RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 HIST1H2BMQ99879 126 aa5.11□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 PRO0255Q9UI72 69 aa5.11□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 HHLA3Q9XRX5 114 aa5.11□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 KMT2AQ03164 3969 aa5.1□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa5.1□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa5.1□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 F5H768 121 aa5.1□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 HSBP1O75506 76 aa5.1□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 NPYP01303 97 aa5.1□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 HTN3P15516 51 aa5.1□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 S100A2P29034 98 aa5.1□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 LINC00315P59091 139 aa5.1□□□□□ -1.59
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HERC3-210ENST00000512194 UFSP1Q6NVU6 142 aa5.1□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 SH2D6Q7Z4S9 175 aa5.1□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 Q8N8P6 123 aa5.1□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 C18orf32Q8TCD1 76 aa5.1□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa5.09□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 SDHAF1A6NFY7 115 aa5.09□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 LINC01549A6NIU2 74 aa5.09□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 I3L3M4 83 aa5.09□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 FCER1GP30273 86 aa5.09□□□□□ -1.59
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HERC3-210ENST00000512194 ORMDL2Q53FV1 153 aa5.09□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 TMEM97Q5BJF2 176 aa5.09□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
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HERC3-210ENST00000512194 NIT1Q86X76 327 aa5.09□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 SLC25A29Q8N8R3 303 aa5.09□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 LITAFQ99732 161 aa5.09□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa5.09□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 TRAV10A0A0B4J240 114 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 CRYBA4P53673 196 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 COTL1Q14019 142 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 LAGE3Q14657 143 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 C12orf74Q32Q52 190 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 ZFAND6Q6FIF0 208 aa5.08□□□□□ -1.6
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HERC3-210ENST00000512194 ZNRF2Q8NHG8 242 aa5.08□□□□□ -1.6
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HERC3-210ENST00000512194 TMEM70Q9BUB7 260 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 SMIM2Q9BVW6 85 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 CELA1Q9UNI1 258 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 A0A087WYN8 130 aa5.07□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 A0A087WZ39 114 aa5.07□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa5.07□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa5.07□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 H3BNG1 76 aa5.07□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 CFC1BP0CG36 223 aa5.07□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 CFC1P0CG37 223 aa5.07□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 XGP55808 180 aa5.07□□□□□ -1.6
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HERC3-210ENST00000512194 IQCJQ1A5X6 159 aa5.07□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 ICOSQ9Y6W8 199 aa5.07□□□□□ -1.6
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HERC3-210ENST00000512194 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa5.06□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 SERF1AO75920 110 aa5.06□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 Q6ZTC4 211 aa5.06□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa5.06□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 C2orf48Q96LS8 159 aa5.06□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 HSPB8Q9UJY1 196 aa5.06□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 A0A0J9YY99 117 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 UBE2L6O14933 153 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 GAS8-AS1O95177 125 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 HBDP02042 147 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 P0DMU3 169 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 FAM231AP0DMU4 169 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 FAM231CP0DMU5 169 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 ESDP10768 282 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 UBE2D3P61077 147 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 PKIAP61925 76 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 UBE2D2P62837 147 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 CD164L2Q6UWJ8 174 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 C15orf53Q8NAA6 179 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 VPS13DQ5THJ4 4388 aa5.04□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa5.04□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa5.04□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 A0A087X002 238 aa5.04□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa5.04□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 LINC01546A6NGU7 62 aa5.04□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 ATP5LO75964 103 aa5.04□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 LEPROTL1O95214 131 aa5.04□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 PDZD11Q5EBL8 140 aa5.04□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 NEGR1Q7Z3B1 354 aa5.04□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 GTSF1LQ9H1H1 148 aa5.04□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 CYSLTR1Q9Y271 337 aa5.04□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 DNAH6Q9C0G6 4158 aa5.04□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa5.03□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 H7C423 109 aa5.03□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 AKR1D1P51857 326 aa5.03□□□□□ -1.6
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