RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525711.1

UBASH3B-202, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-202ENST00000525711 Q8N3U1 123 aa9.28□□□□□ -0.92
UBASH3B-202ENST00000525711 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-202ENST00000525711 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-202ENST00000525711 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-202ENST00000525711 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-202ENST00000525711 APCSP02743 223 aa9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-202ENST00000525711 PMCHP20382 165 aa9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-202ENST00000525711 COTL1Q14019 142 aa9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-202ENST00000525711 PRELID3AQ96N28 172 aa9.27□□□□□ -0.93
UBASH3B-202ENST00000525711 PKIAP61925 76 aa9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-202ENST00000525711 NIT1Q86X76 327 aa9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-202ENST00000525711 CHCHD7Q9BUK0 85 aa9.26□□□□□ -0.93
UBASH3B-202ENST00000525711 NPYP01303 97 aa9.25□□□□□ -0.93
UBASH3B-202ENST00000525711 C14orf177Q52M58 125 aa9.25□□□□□ -0.93
UBASH3B-202ENST00000525711 H7C423 109 aa9.24□□□□□ -0.93
UBASH3B-202ENST00000525711 TCAPO15273 167 aa9.24□□□□□ -0.93
UBASH3B-202ENST00000525711 TSHBP01222 138 aa9.24□□□□□ -0.93
UBASH3B-202ENST00000525711 CBLN2Q8IUK8 224 aa9.24□□□□□ -0.93
UBASH3B-202ENST00000525711 KIR2DL4Q99706 377 aa9.24□□□□□ -0.93
UBASH3B-202ENST00000525711 CHCHD5Q9BSY4 110 aa9.24□□□□□ -0.93
UBASH3B-202ENST00000525711 TMEM243Q9BU79 118 aa9.24□□□□□ -0.93
UBASH3B-202ENST00000525711 TMEM262E9PQX1 116 aa9.23□□□□□ -0.93
UBASH3B-202ENST00000525711 S100A1P23297 94 aa9.23□□□□□ -0.93
UBASH3B-202ENST00000525711 AMTP48728 403 aa9.23□□□□□ -0.93
UBASH3B-202ENST00000525711 FABP9Q0Z7S8 132 aa9.23□□□□□ -0.93
UBASH3B-202ENST00000525711 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
UBASH3B-202ENST00000525711 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa9.23□□□□□ -0.93
UBASH3B-202ENST00000525711 LRP2P98164 4655 aa9.22□□□□□ -0.93
UBASH3B-202ENST00000525711 A0A087WX48 190 aa9.22□□□□□ -0.93
UBASH3B-202ENST00000525711 A0A1B0GUV1 79 aa9.22□□□□□ -0.93
UBASH3B-202ENST00000525711 ESDP10768 282 aa9.22□□□□□ -0.93
UBASH3B-202ENST00000525711 KIAA1644Q3SXP7 199 aa9.22□□□□□ -0.93
UBASH3B-202ENST00000525711 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
UBASH3B-202ENST00000525711 SMIM2Q9BVW6 85 aa9.22□□□□□ -0.93
UBASH3B-202ENST00000525711 MAP1LC3AQ9H492 121 aa9.22□□□□□ -0.93
UBASH3B-202ENST00000525711 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 UBE2WQ96B02 151 aa9.21□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 KLK12Q9UKR0 248 aa9.21□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 COLCA2A8K830 154 aa9.2□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 K7EMI3 77 aa9.2□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 UBE2L6O14933 153 aa9.2□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 MT1HL1P0DM35 61 aa9.2□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 FCER1GP30273 86 aa9.2□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 GAGE6Q13070 117 aa9.2□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 Q6ZRU5 148 aa9.2□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 Q8N8P6 123 aa9.2□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa9.19□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 RBX1P62877 108 aa9.19□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 Q0VG73 95 aa9.19□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 MPV17L2Q567V2 206 aa9.19□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 C1orf43Q9BWL3 253 aa9.19□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 RNF213Q63HN8 5207 aa9.18□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 RAB5AP20339 215 aa9.18□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 ATP6V1G1O75348 118 aa9.17□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 SMAGPQ0VAQ4 97 aa9.17□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 C20orf203Q8NBC4 194 aa9.17□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 TNXBP22105 4242 aa9.16□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 FGF6P10767 208 aa9.16□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 TMEM18Q96B42 140 aa9.16□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 LINC01546A6NGU7 62 aa9.15□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 SCO1O75880 301 aa9.15□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 CRPP02741 224 aa9.15□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 ANGP03950 147 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 ORMDL2Q53FV1 153 aa9.15□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa9.15□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa9.15□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 TIMM21Q9BVV7 248 aa9.15□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 PRR34Q9NV39 138 aa9.15□□□□□ -0.94
UBASH3B-202ENST00000525711 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa9.14□□□□□ -0.95
UBASH3B-202ENST00000525711 G0S2P27469 103 aa9.14□□□□□ -0.95
UBASH3B-202ENST00000525711 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa9.14□□□□□ -0.95
UBASH3B-202ENST00000525711 ENHOQ6UWT2 76 aa9.14□□□□□ -0.95
UBASH3B-202ENST00000525711 TRGC2P03986 189 aa9.13□□□□□ -0.95
UBASH3B-202ENST00000525711 MIAQ16674 131 aa9.13□□□□□ -0.95
UBASH3B-202ENST00000525711 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
UBASH3B-202ENST00000525711 LINC00269Q8N2A0 174 aa9.13□□□□□ -0.95
UBASH3B-202ENST00000525711 C18orf32Q8TCD1 76 aa9.13□□□□□ -0.95
UBASH3B-202ENST00000525711 TMEM101Q96IK0 257 aa9.13□□□□□ -0.95
UBASH3B-202ENST00000525711 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa9.13□□□□□ -0.95
UBASH3B-202ENST00000525711 USP17L23D6RBM5 183 aa9.12□□□□□ -0.95
UBASH3B-202ENST00000525711 REG3AQ06141 175 aa9.12□□□□□ -0.95
UBASH3B-202ENST00000525711 C9orf163Q8N9P6 203 aa9.12□□□□□ -0.95
UBASH3B-202ENST00000525711 OR5A1Q8NGJ0 315 aa9.12□□□□□ -0.95
UBASH3B-202ENST00000525711 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa9.12□□□□□ -0.95
UBASH3B-202ENST00000525711 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa9.12□□□□□ -0.95
UBASH3B-202ENST00000525711 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa9.11□□□□□ -0.95
UBASH3B-202ENST00000525711 RAB5BP61020 215 aa9.11□□□□□ -0.95
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF664Q8N3J9 261 aa9.11□□□□□ -0.95
UBASH3B-202ENST00000525711 SPANXA1Q9NS26 97 aa9.11□□□□□ -0.95
UBASH3B-202ENST00000525711 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
UBASH3B-202ENST00000525711 LINC01549A6NIU2 74 aa9.1□□□□□ -0.95
UBASH3B-202ENST00000525711 LINC00614P0C842 121 aa9.1□□□□□ -0.95
UBASH3B-202ENST00000525711 RPL39P62891 51 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.9 ms