RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498428.5

ROBO1-211, Transcript of roundabout guidance receptor 1, humanhuman

TSL 2

Gene ROBO1, Length 3,566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO1-211ENST00000498428 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 NPC2P61916 151 aa5.39□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 TMEM170BQ5T4T1 132 aa5.39□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 LINC01600Q96MT4 127 aa5.39□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa5.39□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 P0DMU3 169 aa5.39□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 FAM231AP0DMU4 169 aa5.39□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 FAM231CP0DMU5 169 aa5.39□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 MGAM2Q2M2H8 2515 aa5.39□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa5.39□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 A0A087WW49 117 aa5.39□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 KNCNA6PVL3 124 aa5.39□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 SH2D1AO60880 128 aa5.39□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 I3L2K1 104 aa5.38□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 LAGE3Q14657 143 aa5.38□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa5.38□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa5.38□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 SPANXCQ9NY87 97 aa5.38□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 CUBNO60494 3623 aa5.38□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa5.38□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 CLPSL1A2RUU4 121 aa5.38□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 IGKV1-17P01599 117 aa5.38□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 Q1RN00 199 aa5.38□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 TMEM75Q8N9X5 138 aa5.38□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 USMG5Q96IX5 58 aa5.38□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa5.37□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa5.37□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa5.37□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 THAP8Q8NA92 274 aa5.37□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa5.37□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 FAM223BA6NKX1 122 aa5.37□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 K7EMT4 169 aa5.37□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 VCYO14598 125 aa5.37□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 CTSGP08311 255 aa5.37□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 FAM223AQ8IWN6 122 aa5.37□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 CCDC140Q96MF4 163 aa5.37□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa5.37□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa5.37□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 M0R3E3 92 aa5.37□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 TRIAP1O43715 76 aa5.37□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 DEFB121Q5J5C9 76 aa5.37□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF575Q86XF7 245 aa5.37□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 ATP5G1P05496 136 aa5.36□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 SLC25A29Q8N8R3 303 aa5.36□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa5.36□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5.36□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 DAD1P61803 113 aa5.36□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 IGF1P05019 195 aa5.36□□□□□ -1.55
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ROBO1-211ENST00000498428 PVRIGQ6DKI7 326 aa5.36□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 C9orf139Q6ZV77 190 aa5.36□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 DPH3P1Q9H4G8 78 aa5.36□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 FSHBP01225 129 aa5.35□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 C5orf38Q86SI9 138 aa5.35□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 SCGB3A1Q96QR1 104 aa5.35□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa5.35□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 TMEM243Q9BU79 118 aa5.35□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 BUB3O43684 328 aa5.35□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 LINC00643Q86TS7 51 aa5.35□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF491Q8N8L2 437 aa5.35□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 TIMM17BO60830 172 aa5.35□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 UPK3BQ9BT76 320 aa5.35□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 H3BT86 120 aa5.34□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 PRIMA1Q86XR5 153 aa5.34□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.34□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 NRACQ8N912 160 aa5.34□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 CLEC2BQ92478 149 aa5.34□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 MDFIQ99750 246 aa5.34□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 PSMB8P28062 276 aa5.34□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 TRBV19A0A075B6N1 114 aa5.34□□□□□ -1.56
ROBO1-211ENST00000498428 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.56
ROBO1-211ENST00000498428 RHOHQ15669 191 aa5.34□□□□□ -1.56
ROBO1-211ENST00000498428 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.34□□□□□ -1.56
ROBO1-211ENST00000498428 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa5.34□□□□□ -1.56
ROBO1-211ENST00000498428 A0A0B4J2C4 111 aa5.33□□□□□ -1.56
ROBO1-211ENST00000498428 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa5.33□□□□□ -1.56
ROBO1-211ENST00000498428 C11orf86A6NJI1 115 aa5.33□□□□□ -1.56
ROBO1-211ENST00000498428 ATOX1O00244 68 aa5.33□□□□□ -1.56
ROBO1-211ENST00000498428 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa5.33□□□□□ -1.56
ROBO1-211ENST00000498428 MUSTN1Q8IVN3 82 aa5.33□□□□□ -1.56
ROBO1-211ENST00000498428 NOTCH1P46531 2555 aa5.33□□□□□ -1.56
ROBO1-211ENST00000498428 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa5.33□□□□□ -1.56
ROBO1-211ENST00000498428 AMELXQ99217 191 aa5.33□□□□□ -1.56
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
ROBO1-211ENST00000498428 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
ROBO1-211ENST00000498428 TMEM223A0PJW6 202 aa5.32□□□□□ -1.56
ROBO1-211ENST00000498428 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
ROBO1-211ENST00000498428 Q8TAT8 98 aa5.32□□□□□ -1.56
ROBO1-211ENST00000498428 A0A087WWL8 130 aa5.32□□□□□ -1.56
ROBO1-211ENST00000498428 PLAC8L1A1L4L8 177 aa5.32□□□□□ -1.56
ROBO1-211ENST00000498428 TOMM6Q96B49 74 aa5.32□□□□□ -1.56
ROBO1-211ENST00000498428 TIMM17AQ99595 171 aa5.32□□□□□ -1.56
ROBO1-211ENST00000498428 TMEM14CQ9P0S9 112 aa5.32□□□□□ -1.56
ROBO1-211ENST00000498428 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
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