RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 MED14OSP0DP75 135 aa5.14□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 ZNF876PQ49A33 203 aa5.14□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 ORMDL2Q53FV1 153 aa5.14□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 DYNLRB2Q8TF09 96 aa5.14□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa5.14□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 C3orf84H3BNL1 204 aa5.14□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 SLC25A20O43772 301 aa5.14□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 RPL39P62891 51 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 GAGE2AQ6NT46 116 aa5.14□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 LINC01587Q99440 93 aa5.14□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 SDHAF1A6NFY7 115 aa5.13□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 RBMY1CP0DJD4 496 aa5.13□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa5.13□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 ZMAT4Q9H898 229 aa5.13□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 PKIGQ9Y2B9 76 aa5.13□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa5.13□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa5.13□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 TCL1BO95988 128 aa5.13□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 HLA-DRB4P13762 266 aa5.13□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 PMVKQ15126 192 aa5.13□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa5.13□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa5.13□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 TAL2Q16559 108 aa5.13□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa5.13□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 NXPH4O95158 308 aa5.12□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 Q6Q795 121 aa5.12□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 TOMM6Q96B49 74 aa5.12□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 C9orf85Q96MD7 179 aa5.12□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa5.12□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 F8VRH5 84 aa5.12□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 CRYGDP07320 174 aa5.12□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 C4orf26Q17RF5 130 aa5.12□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 Q1RN00 199 aa5.12□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 BAALCQ8WXS3 180 aa5.12□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 PEMTQ9UBM1 199 aa5.12□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 H3BMM0 161 aa5.12□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 H7C1H1 209 aa5.12□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 P0DMU3 169 aa5.12□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 FAM231AP0DMU4 169 aa5.12□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 FAM231CP0DMU5 169 aa5.12□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 C4orf3Q8WVX3 66 aa5.12□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 TRGV11A0A075B6L2 103 aa5.11□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 PPP1R17O96001 155 aa5.11□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 CD28P10747 220 aa5.11□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 ODF3Q96PU9 254 aa5.11□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 C19orf73Q9NVV2 129 aa5.11□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 VCYO14598 125 aa5.11□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa5.11□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 M0QY20 66 aa5.1□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 SEC61GP60059 68 aa5.1□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 HERVK_113P61574 105 aa5.1□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 DEFB114Q30KQ6 69 aa5.1□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 C3orf22Q8N5N4 141 aa5.1□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 MRAPQ8TCY5 172 aa5.1□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 MAP6D1Q9H9H5 199 aa5.1□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 XCL2Q9UBD3 114 aa5.1□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 F8WDY8 70 aa5.1□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 PLNP26678 52 aa5.1□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 Q9UF83 564 aa5.1□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa5.1□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 TSHBP01222 138 aa5.1□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa5.1□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa5.09□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 CCL24O00175 119 aa5.09□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 POM121L12Q8N7R1 296 aa5.09□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.09□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 C11orf86A6NJI1 115 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC4-211ENST00000492996 UQCRQO14949 82 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC4-211ENST00000492996 ZNF815PA8K554 130 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC4-211ENST00000492996 TMEM170BQ5T4T1 132 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC4-211ENST00000492996 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
HERC4-211ENST00000492996 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC4-211ENST00000492996 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC4-211ENST00000492996 IGIPA6NJ69 53 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC4-211ENST00000492996 TRACP01848 142 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC4-211ENST00000492996 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
HERC4-211ENST00000492996 ZNF415Q09FC8 603 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC4-211ENST00000492996 ODF3L2Q3SX64 289 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC4-211ENST00000492996 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa5.07□□□□□ -1.6
HERC4-211ENST00000492996 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
HERC4-211ENST00000492996 UBE2WQ96B02 151 aa5.07□□□□□ -1.6
HERC4-211ENST00000492996 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa5.07□□□□□ -1.6
HERC4-211ENST00000492996 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa5.07□□□□□ -1.6
HERC4-211ENST00000492996 A0A1B0GX51 115 aa5.07□□□□□ -1.6
HERC4-211ENST00000492996 hADV29S1A0JD25 119 aa5.07□□□□□ -1.6
HERC4-211ENST00000492996 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
HERC4-211ENST00000492996 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
HERC4-211ENST00000492996 Q6ZSN1 163 aa5.07□□□□□ -1.6
HERC4-211ENST00000492996 STHQ8IWL8 128 aa5.07□□□□□ -1.6
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