RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 BTF3L4Q96K17 158 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 MYCBP2O75592 4640 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP1R17O96001 155 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 FOXI1Q12951 378 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 HIGD2BQ4VC39 106 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 C9orf163Q8N9P6 203 aa12.05□□□□□ -0.48
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SH3BP2-218ENST00000511185 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa12.05□□□□□ -0.48
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SH3BP2-218ENST00000511185 LINC00862A6NCI5 91 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 F8W036 122 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 S100A8P05109 93 aa12.04□□□□□ -0.48
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SH3BP2-218ENST00000511185 KIR2DL4Q99706 377 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 CHAC1Q9BUX1 264 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
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SH3BP2-218ENST00000511185 CCL25O15444 150 aa12.03□□□□□ -0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 CNBPP62633 177 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa12.03□□□□□ -0.48
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SH3BP2-218ENST00000511185 ANAPC16Q96DE5 110 aa12.03□□□□□ -0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 C20orf78Q9BR46 151 aa12.03□□□□□ -0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 MT-ND4LP03901 98 aa12.02□□□□□ -0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 INAFM2P0DMQ5 153 aa12.02□□□□□ -0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 RPL39P62891 51 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
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SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF664Q8N3J9 261 aa12.02□□□□□ -0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM229AH3BQW9 127 aa12.01□□□□□ -0.49
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SH3BP2-218ENST00000511185 UQCC3Q6UW78 93 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 COMMD7Q86VX2 200 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 ORMDL3Q8N138 153 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
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SH3BP2-218ENST00000511185 SDIM1Q6ZPB5 146 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM104AQ969W3 186 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 PRELID3AQ96N28 172 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 PHOX2AO14813 284 aa11.98□□□□□ -0.49
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SH3BP2-218ENST00000511185 CHTF8P0CG12 524 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 LINC00526Q96FQ7 95 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 AP5S1Q9NUS5 200 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM136Q6ZRR5 245 aa11.97□□□□□ -0.49
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SH3BP2-218ENST00000511185 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 SS18Q15532 418 aa11.96□□□□□ -0.49
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SH3BP2-218ENST00000511185 CFAP161Q6P656 301 aa11.94□□□□□ -0.5
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SH3BP2-218ENST00000511185 IMMP2LQ96T52 175 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 MAP1LC3AQ9H492 121 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 SPANXA1Q9NS26 97 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 C1orf196B1AJZ1 125 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 HERC1Q15751 4861 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa11.9□□□□□ -0.5
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SH3BP2-218ENST00000511185 CTDSP1Q9GZU7 261 aa11.89□□□□□ -0.51
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SH3BP2-218ENST00000511185 COX7A2LO14548 114 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 KIAA1644Q3SXP7 199 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 C10orf91Q5T1B1 145 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 C5orf38Q86SI9 138 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 Q8N8P6 123 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
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SH3BP2-218ENST00000511185 CARD19Q96LW7 228 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A087WYN8 130 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 MALP21145 153 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
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