LC3AQ9H492 121 aa18.29■□□□□ 0.52
NOMO3-217ENST00000576589 RAB5AP20339 215 aa18.28■□□□□ 0.52
NOMO3-217ENST00000576589 RPL39P62891 51 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
NOMO3-217ENST00000576589 FOXI1Q12951 378 aa18.28■□□□□ 0.52
NOMO3-217ENST00000576589 PRSS47A8MTI9 375 aa18.27■□□□□ 0.52
NOMO3-217ENST00000576589 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
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NOMO3-217ENST00000576589 AP5S1Q9NUS5 200 aa18.27■□□□□ 0.52
NOMO3-217ENST00000576589 RHEBQ15382 184 aa18.26■□□□□ 0.51
NOMO3-217ENST00000576589 Q6ZUT4 128 aa18.26■□□□□ 0.51
NOMO3-217ENST00000576589 C15orf56Q8N910 161 aa18.26■□□□□ 0.51
NOMO3-217ENST00000576589 RPS10P5Q9NQ39 176 aa18.26■□□□□ 0.51
NOMO3-217ENST00000576589 C9orf163Q8N9P6 203 aa18.25■□□□□ 0.51
NOMO3-217ENST00000576589 DNAH8Q96JB1 4490 aa18.25■□□□□ 0.51
NOMO3-217ENST00000576589 INAFM2P0DMQ5 153 aa18.23■□□□□ 0.51
NOMO3-217ENST00000576589 CNBPP62633 177 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
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NOMO3-217ENST00000576589 CD164L2Q6UWJ8 174 aa18.22■□□□□ 0.51
NOMO3-217ENST00000576589 Q8N8P6 123 aa18.22■□□□□ 0.51
NOMO3-217ENST00000576589 FAT1Q14517 4588 aa18.22■□□□□ 0.51
NOMO3-217ENST00000576589 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa18.21■□□□□ 0.51
NOMO3-217ENST00000576589 C1orf196B1AJZ1 125 aa18.21■□□□□ 0.51
NOMO3-217ENST00000576589 SLPIP03973 132 aa18.21■□□□□ 0.51
NOMO3-217ENST00000576589 HIGD2BQ4VC39 106 aa18.21■□□□□ 0.51
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NOMO3-217ENST00000576589 Q5VSD8 79 aa18.19■□□□□ 0.5
NOMO3-217ENST00000576589 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
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NOMO3-217ENST00000576589 APOC3P02656 99 aa18.18■□□□□ 0.5
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NOMO3-217ENST00000576589 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa18.13■□□□□ 0.49
NOMO3-217ENST00000576589 ORMDL2Q53FV1 153 aa18.13■□□□□ 0.49
NOMO3-217ENST00000576589 SVBPQ8N300 66 aa18.13■□□□□ 0.49
NOMO3-217ENST00000576589 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa18.13■□□□□ 0.49
NOMO3-217ENST00000576589 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa18.12■□□□□ 0.49
NOMO3-217ENST00000576589 K7EMI3 77 aa18.12■□□□□ 0.49
NOMO3-217ENST00000576589 COX7A2LO14548 114 aa18.12■□□□□ 0.49
NOMO3-217ENST00000576589 SNAPINO95295 136 aa18.12■□□□□ 0.49
NOMO3-217ENST00000576589 CYSLTR1Q9Y271 337 aa18.12■□□□□ 0.49
NOMO3-217ENST00000576589 MALP21145 153 aa18.11■□□□□ 0.49
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NOMO3-217ENST00000576589 C5orf38Q86SI9 138 aa18.09■□□□□ 0.49
NOMO3-217ENST00000576589 LINC00526Q96FQ7 95 aa18.09■□□□□ 0.49
NOMO3-217ENST00000576589 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
NOMO3-217ENST00000576589 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
NOMO3-217ENST00000576589 FABP9Q0Z7S8 132 aa18.08■□□□□ 0.48
NOMO3-217ENST00000576589 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
NOMO3-217ENST00000576589 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa18.07■□□□□ 0.48
NOMO3-217ENST00000576589 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa18.07■□□□□ 0.48
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