RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495666.5

RFTN1-211, Transcript of raftlin, lipid raft linker 1, humanhuman

TSL 4

Gene RFTN1, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1-211ENST00000495666 TEX261Q6UWH6 196 aa6.79□□□□□ -1.32
RFTN1-211ENST00000495666 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.79□□□□□ -1.32
RFTN1-211ENST00000495666 C7orf33Q8WU49 177 aa6.79□□□□□ -1.32
RFTN1-211ENST00000495666 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.79□□□□□ -1.32
RFTN1-211ENST00000495666 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.78□□□□□ -1.32
RFTN1-211ENST00000495666 A0A1B0GVG6 124 aa6.78□□□□□ -1.32
RFTN1-211ENST00000495666 C7orf77A4D0Y5 90 aa6.78□□□□□ -1.32
RFTN1-211ENST00000495666 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RFTN1-211ENST00000495666 SRP19P09132 144 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RFTN1-211ENST00000495666 CAMPP49913 170 aa6.78□□□□□ -1.32
RFTN1-211ENST00000495666 SS18Q15532 418 aa6.78□□□□□ -1.32
RFTN1-211ENST00000495666 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.78□□□□□ -1.32
RFTN1-211ENST00000495666 TSKUQ8WUA8 353 aa6.78□□□□□ -1.32
RFTN1-211ENST00000495666 RNF185Q96GF1 192 aa6.78□□□□□ -1.32
RFTN1-211ENST00000495666 FAM210AQ96ND0 272 aa6.78□□□□□ -1.32
RFTN1-211ENST00000495666 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 RAB4AP20338 218 aa6.77□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 ODF1Q14990 250 aa6.77□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 CARD19Q96LW7 228 aa6.77□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.77□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.76□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.76□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 MALP21145 153 aa6.76□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 GAGE2BQ13066 116 aa6.76□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 RIGQ13278 110 aa6.76□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 CT83Q5H943 113 aa6.76□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 Q6ZUT4 128 aa6.76□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.76□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 NUP35Q8NFH5 326 aa6.76□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 V9GYV3 84 aa6.76□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.75□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.75□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 H7C423 109 aa6.75□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 ESDP10768 282 aa6.75□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 C5orf38Q86SI9 138 aa6.75□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 ISOC2Q96AB3 205 aa6.75□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 OSTCQ9NRP0 149 aa6.75□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 C9JQL5 133 aa6.74□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 SYCNQ0VAF6 134 aa6.74□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 TMEM241Q24JQ0 296 aa6.74□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 KIR2DL4Q99706 377 aa6.74□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.74□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.74□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.73□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 A0A0J9YXV3 536 aa6.73□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 VCYO14598 125 aa6.73□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 NRACQ8N912 160 aa6.73□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.73□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.73□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 COX7A2LO14548 114 aa6.72□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 MT1HL1P0DM35 61 aa6.72□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 CKS2P33552 79 aa6.72□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.72□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 Q6ZRU5 148 aa6.72□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RFTN1-211ENST00000495666 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.71□□□□□ -1.34
RFTN1-211ENST00000495666 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RFTN1-211ENST00000495666 NAT8Q9UHE5 227 aa6.71□□□□□ -1.34
RFTN1-211ENST00000495666 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.71□□□□□ -1.34
RFTN1-211ENST00000495666 D6R8Y8 96 aa6.7□□□□□ -1.34
RFTN1-211ENST00000495666 TCAPO15273 167 aa6.7□□□□□ -1.34
RFTN1-211ENST00000495666 SPAG11BQ08648 103 aa6.7□□□□□ -1.34
RFTN1-211ENST00000495666 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.7□□□□□ -1.34
RFTN1-211ENST00000495666 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.7□□□□□ -1.34
RFTN1-211ENST00000495666 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.7□□□□□ -1.34
RFTN1-211ENST00000495666 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.69□□□□□ -1.34
RFTN1-211ENST00000495666 NPYP01303 97 aa6.69□□□□□ -1.34
RFTN1-211ENST00000495666 PEA15Q15121 130 aa6.69□□□□□ -1.34
RFTN1-211ENST00000495666 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6.69□□□□□ -1.34
RFTN1-211ENST00000495666 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.68□□□□□ -1.34
RFTN1-211ENST00000495666 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.68□□□□□ -1.34
RFTN1-211ENST00000495666 IFITM10A6NMD0 228 aa6.68□□□□□ -1.34
RFTN1-211ENST00000495666 PPP1R2P9O14990 202 aa6.68□□□□□ -1.34
RFTN1-211ENST00000495666 TNFRSF6BO95407 300 aa6.68□□□□□ -1.34
RFTN1-211ENST00000495666 PTTG1IPP53801 180 aa6.68□□□□□ -1.34
RFTN1-211ENST00000495666 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.68□□□□□ -1.34
RFTN1-211ENST00000495666 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.68□□□□□ -1.34
RFTN1-211ENST00000495666 TMEM18Q96B42 140 aa6.68□□□□□ -1.34
RFTN1-211ENST00000495666 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.68□□□□□ -1.34
RFTN1-211ENST00000495666 A0A1W2PNN7 141 aa6.67□□□□□ -1.34
RFTN1-211ENST00000495666 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.67□□□□□ -1.34
RFTN1-211ENST00000495666 PPP1R17O96001 155 aa6.67□□□□□ -1.34
RFTN1-211ENST00000495666 HBBP68871 147 aa6.67□□□□□ -1.34
RFTN1-211ENST00000495666 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RFTN1-211ENST00000495666 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.67□□□□□ -1.34
RFTN1-211ENST00000495666 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.67□□□□□ -1.34
RFTN1-211ENST00000495666 APOMO95445 188 aa6.66□□□□□ -1.34
RFTN1-211ENST00000495666 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RFTN1-211ENST00000495666 F8W036 122 aa6.65□□□□□ -1.34
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