RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480486.1

CHAF1B-202, Transcript of chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene CHAF1B, Length 1,152 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1B-202ENST00000480486 FCER1GP30273 86 aa7.56□□□□□ -1.2
CHAF1B-202ENST00000480486 LAGE3Q14657 143 aa7.56□□□□□ -1.2
CHAF1B-202ENST00000480486 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.56□□□□□ -1.2
CHAF1B-202ENST00000480486 Q6ZTI0 123 aa7.56□□□□□ -1.2
CHAF1B-202ENST00000480486 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.55□□□□□ -1.2
CHAF1B-202ENST00000480486 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.55□□□□□ -1.2
CHAF1B-202ENST00000480486 F5H768 121 aa7.55□□□□□ -1.2
CHAF1B-202ENST00000480486 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CHAF1B-202ENST00000480486 KRTDAPP60985 99 aa7.55□□□□□ -1.2
CHAF1B-202ENST00000480486 PMCHL1Q16048 86 aa7.55□□□□□ -1.2
CHAF1B-202ENST00000480486 PYY3Q5JQD4 70 aa7.55□□□□□ -1.2
CHAF1B-202ENST00000480486 LCE4AQ5TA78 99 aa7.55□□□□□ -1.2
CHAF1B-202ENST00000480486 DNAJC30Q96LL9 226 aa7.55□□□□□ -1.2
CHAF1B-202ENST00000480486 C12orf57Q99622 126 aa7.55□□□□□ -1.2
CHAF1B-202ENST00000480486 KIR2DL4Q99706 377 aa7.55□□□□□ -1.2
CHAF1B-202ENST00000480486 UPK3BQ9BT76 320 aa7.55□□□□□ -1.2
CHAF1B-202ENST00000480486 TMEM70Q9BUB7 260 aa7.55□□□□□ -1.2
CHAF1B-202ENST00000480486 Q9H8V8 135 aa7.55□□□□□ -1.2
CHAF1B-202ENST00000480486 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.54□□□□□ -1.2
CHAF1B-202ENST00000480486 GAGE7O76087 117 aa7.54□□□□□ -1.2
CHAF1B-202ENST00000480486 SCGB1D1O95968 90 aa7.54□□□□□ -1.2
CHAF1B-202ENST00000480486 ATP5G1P05496 136 aa7.54□□□□□ -1.2
CHAF1B-202ENST00000480486 GAGE12FP0CL80 117 aa7.54□□□□□ -1.2
CHAF1B-202ENST00000480486 GAGE12GP0CL81 117 aa7.54□□□□□ -1.2
CHAF1B-202ENST00000480486 GAGE12IP0CL82 117 aa7.54□□□□□ -1.2
CHAF1B-202ENST00000480486 DEFB130BP0DP73 79 aa7.54□□□□□ -1.2
CHAF1B-202ENST00000480486 DEFB130AP0DP74 79 aa7.54□□□□□ -1.2
CHAF1B-202ENST00000480486 XGP55808 180 aa7.54□□□□□ -1.2
CHAF1B-202ENST00000480486 Q5VSD8 79 aa7.54□□□□□ -1.2
CHAF1B-202ENST00000480486 C18orf15Q96N68 181 aa7.54□□□□□ -1.2
CHAF1B-202ENST00000480486 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa7.54□□□□□ -1.2
CHAF1B-202ENST00000480486 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.53□□□□□ -1.2
CHAF1B-202ENST00000480486 LINC01549A6NIU2 74 aa7.53□□□□□ -1.2
CHAF1B-202ENST00000480486 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.53□□□□□ -1.2
CHAF1B-202ENST00000480486 C3orf79P0CE67 100 aa7.53□□□□□ -1.2
CHAF1B-202ENST00000480486 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.53□□□□□ -1.2
CHAF1B-202ENST00000480486 ZNF479Q96JC4 524 aa7.53□□□□□ -1.2
CHAF1B-202ENST00000480486 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.53□□□□□ -1.2
CHAF1B-202ENST00000480486 A0A096LNJ9 63 aa7.52□□□□□ -1.21
CHAF1B-202ENST00000480486 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.52□□□□□ -1.21
CHAF1B-202ENST00000480486 C20orf202A1L168 122 aa7.52□□□□□ -1.21
CHAF1B-202ENST00000480486 I3L3M4 83 aa7.52□□□□□ -1.21
CHAF1B-202ENST00000480486 ATP5LO75964 103 aa7.52□□□□□ -1.21
CHAF1B-202ENST00000480486 RHOHQ15669 191 aa7.52□□□□□ -1.21
CHAF1B-202ENST00000480486 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CHAF1B-202ENST00000480486 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.51□□□□□ -1.21
CHAF1B-202ENST00000480486 TRIAP1O43715 76 aa7.51□□□□□ -1.21
CHAF1B-202ENST00000480486 S100A12P80511 92 aa7.51□□□□□ -1.21
CHAF1B-202ENST00000480486 PET117Q6UWS5 81 aa7.51□□□□□ -1.21
CHAF1B-202ENST00000480486 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa7.5□□□□□ -1.21
CHAF1B-202ENST00000480486 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.5□□□□□ -1.21
CHAF1B-202ENST00000480486 K7EQD1 137 aa7.5□□□□□ -1.21
CHAF1B-202ENST00000480486 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CHAF1B-202ENST00000480486 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.5□□□□□ -1.21
CHAF1B-202ENST00000480486 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CHAF1B-202ENST00000480486 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.5□□□□□ -1.21
CHAF1B-202ENST00000480486 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CHAF1B-202ENST00000480486 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.49□□□□□ -1.21
CHAF1B-202ENST00000480486 LINC00173Q6ZV60 143 aa7.49□□□□□ -1.21
CHAF1B-202ENST00000480486 NEGR1Q7Z3B1 354 aa7.49□□□□□ -1.21
CHAF1B-202ENST00000480486 TOMM6Q96B49 74 aa7.49□□□□□ -1.21
CHAF1B-202ENST00000480486 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.49□□□□□ -1.21
CHAF1B-202ENST00000480486 CYSLTR1Q9Y271 337 aa7.49□□□□□ -1.21
CHAF1B-202ENST00000480486 H3BNG1 76 aa7.48□□□□□ -1.21
CHAF1B-202ENST00000480486 FHL2Q14192 279 aa7.48□□□□□ -1.21
CHAF1B-202ENST00000480486 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.48□□□□□ -1.21
CHAF1B-202ENST00000480486 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.48□□□□□ -1.21
CHAF1B-202ENST00000480486 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.47□□□□□ -1.21
CHAF1B-202ENST00000480486 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
CHAF1B-202ENST00000480486 TSHBP01222 138 aa7.47□□□□□ -1.21
CHAF1B-202ENST00000480486 COTL1Q14019 142 aa7.47□□□□□ -1.21
CHAF1B-202ENST00000480486 ESRGQ1W209 222 aa7.47□□□□□ -1.21
CHAF1B-202ENST00000480486 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
CHAF1B-202ENST00000480486 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7.47□□□□□ -1.21
CHAF1B-202ENST00000480486 Q8N976 141 aa7.47□□□□□ -1.21
CHAF1B-202ENST00000480486 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
CHAF1B-202ENST00000480486 PRSS1P07477 247 aa7.46□□□□□ -1.22
CHAF1B-202ENST00000480486 LINC01545Q5VT33 79 aa7.46□□□□□ -1.22
CHAF1B-202ENST00000480486 Q6ZN92 141 aa7.46□□□□□ -1.22
CHAF1B-202ENST00000480486 TEX43Q6ZNM6 134 aa7.46□□□□□ -1.22
CHAF1B-202ENST00000480486 ERASQ7Z444 233 aa7.46□□□□□ -1.22
CHAF1B-202ENST00000480486 TMEM141Q96I45 108 aa7.46□□□□□ -1.22
CHAF1B-202ENST00000480486 HHLA3Q9XRX5 114 aa7.46□□□□□ -1.22
CHAF1B-202ENST00000480486 GAGE12JA6NER3 117 aa7.45□□□□□ -1.22
CHAF1B-202ENST00000480486 H0Y8G0 127 aa7.45□□□□□ -1.22
CHAF1B-202ENST00000480486 KRTAP10-1P60331 282 aa7.45□□□□□ -1.22
CHAF1B-202ENST00000480486 UBE2D3P61077 147 aa7.45□□□□□ -1.22
CHAF1B-202ENST00000480486 UBE2D2P62837 147 aa7.45□□□□□ -1.22
CHAF1B-202ENST00000480486 GAGE1Q13065 139 aa7.45□□□□□ -1.22
CHAF1B-202ENST00000480486 GAGE4Q13068 117 aa7.45□□□□□ -1.22
CHAF1B-202ENST00000480486 GAGE5Q13069 117 aa7.45□□□□□ -1.22
CHAF1B-202ENST00000480486 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.45□□□□□ -1.22
CHAF1B-202ENST00000480486 TIMM17AQ99595 171 aa7.45□□□□□ -1.22
CHAF1B-202ENST00000480486 VAMP8Q9BV40 100 aa7.45□□□□□ -1.22
CHAF1B-202ENST00000480486 Q9UF83 564 aa7.45□□□□□ -1.22
CHAF1B-202ENST00000480486 PRO0255Q9UI72 69 aa7.45□□□□□ -1.22
CHAF1B-202ENST00000480486 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.45□□□□□ -1.22
CHAF1B-202ENST00000480486 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.44□□□□□ -1.22
CHAF1B-202ENST00000480486 TMEM97Q5BJF2 176 aa7.44□□□□□ -1.22
CHAF1B-202ENST00000480486 HMCN2Q8NDA2 5059 aa7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms