RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	APCS	P02743	223 aa		6.07	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	RAB4A	P20338	218 aa		6.07	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		6.07	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		6.07	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	ST20	Q9HBF5	79 aa		6.07	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		6.07	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		6.07	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		6.06	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	RIG	Q13278	110 aa		6.06	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	CFAP161	Q6P656	301 aa		6.06	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		6.06	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	BTF3L4	Q96K17	158 aa		6.06	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		6.06	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479		J3QL48	77 aa		6.05	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	GAS8-AS1	O95177	125 aa		6.05	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	FGF6	P10767	208 aa		6.05	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	NUP35	Q8NFH5	326 aa		6.05	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	ISOC2	Q96AB3	205 aa		6.05	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	DPH3	Q96FX2	82 aa		6.05	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	MRAP2	Q96G30	205 aa		6.05	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	RNF185	Q96GF1	192 aa		6.05	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM101	Q96IK0	257 aa		6.05	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479		V9GYV3	84 aa		6.05	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		6.04	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	AMN1	Q8IY45	258 aa		6.04	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		6.04	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		6.04	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		6.03	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479		C9JQL5	133 aa		6.03	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	VCY	O14598	125 aa		6.03	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	PPP1R17	O96001	155 aa		6.03	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	TSHB	P01222	138 aa		6.03	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	SLPI	P03973	132 aa		6.03	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	ESD	P10768	282 aa		6.03	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	ADIRF	Q15847	76 aa		6.03	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		6.03	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		6.03	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	NAT8	Q9UHE5	227 aa		6.03	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		6.03	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		6.02	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479		A6NJY4	79 aa		6.02	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	DDT	P30046	118 aa		6.02	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	NDUFA6	P56556	154 aa		6.02	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	C15orf56	Q8N910	161 aa		6.02	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	YPEL4	Q96NS1	127 aa		6.02	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		6.01	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		6.01	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	SMKR1	H3BMG3	65 aa		6.01	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	PANO1	I0J062	215 aa		6.01	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	FCER1G	P30273	86 aa		6.01	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	CAMP	P49913	170 aa		6.01	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	SS18	Q15532	418 aa		6.01	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		6.01	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	PYY3	Q5JQD4	70 aa		6.01	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		6.01	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	CCL25	O15444	150 aa		6	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	XCL1	P47992	114 aa		6	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		6	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	FOXI1	Q12951	378 aa		6	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		6	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		6	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		6	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	NRAC	Q8N912	160 aa		6	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		6	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	KIR2DL4	Q99706	377 aa		6	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	6	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A087WYN8	130 aa		5.99	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A1B0GW15	77 aa		5.99	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	CHTF8	P0CG12	524 aa		5.99	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	COX6A2	Q02221	97 aa		5.99	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	C14orf144	Q96I85	54 aa		5.99	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	HERC1	Q15751	4861 aa		5.98	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	MYCBP2	O75592	4640 aa		5.98	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		5.98	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	HIST1H2BK	O60814	126 aa		5.98	□□□□□ -1.45
KIFC3-231	ENST00000567479	OXT	P01178	125 aa		5.98	□□□□□ -1.45

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