RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 HIST1H2BBP33778 126 aa6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 HIST1H2BDP58876 126 aa6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 HIST1H2BCP62807 126 aa6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 RBX1P62877 108 aa6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 SEC11AP67812 179 aa6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 SS18Q15532 418 aa6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 MIAQ16674 131 aa6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 TOMM6Q96B49 74 aa6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 TIMM17AQ99595 171 aa6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 KLK12Q9UKR0 248 aa6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 S100A2P29034 98 aa6.65□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 NDUFA6P56556 154 aa6.65□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 MPV17L2Q567V2 206 aa6.65□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.65□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.64□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 SERF1AO75920 110 aa6.64□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 LEPROTL1O95214 131 aa6.64□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 REG3AQ06141 175 aa6.64□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.64□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 UBE2WQ96B02 151 aa6.64□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.64□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 IFITM10A6NMD0 228 aa6.63□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 PRSS1P07477 247 aa6.63□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 AKR1D1P51857 326 aa6.63□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.63□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 Q8N976 141 aa6.63□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.63□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 M0R2N4 97 aa6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 C6orf223Q8N319 242 aa6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 PMVKQ15126 192 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 CFAP161Q6P656 301 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 Q9HAA7 133 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 PRR34Q9NV39 138 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 RYR3Q15413 4870 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 IGIPA6NJ69 53 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 PMCHL1Q16048 86 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 C20orf202A1L168 122 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 APOMO95445 188 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 FABP4P15090 132 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 MALP21145 153 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 HERVK_113P63121 156 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 C14orf177Q52M58 125 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 Q6ZUT4 128 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-210ENST00000486889 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-210ENST00000486889 H3BRM9 83 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-210ENST00000486889 Q6ZR54 194 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-210ENST00000486889 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-210ENST00000486889 TENM2Q9NT68 2774 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-210ENST00000486889 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-210ENST00000486889 XCL1P47992 114 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-210ENST00000486889 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-210ENST00000486889 ENHOQ6UWT2 76 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-210ENST00000486889 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-210ENST00000486889 BAALCQ8WXS3 180 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-210ENST00000486889 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-210ENST00000486889 AMELXQ99217 191 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-210ENST00000486889 CST9LQ9H4G1 147 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-210ENST00000486889 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-210ENST00000486889 H0Y8G0 127 aa6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-210ENST00000486889 COX7A2LO14548 114 aa6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-210ENST00000486889 PLNP26678 52 aa6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-210ENST00000486889 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-210ENST00000486889 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-210ENST00000486889 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-210ENST00000486889 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-210ENST00000486889 Q8N3U1 123 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-210ENST00000486889 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-210ENST00000486889 A0A096LNJ9 63 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-210ENST00000486889 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-210ENST00000486889 PRSS2P07478 247 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-210ENST00000486889 UBE2D1P51668 147 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-210ENST00000486889 KRTDAPP60985 99 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-210ENST00000486889 HERVK_113P61574 105 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-210ENST00000486889 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
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