RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526095.1

KCNQ1-206, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 3

Gene KCNQ1, Length 1,046 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-206ENST00000526095 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa10.11□□□□□ -0.79
KCNQ1-206ENST00000526095 PPBPP02775 128 aa10.11□□□□□ -0.79
KCNQ1-206ENST00000526095 RPL32P62910 135 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
KCNQ1-206ENST00000526095 COTL1Q14019 142 aa10.11□□□□□ -0.79
KCNQ1-206ENST00000526095 ST20Q9HBF5 79 aa10.11□□□□□ -0.79
KCNQ1-206ENST00000526095 PHOX2AO14813 284 aa10.1□□□□□ -0.79
KCNQ1-206ENST00000526095 S100PP25815 95 aa10.1□□□□□ -0.79
KCNQ1-206ENST00000526095 TMEM136Q6ZRR5 245 aa10.1□□□□□ -0.79
KCNQ1-206ENST00000526095 C20orf78Q9BR46 151 aa10.1□□□□□ -0.79
KCNQ1-206ENST00000526095 D6R8Y8 96 aa10.09□□□□□ -0.79
KCNQ1-206ENST00000526095 I3L3M4 83 aa10.09□□□□□ -0.79
KCNQ1-206ENST00000526095 CKS2P33552 79 aa10.09□□□□□ -0.79
KCNQ1-206ENST00000526095 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
KCNQ1-206ENST00000526095 TMEM243Q9BU79 118 aa10.09□□□□□ -0.79
KCNQ1-206ENST00000526095 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa10.08□□□□□ -0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 TSHBP01222 138 aa10.08□□□□□ -0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa10.08□□□□□ -0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 ORMDL3Q8N138 153 aa10.08□□□□□ -0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 C9orf163Q8N9P6 203 aa10.08□□□□□ -0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 PANO1I0J062 215 aa10.07□□□□□ -0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 TNFRSF6BO95407 300 aa10.07□□□□□ -0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 NPYP01303 97 aa10.07□□□□□ -0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 AMTP48728 403 aa10.07□□□□□ -0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 REG3AQ06141 175 aa10.07□□□□□ -0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 C20orf203Q8NBC4 194 aa10.07□□□□□ -0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa10.07□□□□□ -0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 A0A1B0GUV1 79 aa10.06□□□□□ -0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 PRSS47A8MTI9 375 aa10.06□□□□□ -0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 VCYO14598 125 aa10.06□□□□□ -0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 OXTP01178 125 aa10.06□□□□□ -0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 ESDP10768 282 aa10.06□□□□□ -0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 PMCHP20382 165 aa10.06□□□□□ -0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 COX19Q49B96 90 aa10.06□□□□□ -0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 YPEL4Q96NS1 127 aa10.06□□□□□ -0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 GNB1LQ9BYB4 327 aa10.06□□□□□ -0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa10.05□□□□□ -0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 H7C423 109 aa10.05□□□□□ -0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 APCSP02743 223 aa10.05□□□□□ -0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 SDIM1Q6ZPB5 146 aa10.05□□□□□ -0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 PRELID3AQ96N28 172 aa10.05□□□□□ -0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 SMIM2Q9BVW6 85 aa10.05□□□□□ -0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 HMCN2Q8NDA2 5059 aa10.03□□□□□ -0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 MT-ND6P03923 174 aa10.03□□□□□ -0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa10.02□□□□□ -0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 hDV102S1A0JD36 115 aa10.02□□□□□ -0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 TCAPO15273 167 aa10.02□□□□□ -0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 CNBPP62633 177 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 KIR2DL4Q99706 377 aa10.02□□□□□ -0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa10.01□□□□□ -0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 UBE2L6O14933 153 aa10.01□□□□□ -0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa10.01□□□□□ -0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 SLPIP03973 132 aa10□□□□□ -0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 DPH3Q96FX2 82 aa10□□□□□ -0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 FGF6P10767 208 aa9.99□□□□□ -0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 FCER1GP30273 86 aa9.99□□□□□ -0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 MAP1LC3AQ9H492 121 aa9.99□□□□□ -0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa9.98□□□□□ -0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 KIAA1644Q3SXP7 199 aa9.98□□□□□ -0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 CBLN2Q8IUK8 224 aa9.98□□□□□ -0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 SMCO4Q9NRQ5 59 aa9.98□□□□□ -0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 AP5S1Q9NUS5 200 aa9.98□□□□□ -0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa9.97□□□□□ -0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 CHTF8P0CG12 524 aa9.97□□□□□ -0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 Q8N8P6 123 aa9.97□□□□□ -0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 C15orf56Q8N910 161 aa9.97□□□□□ -0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 TIMM21Q9BVV7 248 aa9.97□□□□□ -0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
KCNQ1-206ENST00000526095 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa9.96□□□□□ -0.82
KCNQ1-206ENST00000526095 GAGE12HA6NDE8 117 aa9.95□□□□□ -0.82
KCNQ1-206ENST00000526095 K7EMI3 77 aa9.95□□□□□ -0.82
KCNQ1-206ENST00000526095 FABP9Q0Z7S8 132 aa9.95□□□□□ -0.82
KCNQ1-206ENST00000526095 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
KCNQ1-206ENST00000526095 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa9.95□□□□□ -0.82
KCNQ1-206ENST00000526095 A0A087WYN8 130 aa9.94□□□□□ -0.82
KCNQ1-206ENST00000526095 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa9.94□□□□□ -0.82
KCNQ1-206ENST00000526095 LINC01546A6NGU7 62 aa9.94□□□□□ -0.82
KCNQ1-206ENST00000526095 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
KCNQ1-206ENST00000526095 SPACA4Q8TDM5 124 aa9.94□□□□□ -0.82
KCNQ1-206ENST00000526095 TMEM18Q96B42 140 aa9.94□□□□□ -0.82
KCNQ1-206ENST00000526095 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa9.94□□□□□ -0.82
KCNQ1-206ENST00000526095 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa9.94□□□□□ -0.82
KCNQ1-206ENST00000526095 MT1HL1P0DM35 61 aa9.93□□□□□ -0.82
KCNQ1-206ENST00000526095 RAB5AP20339 215 aa9.93□□□□□ -0.82
KCNQ1-206ENST00000526095 RPL39P62891 51 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
KCNQ1-206ENST00000526095 SMAGPQ0VAQ4 97 aa9.93□□□□□ -0.82
KCNQ1-206ENST00000526095 OR5A1Q8NGJ0 315 aa9.93□□□□□ -0.82
KCNQ1-206ENST00000526095 FAM104AQ969W3 186 aa9.93□□□□□ -0.82
KCNQ1-206ENST00000526095 TMEM101Q96IK0 257 aa9.93□□□□□ -0.82
KCNQ1-206ENST00000526095 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms