RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-240	ENST00000495293	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	DPM2	O94777	84 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	IGKC	P01834	107 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	FABP2	P12104	132 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	PLN	P26678	52 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	CDKN1B	P46527	198 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	DEFB1	P60022	68 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	SEC61G	P60059	68 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	RRN3P1	Q2M238	152 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	MUC21	Q5SSG8	566 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293		Q8N8P6	123 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293		Q8TAT8	98 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	MRAP2	Q96G30	205 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	LINC01587	Q99440	93 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	VGLL1	Q99990	258 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	VPS25	Q9BRG1	176 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293		Q9HAA7	133 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	COL7A1	Q02388	2944 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	LINC01549	A6NIU2	74 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	SMKR1	H3BMG3	65 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293		J3QR89	54 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	DEFB4A	O15263	64 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	NCR2	O95944	276 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	HTN1	P15515	57 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	HLA-DMB	P28068	263 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	ASIP	P42127	132 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	CRIP1	P50238	77 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	EMP1	P54849	157 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	HERVK_113	P61574	105 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	ERCC8	Q13216	396 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	LAGE3	Q14657	143 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	LINC00477	Q96M19	166 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	C18orf15	Q96N68	181 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	AGRN	O00468	2067 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293		H7C1H1	209 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293		K7EMI3	77 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293		K7EP13	123 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	TAX1BP3	O14907	124 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	CCL25	O15444	150 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	SNAI2	O43623	268 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	NPY	P01303	97 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	MGP	P08493	103 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	IGLC6	P0CF74	106 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	EVI2A	P22794	236 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	TCTA	P57738	103 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	COTL1	Q14019	142 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293		Q8NAQ8	132 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	PRAC1	Q96KF2	57 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	ODF3	Q96PU9	254 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293		A8MTW9	85 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293		H3BUT2	72 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293		H3BVH4	76 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293		M0R381	172 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	DAD1	P61803	113 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	AMTN	Q6UX39	209 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	RAB37	Q96AX2	223 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	C16orf74	Q96GX8	76 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	HIST1H4G	Q99525	98 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	C20orf78	Q9BR46	151 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	CNFN	Q9BYD5	112 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	HIGD1B	Q9P298	99 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBM39-240	ENST00000495293		A0A087WX48	190 aa		3.17	□□□□□ -1.9

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