RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542667.5

TM7SF3-211, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 3

Gene TM7SF3, Length 613 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-211ENST00000542667 HIGD2BQ4VC39 106 aa9.25□□□□□ -0.93
TM7SF3-211ENST00000542667 C15orf56Q8N910 161 aa9.25□□□□□ -0.93
TM7SF3-211ENST00000542667 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa9.24□□□□□ -0.93
TM7SF3-211ENST00000542667 FAM229AH3BQW9 127 aa9.24□□□□□ -0.93
TM7SF3-211ENST00000542667 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa9.24□□□□□ -0.93
TM7SF3-211ENST00000542667 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa9.24□□□□□ -0.93
TM7SF3-211ENST00000542667 F8W036 122 aa9.23□□□□□ -0.93
TM7SF3-211ENST00000542667 PPP1R2P9O14990 202 aa9.23□□□□□ -0.93
TM7SF3-211ENST00000542667 TCAPO15273 167 aa9.23□□□□□ -0.93
TM7SF3-211ENST00000542667 CCL25O15444 150 aa9.23□□□□□ -0.93
TM7SF3-211ENST00000542667 PPP1R17O96001 155 aa9.23□□□□□ -0.93
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TM7SF3-211ENST00000542667 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
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TM7SF3-211ENST00000542667 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa9.23□□□□□ -0.93
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TM7SF3-211ENST00000542667 ZNF664Q8N3J9 261 aa9.23□□□□□ -0.93
TM7SF3-211ENST00000542667 C9orf163Q8N9P6 203 aa9.23□□□□□ -0.93
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TM7SF3-211ENST00000542667 S100A8P05109 93 aa9.22□□□□□ -0.93
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TM7SF3-211ENST00000542667 LINC00526Q96FQ7 95 aa9.22□□□□□ -0.93
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TM7SF3-211ENST00000542667 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa9.22□□□□□ -0.93
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TM7SF3-211ENST00000542667 SMIM2Q9BVW6 85 aa9.21□□□□□ -0.94
TM7SF3-211ENST00000542667 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa9.2□□□□□ -0.94
TM7SF3-211ENST00000542667 TMEM218A2RU14 115 aa9.2□□□□□ -0.94
TM7SF3-211ENST00000542667 CHTF8P0CG12 524 aa9.2□□□□□ -0.94
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TM7SF3-211ENST00000542667 TMEM136Q6ZRR5 245 aa9.2□□□□□ -0.94
TM7SF3-211ENST00000542667 Q6ZUT4 128 aa9.2□□□□□ -0.94
TM7SF3-211ENST00000542667 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa9.2□□□□□ -0.94
TM7SF3-211ENST00000542667 PRELID3AQ96N28 172 aa9.2□□□□□ -0.94
TM7SF3-211ENST00000542667 COMMD7Q86VX2 200 aa9.19□□□□□ -0.94
TM7SF3-211ENST00000542667 ORMDL3Q8N138 153 aa9.19□□□□□ -0.94
TM7SF3-211ENST00000542667 AP5S1Q9NUS5 200 aa9.19□□□□□ -0.94
TM7SF3-211ENST00000542667 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa9.18□□□□□ -0.94
TM7SF3-211ENST00000542667 SS18Q15532 418 aa9.18□□□□□ -0.94
TM7SF3-211ENST00000542667 FAM104AQ969W3 186 aa9.18□□□□□ -0.94
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TM7SF3-211ENST00000542667 CFAP161Q6P656 301 aa9.17□□□□□ -0.94
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TM7SF3-211ENST00000542667 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
TM7SF3-211ENST00000542667 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
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TM7SF3-211ENST00000542667 KIAA1644Q3SXP7 199 aa9.15□□□□□ -0.94
TM7SF3-211ENST00000542667 CD164L2Q6UWJ8 174 aa9.15□□□□□ -0.94
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TM7SF3-211ENST00000542667 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
TM7SF3-211ENST00000542667 C5orf38Q86SI9 138 aa9.14□□□□□ -0.95
TM7SF3-211ENST00000542667 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa9.14□□□□□ -0.95
TM7SF3-211ENST00000542667 TMEM18Q96B42 140 aa9.14□□□□□ -0.95
TM7SF3-211ENST00000542667 TIMM21Q9BVV7 248 aa9.14□□□□□ -0.95
TM7SF3-211ENST00000542667 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa9.13□□□□□ -0.95
TM7SF3-211ENST00000542667 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa9.13□□□□□ -0.95
TM7SF3-211ENST00000542667 C1orf196B1AJZ1 125 aa9.13□□□□□ -0.95
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TM7SF3-211ENST00000542667 SEC11CQ9BY50 192 aa9.13□□□□□ -0.95
TM7SF3-211ENST00000542667 MAP1LC3AQ9H492 121 aa9.13□□□□□ -0.95
TM7SF3-211ENST00000542667 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa9.12□□□□□ -0.95
TM7SF3-211ENST00000542667 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa9.12□□□□□ -0.95
TM7SF3-211ENST00000542667 IMMP2LQ96T52 175 aa9.12□□□□□ -0.95
TM7SF3-211ENST00000542667 CTDSP1Q9GZU7 261 aa9.12□□□□□ -0.95
TM7SF3-211ENST00000542667 A0A087WYN8 130 aa9.11□□□□□ -0.95
TM7SF3-211ENST00000542667 COX7A2LO14548 114 aa9.11□□□□□ -0.95
TM7SF3-211ENST00000542667 MALP21145 153 aa9.11□□□□□ -0.95
TM7SF3-211ENST00000542667 SMAGPQ0VAQ4 97 aa9.11□□□□□ -0.95
TM7SF3-211ENST00000542667 SPACA4Q8TDM5 124 aa9.11□□□□□ -0.95
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TM7SF3-211ENST00000542667 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa9.1□□□□□ -0.95
TM7SF3-211ENST00000542667 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
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TM7SF3-211ENST00000542667 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
TM7SF3-211ENST00000542667 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa9.09□□□□□ -0.95
TM7SF3-211ENST00000542667 A0A096LNI7 61 aa9.09□□□□□ -0.95
TM7SF3-211ENST00000542667 IFITM10A6NMD0 228 aa9.09□□□□□ -0.95
TM7SF3-211ENST00000542667 PRSS47A8MTI9 375 aa9.09□□□□□ -0.95
TM7SF3-211ENST00000542667 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa9.09□□□□□ -0.95
TM7SF3-211ENST00000542667 MAJINQ3KP22 176 aa9.09□□□□□ -0.95
TM7SF3-211ENST00000542667 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
TM7SF3-211ENST00000542667 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
TM7SF3-211ENST00000542667 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
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