RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556356.1

LRP1-211, Transcript of LDL receptor related protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene LRP1, Length 5,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1-211ENST00000556356 RNF185Q96GF1 192 aa11.16□□□□□ -0.62
LRP1-211ENST00000556356 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa11.16□□□□□ -0.62
LRP1-211ENST00000556356 UFSP1Q6NVU6 142 aa11.16□□□□□ -0.62
LRP1-211ENST00000556356 DSCR8Q96T75 97 aa11.16□□□□□ -0.62
LRP1-211ENST00000556356 POLQO75417 2590 aa11.15□□□□□ -0.62
LRP1-211ENST00000556356 K7ERJ3 54 aa11.15□□□□□ -0.62
LRP1-211ENST00000556356 MIAQ16674 131 aa11.15□□□□□ -0.62
LRP1-211ENST00000556356 NCR3O14931 201 aa11.15□□□□□ -0.62
LRP1-211ENST00000556356 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa11.15□□□□□ -0.62
LRP1-211ENST00000556356 DAND5Q8N907 189 aa11.15□□□□□ -0.62
LRP1-211ENST00000556356 CLUHP3Q96NS8 147 aa11.15□□□□□ -0.63
LRP1-211ENST00000556356 C2CD3Q4AC94 2353 aa11.14□□□□□ -0.63
LRP1-211ENST00000556356 RBX1P62877 108 aa11.14□□□□□ -0.63
LRP1-211ENST00000556356 Q8N976 141 aa11.14□□□□□ -0.63
LRP1-211ENST00000556356 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa11.14□□□□□ -0.63
LRP1-211ENST00000556356 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
LRP1-211ENST00000556356 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa11.14□□□□□ -0.63
LRP1-211ENST00000556356 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
LRP1-211ENST00000556356 MTORP42345 2549 aa11.14□□□□□ -0.63
LRP1-211ENST00000556356 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa11.13□□□□□ -0.63
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LRP1-211ENST00000556356 CARD19Q96LW7 228 aa11.12□□□□□ -0.63
LRP1-211ENST00000556356 U3KQK5 164 aa11.12□□□□□ -0.63
LRP1-211ENST00000556356 M0R2N4 97 aa11.12□□□□□ -0.63
LRP1-211ENST00000556356 ORMDL1Q9P0S3 153 aa11.12□□□□□ -0.63
LRP1-211ENST00000556356 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
LRP1-211ENST00000556356 C1orf158Q8N1D5 194 aa11.11□□□□□ -0.63
LRP1-211ENST00000556356 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa11.11□□□□□ -0.63
LRP1-211ENST00000556356 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa11.1□□□□□ -0.63
LRP1-211ENST00000556356 TTTY13Q9BZ97 58 aa11.1□□□□□ -0.63
LRP1-211ENST00000556356 SPATA12Q7Z6I5 190 aa11.09□□□□□ -0.63
LRP1-211ENST00000556356 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa11.09□□□□□ -0.63
LRP1-211ENST00000556356 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
LRP1-211ENST00000556356 TSHBP01222 138 aa11.09□□□□□ -0.63
LRP1-211ENST00000556356 HIGD1BQ9P298 99 aa11.09□□□□□ -0.63
LRP1-211ENST00000556356 A0A1W2PPM0 123 aa11.09□□□□□ -0.63
LRP1-211ENST00000556356 DIRC1Q969H9 104 aa11.09□□□□□ -0.63
LRP1-211ENST00000556356 UBE2D3P61077 147 aa11.08□□□□□ -0.64
LRP1-211ENST00000556356 UBE2D2P62837 147 aa11.08□□□□□ -0.64
LRP1-211ENST00000556356 UBL5Q9BZL1 73 aa11.08□□□□□ -0.64
LRP1-211ENST00000556356 G3V4G9 280 aa11.08□□□□□ -0.64
LRP1-211ENST00000556356 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
LRP1-211ENST00000556356 OCIAD2Q56VL3 154 aa11.08□□□□□ -0.64
LRP1-211ENST00000556356 FSHBP01225 129 aa11.08□□□□□ -0.64
LRP1-211ENST00000556356 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
LRP1-211ENST00000556356 SYCNQ0VAF6 134 aa11.08□□□□□ -0.64
LRP1-211ENST00000556356 NPSP0C0P6 89 aa11.07□□□□□ -0.64
LRP1-211ENST00000556356 NRACQ8N912 160 aa11.07□□□□□ -0.64
LRP1-211ENST00000556356 CNFNQ9BYD5 112 aa11.07□□□□□ -0.64
LRP1-211ENST00000556356 CD164L2Q6UWJ8 174 aa11.06□□□□□ -0.64
LRP1-211ENST00000556356 ACANP16112 2415 aa11.06□□□□□ -0.64
LRP1-211ENST00000556356 CEP350Q5VT06 3117 aa11.06□□□□□ -0.64
LRP1-211ENST00000556356 K7EP34 96 aa11.06□□□□□ -0.64
LRP1-211ENST00000556356 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
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LRP1-211ENST00000556356 B9D2Q9BPU9 175 aa11.05□□□□□ -0.64
LRP1-211ENST00000556356 C4orf48Q5BLP8 95 aa11.05□□□□□ -0.64
LRP1-211ENST00000556356 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
LRP1-211ENST00000556356 H3BQ85 93 aa11.04□□□□□ -0.64
LRP1-211ENST00000556356 F8W1H4 67 aa11.04□□□□□ -0.64
LRP1-211ENST00000556356 BEAN1Q3B7T3 259 aa11.04□□□□□ -0.64
LRP1-211ENST00000556356 PPDPFLQ8WWR9 84 aa11.04□□□□□ -0.64
LRP1-211ENST00000556356 HAMPP81172 84 aa11.03□□□□□ -0.64
LRP1-211ENST00000556356 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP11.03□□□□□ -0.64
LRP1-211ENST00000556356 A0A0J9YXY3 114 aa11.03□□□□□ -0.64
LRP1-211ENST00000556356 LECT2O14960 151 aa11.03□□□□□ -0.64
LRP1-211ENST00000556356 FHL3Q13643 280 aa11.03□□□□□ -0.64
LRP1-211ENST00000556356 TMEM223A0PJW6 202 aa11.02□□□□□ -0.64
LRP1-211ENST00000556356 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa11.02□□□□□ -0.65
LRP1-211ENST00000556356 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa11.02□□□□□ -0.65
LRP1-211ENST00000556356 H3BMG7 143 aa11.02□□□□□ -0.65
LRP1-211ENST00000556356 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
LRP1-211ENST00000556356 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa11.02□□□□□ -0.65
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LRP1-211ENST00000556356 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
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LRP1-211ENST00000556356 COX8CQ7Z4L0 72 aa11□□□□□ -0.65
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LRP1-211ENST00000556356 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
LRP1-211ENST00000556356 DSCAML1Q8TD84 2053 aa10.97□□□□□ -0.65
LRP1-211ENST00000556356 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
LRP1-211ENST00000556356 hADV29S1A0JD25 119 aa10.97□□□□□ -0.65
LRP1-211ENST00000556356 XAGE1AQ9HD64 81 aa10.97□□□□□ -0.65
LRP1-211ENST00000556356 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa10.96□□□□□ -0.65
LRP1-211ENST00000556356 GAS8-AS1O95177 125 aa10.96□□□□□ -0.66
LRP1-211ENST00000556356 K7EP13 123 aa10.95□□□□□ -0.66
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