RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526080.1

PTPRU-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 424 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-209ENST00000526080 BTF3L4Q96K17 158 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRU-209ENST00000526080 C2orf48Q96LS8 159 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRU-209ENST00000526080 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRU-209ENST00000526080 UMAD1C9J7I0 102 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRU-209ENST00000526080 BCL2L11O43521 198 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRU-209ENST00000526080 TSHBP01222 138 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRU-209ENST00000526080 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRU-209ENST00000526080 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRU-209ENST00000526080 TWIST1Q15672 202 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRU-209ENST00000526080 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRU-209ENST00000526080 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRU-209ENST00000526080 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRU-209ENST00000526080 RAB19A4D1S5 217 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRU-209ENST00000526080 I3L3M4 83 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRU-209ENST00000526080 ARPC5O15511 151 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRU-209ENST00000526080 CCL20P78556 96 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRU-209ENST00000526080 RNF151Q2KHN1 245 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRU-209ENST00000526080 COX7A2LO14548 114 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRU-209ENST00000526080 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRU-209ENST00000526080 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRU-209ENST00000526080 MANBALQ9NQG1 85 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRU-209ENST00000526080 A0A087WZ39 114 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 FAM168BA1KXE4 195 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 GNG4P50150 75 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 TEX261Q6UWH6 196 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 NUDT10Q8NFP7 164 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 TSKUQ8WUA8 353 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 MRAP2Q96G30 205 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 NUDT11Q96G61 164 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 TMEM242Q9NWH2 141 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 PMCHP20382 165 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 MALP21145 153 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 UBE2D1P51668 147 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 FAM210AQ96ND0 272 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 FSIP2Q5CZC0 6907 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 C1orf196B1AJZ1 125 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 GNG13Q9P2W3 67 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 SPAG11BQ08648 103 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF345Q14585 488 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 BIN3Q9NQY0 253 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 C7orf77A4D0Y5 90 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 C5orf38Q86SI9 138 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 OR10D4PQ8NGN7 298 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 K7EN84 100 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 PDE6DO43924 150 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 SMIM15Q7Z3B0 74 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 ST20Q9HBF5 79 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRU-209ENST00000526080 F8WDY8 70 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRU-209ENST00000526080 SMLR1H3BR10 107 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRU-209ENST00000526080 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
PTPRU-209ENST00000526080 C10orf25Q5T742 122 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRU-209ENST00000526080 IMMP2LQ96T52 175 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRU-209ENST00000526080 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRU-209ENST00000526080 TSPAN13O95857 204 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRU-209ENST00000526080 SMDT1Q9H4I9 107 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRU-209ENST00000526080 MED9Q9NWA0 146 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRU-209ENST00000526080 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRU-209ENST00000526080 M0QXV9 152 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRU-209ENST00000526080 Q6ZUT4 128 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRU-209ENST00000526080 A0A087X002 238 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRU-209ENST00000526080 NDUFA1O15239 70 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRU-209ENST00000526080 ORAOV1Q8WV07 137 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRU-209ENST00000526080 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF861PO60384 105 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRU-209ENST00000526080 UBE2BP63146 152 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRU-209ENST00000526080 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
PTPRU-209ENST00000526080 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRU-209ENST00000526080 OCC1Q8TAD7 63 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRU-209ENST00000526080 FAM104AQ969W3 186 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRU-209ENST00000526080 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRU-209ENST00000526080 HMSDA8MTL9 139 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRU-209ENST00000526080 TMEM241Q24JQ0 296 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRU-209ENST00000526080 GAGE2EQ4V326 116 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRU-209ENST00000526080 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRU-209ENST00000526080 TMEM191AQ9H0A3 160 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRU-209ENST00000526080 BATF3Q9NR55 127 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRU-209ENST00000526080 GAGE2DQ9UEU5 116 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRU-209ENST00000526080 RAB4AP20338 218 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRU-209ENST00000526080 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRU-209ENST00000526080 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRU-209ENST00000526080 VCYO14598 125 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRU-209ENST00000526080 FAM231DQ6ZW35 169 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRU-209ENST00000526080 FCER1GP30273 86 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRU-209ENST00000526080 KIAA0087Q14695 138 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRU-209ENST00000526080 TPRXLQ17RH7 258 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRU-209ENST00000526080 CT83Q5H943 113 aa8.06□□□□□ -1.12
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