RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489694.5

RARB-208, Transcript of retinoic acid receptor beta, humanhuman

TSL 4

Gene RARB, Length 574 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARB-208ENST00000489694 LINC00612Q8N6U2 182 aa2.79□□□□□ -1.96
RARB-208ENST00000489694 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
RARB-208ENST00000489694 Q8N976 141 aa2.79□□□□□ -1.96
RARB-208ENST00000489694 OR4C5Q8NGB2 326 aa2.79□□□□□ -1.96
RARB-208ENST00000489694 SCGB3A1Q96QR1 104 aa2.79□□□□□ -1.96
RARB-208ENST00000489694 LITAFQ99732 161 aa2.79□□□□□ -1.96
RARB-208ENST00000489694 SPANXA1Q9NS26 97 aa2.79□□□□□ -1.96
RARB-208ENST00000489694 XCL2Q9UBD3 114 aa2.79□□□□□ -1.96
RARB-208ENST00000489694 A0A1B0GVY2 172 aa2.78□□□□□ -1.96
RARB-208ENST00000489694 IGIPA6NJ69 53 aa2.78□□□□□ -1.96
RARB-208ENST00000489694 CCL25O15444 150 aa2.78□□□□□ -1.96
RARB-208ENST00000489694 IGKCP01834 107 aa2.78□□□□□ -1.96
RARB-208ENST00000489694 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RARB-208ENST00000489694 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RARB-208ENST00000489694 RBMY1CP0DJD4 496 aa2.78□□□□□ -1.96
RARB-208ENST00000489694 IGLC3P0DOY3 106 aa2.78□□□□□ -1.96
RARB-208ENST00000489694 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RARB-208ENST00000489694 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RARB-208ENST00000489694 COTL1Q14019 142 aa2.78□□□□□ -1.96
RARB-208ENST00000489694 PMVKQ15126 192 aa2.78□□□□□ -1.96
RARB-208ENST00000489694 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RARB-208ENST00000489694 SPATA45Q537H7 98 aa2.78□□□□□ -1.96
RARB-208ENST00000489694 FAM74A4Q5TZK3 123 aa2.78□□□□□ -1.96
RARB-208ENST00000489694 Q6ZQT7 251 aa2.78□□□□□ -1.96
RARB-208ENST00000489694 Q75L30 129 aa2.78□□□□□ -1.96
RARB-208ENST00000489694 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa2.78□□□□□ -1.96
RARB-208ENST00000489694 C20orf203Q8NBC4 194 aa2.78□□□□□ -1.96
RARB-208ENST00000489694 PRADC1Q9BSG0 188 aa2.78□□□□□ -1.96
RARB-208ENST00000489694 AGRNO00468 2067 aa2.78□□□□□ -1.96
RARB-208ENST00000489694 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 TRGV2A0A075B6R0 118 aa2.77□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa2.77□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa2.77□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa2.77□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 SMKR1H3BMG3 65 aa2.77□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 H3BNG1 76 aa2.77□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 K7EQD1 137 aa2.77□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 M0R143 59 aa2.77□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 COX8AP10176 69 aa2.77□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 HTN1P15515 57 aa2.77□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 HERVK_113P61574 105 aa2.77□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 SLC25A34Q6PIV7 304 aa2.77□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 VCX2Q9H322 139 aa2.77□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 HIGD1BQ9P298 99 aa2.77□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 HHLA3Q9XRX5 114 aa2.77□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 MUC4Q99102 2169 aa2.77□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 MGAM2Q2M2H8 2515 aa2.76□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 PLAC8L1A1L4L8 177 aa2.76□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 C11orf86A6NJI1 115 aa2.76□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 PCP4L1A6NKN8 68 aa2.76□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 TSHBP01222 138 aa2.76□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 SPART-AS1P0CW21 52 aa2.76□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 IGLL1P15814 213 aa2.76□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 FXYD7P58549 80 aa2.76□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 TAL2Q16559 108 aa2.76□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 SFTA2Q6UW10 78 aa2.76□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa2.76□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa2.76□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 STPG4Q8N801 248 aa2.76□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 BAALCQ8WXS3 180 aa2.76□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 C2orf88Q9BSF0 95 aa2.76□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 CST9LQ9H4G1 147 aa2.76□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 PRO0255Q9UI72 69 aa2.76□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa2.75□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa2.75□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa2.75□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa2.75□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 SMIM1B2RUZ4 78 aa2.75□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 E9PLD3 99 aa2.75□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 P0DMU3 169 aa2.75□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 FAM231AP0DMU4 169 aa2.75□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 FAM231CP0DMU5 169 aa2.75□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 NMUP48645 174 aa2.75□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 UBE2D3P61077 147 aa2.75□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 UBE2D2P62837 147 aa2.75□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa2.75□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 Q6ZVH6 145 aa2.75□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 C14orf144Q96I85 54 aa2.75□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 TMEM101Q96IK0 257 aa2.75□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 AMELXQ99217 191 aa2.75□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 PPDPFQ9H3Y8 114 aa2.75□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 JPT2Q9H910 190 aa2.75□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 LINC00587B1AMM8 73 aa2.74□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 H3BRM9 83 aa2.74□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 ATP5G1P05496 136 aa2.74□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 LINC00694P0DN24 101 aa2.74□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 HERVK_113P63121 156 aa2.74□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 CTAG1AP78358 180 aa2.74□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RARB-208ENST00000489694 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.8 ms