RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490808.1

HDAC3-210, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC3, Length 605 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-210ENST00000490808 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 ATP5G1P05496 136 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 SEC11AP67812 179 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 SH2D6Q7Z4S9 175 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 NMUP48645 174 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 STPG4Q8N801 248 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 TMEM243Q9BU79 118 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.25□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.25□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 C11orf86A6NJI1 115 aa7.25□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 PAX4O43316 350 aa7.25□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 Q8NAQ8 132 aa7.25□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.25□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.24□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 NFE4Q86UQ8 179 aa7.24□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.24□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.24□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7.24□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 AMELXQ99217 191 aa7.24□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 E9PLD3 99 aa7.23□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 GYPEP15421 78 aa7.23□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.23□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 OR5A1Q8NGJ0 315 aa7.23□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 H3BRM9 83 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 FGF6P10767 208 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 CHAC1Q9BUX1 264 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 HIGD1BQ9P298 99 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC3-210ENST00000490808 F5H768 121 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 Q9UF83 564 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 LINC00694P0DN24 101 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 TIRAPP58753 221 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 HERVK_113P63121 156 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 ICOSQ9Y6W8 199 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 TENM2Q9NT68 2774 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 CSMD3Q7Z407 3707 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 H3BNG1 76 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 LEPROTO15243 131 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 DEFB4AO15263 64 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 HSD52Q0P140 79 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 BATFQ16520 125 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 TAL2Q16559 108 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 A0A0J9YXV3 536 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 A6NDN8 102 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 C3orf84H3BNL1 204 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 CCL25O15444 150 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 A0A1B0GUV1 79 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 TMEM223A0PJW6 202 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 HTN3P15516 51 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 UBE2D1P51668 147 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 TCTAP57738 103 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 Q6ZUT4 128 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 PCP2Q8IVA1 136 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 CELA1Q9UNI1 258 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 A0A0J9YY99 117 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 ZNF815PA8K554 130 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 TMEM262E9PQX1 116 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 J3QQQ9 107 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 GAGE6Q13070 117 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 MPV17L2Q567V2 206 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 C12orf74Q32Q52 190 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 C11orf45Q8TAV5 145 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 MUC7Q8TAX7 377 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 HIST1H4GQ99525 98 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 RETNQ9HD89 108 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC3-210ENST00000490808 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC3-210ENST00000490808 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.14□□□□□ -1.27
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