RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503051.1

USP46-AS1-201, USP46 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene USP46-AS1, Length 1,048 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa12.6□□□□□ -0.39
USP46-AS1-201ENST00000503051 PHOX2AO14813 284 aa12.6□□□□□ -0.39
USP46-AS1-201ENST00000503051 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa12.6□□□□□ -0.39
USP46-AS1-201ENST00000503051 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa12.59□□□□□ -0.39
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAM229AH3BQW9 127 aa12.59□□□□□ -0.39
USP46-AS1-201ENST00000503051 TMEM136Q6ZRR5 245 aa12.59□□□□□ -0.39
USP46-AS1-201ENST00000503051 PRELID3AQ96N28 172 aa12.59□□□□□ -0.39
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa12.58□□□□□ -0.4
USP46-AS1-201ENST00000503051 USP17L23D6RBM5 183 aa12.58□□□□□ -0.4
USP46-AS1-201ENST00000503051 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
USP46-AS1-201ENST00000503051 OR5A1Q8NGJ0 315 aa12.58□□□□□ -0.4
USP46-AS1-201ENST00000503051 TMEM101Q96IK0 257 aa12.58□□□□□ -0.4
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAM30AQ9NZY2 134 aa12.58□□□□□ -0.4
USP46-AS1-201ENST00000503051 INAFM2P0DMQ5 153 aa12.57□□□□□ -0.4
USP46-AS1-201ENST00000503051 RHEBQ15382 184 aa12.57□□□□□ -0.4
USP46-AS1-201ENST00000503051 LINC01620Q4KN68 170 aa12.57□□□□□ -0.4
USP46-AS1-201ENST00000503051 CLRN3Q8NCR9 226 aa12.57□□□□□ -0.4
USP46-AS1-201ENST00000503051 TCAPO15273 167 aa12.56□□□□□ -0.4
USP46-AS1-201ENST00000503051 S100PP25815 95 aa12.56□□□□□ -0.4
USP46-AS1-201ENST00000503051 RPS10P5Q9NQ39 176 aa12.55□□□□□ -0.4
USP46-AS1-201ENST00000503051 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa12.55□□□□□ -0.4
USP46-AS1-201ENST00000503051 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
USP46-AS1-201ENST00000503051 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa12.54□□□□□ -0.4
USP46-AS1-201ENST00000503051 SMAGPQ0VAQ4 97 aa12.53□□□□□ -0.4
USP46-AS1-201ENST00000503051 Q6ZSA8 131 aa12.53□□□□□ -0.4
USP46-AS1-201ENST00000503051 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
USP46-AS1-201ENST00000503051 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa12.53□□□□□ -0.4
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAT1Q14517 4588 aa12.53□□□□□ -0.4
USP46-AS1-201ENST00000503051 GAGE12HA6NDE8 117 aa12.52□□□□□ -0.41
USP46-AS1-201ENST00000503051 APOC3P02656 99 aa12.52□□□□□ -0.41
USP46-AS1-201ENST00000503051 NDUFA5Q16718 116 aa12.52□□□□□ -0.41
USP46-AS1-201ENST00000503051 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa12.52□□□□□ -0.41
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF664Q8N3J9 261 aa12.52□□□□□ -0.41
USP46-AS1-201ENST00000503051 TMEM18Q96B42 140 aa12.52□□□□□ -0.41
USP46-AS1-201ENST00000503051 MAP1LC3AQ9H492 121 aa12.52□□□□□ -0.41
USP46-AS1-201ENST00000503051 RPL39P62891 51 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
USP46-AS1-201ENST00000503051 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa12.5□□□□□ -0.41
USP46-AS1-201ENST00000503051 PRSS1P07477 247 aa12.5□□□□□ -0.41
USP46-AS1-201ENST00000503051 RAB5AP20339 215 aa12.5□□□□□ -0.41
USP46-AS1-201ENST00000503051 SVBPQ8N300 66 aa12.5□□□□□ -0.41
USP46-AS1-201ENST00000503051 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
USP46-AS1-201ENST00000503051 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa12.49□□□□□ -0.41
USP46-AS1-201ENST00000503051 PRSS47A8MTI9 375 aa12.49□□□□□ -0.41
USP46-AS1-201ENST00000503051 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
USP46-AS1-201ENST00000503051 Q6ZUT4 128 aa12.49□□□□□ -0.41
USP46-AS1-201ENST00000503051 SCXQ7RTU7 201 aa12.49□□□□□ -0.41
USP46-AS1-201ENST00000503051 TIMM21Q9BVV7 248 aa12.49□□□□□ -0.41
USP46-AS1-201ENST00000503051 SNAPINO95295 136 aa12.48□□□□□ -0.41
USP46-AS1-201ENST00000503051 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
USP46-AS1-201ENST00000503051 XCL1P47992 114 aa12.48□□□□□ -0.41
USP46-AS1-201ENST00000503051 LINC00528Q8N1L1 170 aa12.48□□□□□ -0.41
USP46-AS1-201ENST00000503051 GNB1LQ9BYB4 327 aa12.48□□□□□ -0.41
USP46-AS1-201ENST00000503051 CCL25O15444 150 aa12.47□□□□□ -0.41
USP46-AS1-201ENST00000503051 KIAA1644Q3SXP7 199 aa12.47□□□□□ -0.41
USP46-AS1-201ENST00000503051 Q8N8P6 123 aa12.47□□□□□ -0.41
USP46-AS1-201ENST00000503051 SPANXA1Q9NS26 97 aa12.47□□□□□ -0.41
USP46-AS1-201ENST00000503051 hDV102S1A0JD36 115 aa12.46□□□□□ -0.41
USP46-AS1-201ENST00000503051 FOXI1Q12951 378 aa12.46□□□□□ -0.41
USP46-AS1-201ENST00000503051 SS18Q15532 418 aa12.46□□□□□ -0.41
USP46-AS1-201ENST00000503051 C15orf56Q8N910 161 aa12.46□□□□□ -0.41
USP46-AS1-201ENST00000503051 COX19Q49B96 90 aa12.45□□□□□ -0.42
USP46-AS1-201ENST00000503051 CHAC1Q9BUX1 264 aa12.45□□□□□ -0.42
USP46-AS1-201ENST00000503051 MT-ND6P03923 174 aa12.44□□□□□ -0.42
USP46-AS1-201ENST00000503051 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
USP46-AS1-201ENST00000503051 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa12.43□□□□□ -0.42
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa12.43□□□□□ -0.42
USP46-AS1-201ENST00000503051 CFAP161Q6P656 301 aa12.43□□□□□ -0.42
USP46-AS1-201ENST00000503051 AP5S1Q9NUS5 200 aa12.43□□□□□ -0.42
USP46-AS1-201ENST00000503051 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa12.43□□□□□ -0.42
USP46-AS1-201ENST00000503051 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
USP46-AS1-201ENST00000503051 CNBPP62633 177 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
USP46-AS1-201ENST00000503051 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
USP46-AS1-201ENST00000503051 CD164L2Q6UWJ8 174 aa12.42□□□□□ -0.42
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAM104AQ969W3 186 aa12.42□□□□□ -0.42
USP46-AS1-201ENST00000503051 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
USP46-AS1-201ENST00000503051 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
USP46-AS1-201ENST00000503051 C1orf196B1AJZ1 125 aa12.41□□□□□ -0.42
USP46-AS1-201ENST00000503051 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
USP46-AS1-201ENST00000503051 HIGD2BQ4VC39 106 aa12.41□□□□□ -0.42
USP46-AS1-201ENST00000503051 ORMDL2Q53FV1 153 aa12.41□□□□□ -0.42
USP46-AS1-201ENST00000503051 K7EMI3 77 aa12.4□□□□□ -0.42
USP46-AS1-201ENST00000503051 C9orf163Q8N9P6 203 aa12.4□□□□□ -0.42
USP46-AS1-201ENST00000503051 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa12.4□□□□□ -0.42
USP46-AS1-201ENST00000503051 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
USP46-AS1-201ENST00000503051 CYSLTR1Q9Y271 337 aa12.4□□□□□ -0.42
USP46-AS1-201ENST00000503051 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
USP46-AS1-201ENST00000503051 FABP9Q0Z7S8 132 aa12.39□□□□□ -0.43
USP46-AS1-201ENST00000503051 C2orf66Q6UXQ4 117 aa12.39□□□□□ -0.43
USP46-AS1-201ENST00000503051 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa12.39□□□□□ -0.43
USP46-AS1-201ENST00000503051 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa12.38□□□□□ -0.43
USP46-AS1-201ENST00000503051 IFITM10A6NMD0 228 aa12.38□□□□□ -0.43
USP46-AS1-201ENST00000503051 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa12.38□□□□□ -0.43
USP46-AS1-201ENST00000503051 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa12.37□□□□□ -0.43
USP46-AS1-201ENST00000503051 SLPIP03973 132 aa12.37□□□□□ -0.43
USP46-AS1-201ENST00000503051 COX7A2LO14548 114 aa12.36□□□□□ -0.43
USP46-AS1-201ENST00000503051 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa12.36□□□□□ -0.43
USP46-AS1-201ENST00000503051 TMEM141Q96I45 108 aa12.36□□□□□ -0.43
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa12.35□□□□□ -0.43
USP46-AS1-201ENST00000503051 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms