RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495787.1

ECHDC3-204, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene ECHDC3, Length 505 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-204ENST00000495787 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.49□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.48□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.48□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.48□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 A0A0J9YY99 117 aa7.48□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 F8VRH5 84 aa7.48□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 TSTD3H0UI37 97 aa7.48□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 IGKCP01834 107 aa7.48□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 C11orf45Q8TAV5 145 aa7.48□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 PRO1933Q9H354 126 aa7.48□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 CST9LQ9H4G1 147 aa7.48□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.47□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 hDV102S1A0JD36 115 aa7.47□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 PLNP26678 52 aa7.47□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 MAJINQ3KP22 176 aa7.47□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 ZFAND6Q6FIF0 208 aa7.47□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 SH2D6Q7Z4S9 175 aa7.47□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 FAM104AQ969W3 186 aa7.47□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 AMELXQ99217 191 aa7.47□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 VCX2Q9H322 139 aa7.47□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 ICOSQ9Y6W8 199 aa7.47□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.46□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 H3BNG1 76 aa7.46□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 UBE2L6O14933 153 aa7.46□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 FGF6P10767 208 aa7.46□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.46□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 Q6ZTC4 211 aa7.46□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 CSMD3Q7Z407 3707 aa7.46□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.45□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.44□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 A0A096LPF7 62 aa7.44□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa7.44□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 Q6ZUT4 128 aa7.44□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM101Q96IK0 257 aa7.44□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.44□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 HERC2O95714 4834 aa7.43□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7.43□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 IGLC3P0DOY3 106 aa7.43□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 GAGE6Q13070 117 aa7.43□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.43□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 NFE4Q86UQ8 179 aa7.43□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 STPG4Q8N801 248 aa7.43□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 OR5A1Q8NGJ0 315 aa7.43□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.43□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 C2orf88Q9BSF0 95 aa7.43□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 PCLOQ9Y6V0 5065 aa7.43□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 TRAV10A0A0B4J240 114 aa7.42□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 C11orf86A6NJI1 115 aa7.42□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 DDTP30046 118 aa7.42□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 TIRAPP58753 221 aa7.42□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.42□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.42□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 A0A0J9YXV3 536 aa7.41□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 LELP1Q5T871 98 aa7.41□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 C14orf144Q96I85 54 aa7.41□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 A0A1B0GUV1 79 aa7.4□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.4□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 COX8AP10176 69 aa7.4□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 UBE2D1P51668 147 aa7.4□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.4□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 CHAC1Q9BUX1 264 aa7.4□□□□□ -1.22
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM262E9PQX1 116 aa7.39□□□□□ -1.23
ECHDC3-204ENST00000495787 HERVK_113P61574 105 aa7.39□□□□□ -1.23
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.39□□□□□ -1.23
ECHDC3-204ENST00000495787 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.39□□□□□ -1.23
ECHDC3-204ENST00000495787 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.39□□□□□ -1.23
ECHDC3-204ENST00000495787 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.38□□□□□ -1.23
ECHDC3-204ENST00000495787 E9PLD3 99 aa7.38□□□□□ -1.23
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
ECHDC3-204ENST00000495787 NMUP48645 174 aa7.38□□□□□ -1.23
ECHDC3-204ENST00000495787 RBX1P62877 108 aa7.38□□□□□ -1.23
ECHDC3-204ENST00000495787 SEC11AP67812 179 aa7.38□□□□□ -1.23
ECHDC3-204ENST00000495787 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.37□□□□□ -1.23
ECHDC3-204ENST00000495787 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa7.37□□□□□ -1.23
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM223A0PJW6 202 aa7.37□□□□□ -1.23
ECHDC3-204ENST00000495787 LINC00587B1AMM8 73 aa7.37□□□□□ -1.23
ECHDC3-204ENST00000495787 DLEU1O43261 78 aa7.37□□□□□ -1.23
ECHDC3-204ENST00000495787 TCTAP57738 103 aa7.37□□□□□ -1.23
ECHDC3-204ENST00000495787 MPV17L2Q567V2 206 aa7.37□□□□□ -1.23
ECHDC3-204ENST00000495787 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.37□□□□□ -1.23
ECHDC3-204ENST00000495787 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.37□□□□□ -1.23
ECHDC3-204ENST00000495787 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
ECHDC3-204ENST00000495787 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.36□□□□□ -1.23
ECHDC3-204ENST00000495787 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.36□□□□□ -1.23
ECHDC3-204ENST00000495787 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
ECHDC3-204ENST00000495787 HERVK_113P63121 156 aa7.36□□□□□ -1.23
ECHDC3-204ENST00000495787 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.36□□□□□ -1.23
ECHDC3-204ENST00000495787 LEPROTO15243 131 aa7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 101.5 ms