RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 GNB1LQ9BYB4 327 aa8.52□□□□□ -1.05
HPS1-211ENST00000478087 SMKR1H3BMG3 65 aa8.51□□□□□ -1.05
HPS1-211ENST00000478087 CRPP02741 224 aa8.51□□□□□ -1.05
HPS1-211ENST00000478087 ANGP03950 147 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
HPS1-211ENST00000478087 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
HPS1-211ENST00000478087 FCER1GP30273 86 aa8.51□□□□□ -1.05
HPS1-211ENST00000478087 CLPSL2Q6UWE3 100 aa8.51□□□□□ -1.05
HPS1-211ENST00000478087 TMEM18Q96B42 140 aa8.51□□□□□ -1.05
HPS1-211ENST00000478087 PRELID3AQ96N28 172 aa8.51□□□□□ -1.05
HPS1-211ENST00000478087 PRSS47A8MTI9 375 aa8.5□□□□□ -1.05
HPS1-211ENST00000478087 RBX1P62877 108 aa8.5□□□□□ -1.05
HPS1-211ENST00000478087 Q6ZSA8 131 aa8.5□□□□□ -1.05
HPS1-211ENST00000478087 SMIM2Q9BVW6 85 aa8.5□□□□□ -1.05
HPS1-211ENST00000478087 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HPS1-211ENST00000478087 GAS8-AS1O95177 125 aa8.49□□□□□ -1.05
HPS1-211ENST00000478087 TSHBP01222 138 aa8.49□□□□□ -1.05
HPS1-211ENST00000478087 ESDP10768 282 aa8.49□□□□□ -1.05
HPS1-211ENST00000478087 MIAQ16674 131 aa8.49□□□□□ -1.05
HPS1-211ENST00000478087 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa8.49□□□□□ -1.05
HPS1-211ENST00000478087 MAP1LC3AQ9H492 121 aa8.49□□□□□ -1.05
HPS1-211ENST00000478087 FAM229AH3BQW9 127 aa8.48□□□□□ -1.05
HPS1-211ENST00000478087 K7EMI3 77 aa8.48□□□□□ -1.05
HPS1-211ENST00000478087 NPYP01303 97 aa8.48□□□□□ -1.05
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.48□□□□□ -1.05
HPS1-211ENST00000478087 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa8.48□□□□□ -1.05
HPS1-211ENST00000478087 LINC00269Q8N2A0 174 aa8.48□□□□□ -1.05
HPS1-211ENST00000478087 TMEM101Q96IK0 257 aa8.48□□□□□ -1.05
HPS1-211ENST00000478087 C1orf43Q9BWL3 253 aa8.48□□□□□ -1.05
HPS1-211ENST00000478087 PRR34Q9NV39 138 aa8.48□□□□□ -1.05
HPS1-211ENST00000478087 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8.47□□□□□ -1.05
HPS1-211ENST00000478087 RAB5AP20339 215 aa8.47□□□□□ -1.05
HPS1-211ENST00000478087 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
HPS1-211ENST00000478087 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.46□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 USP17L23D6RBM5 183 aa8.46□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 FGF6P10767 208 aa8.46□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 G0S2P27469 103 aa8.46□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 SCXQ7RTU7 201 aa8.46□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 SMCO4Q9NRQ5 59 aa8.46□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.45□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 PRSS1P07477 247 aa8.45□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.45□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.45□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 REG3AQ06141 175 aa8.44□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa8.44□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.44□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 Q8N8P6 123 aa8.44□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 OR5A1Q8NGJ0 315 aa8.44□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 LINC01549A6NIU2 74 aa8.43□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 FABP9Q0Z7S8 132 aa8.43□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.43□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa8.42□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 CCL25O15444 150 aa8.42□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 C14orf177Q52M58 125 aa8.42□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa8.42□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.42□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.42□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa8.42□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa8.41□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa8.4□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 PANO1I0J062 215 aa8.4□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 NPSP0C0P6 89 aa8.4□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 KIAA1644Q3SXP7 199 aa8.4□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 ZNF664Q8N3J9 261 aa8.4□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa8.4□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 YPEL4Q96NS1 127 aa8.4□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.4□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.4□□□□□ -1.06
HPS1-211ENST00000478087 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
HPS1-211ENST00000478087 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
HPS1-211ENST00000478087 CYSLTR1Q9Y271 337 aa8.39□□□□□ -1.07
HPS1-211ENST00000478087 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa8.39□□□□□ -1.07
HPS1-211ENST00000478087 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa8.38□□□□□ -1.07
HPS1-211ENST00000478087 SLPIP03973 132 aa8.38□□□□□ -1.07
HPS1-211ENST00000478087 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
HPS1-211ENST00000478087 SS18Q15532 418 aa8.38□□□□□ -1.07
HPS1-211ENST00000478087 FAT3Q8TDW7 4589 aa8.38□□□□□ -1.07
HPS1-211ENST00000478087 LINC01546A6NGU7 62 aa8.37□□□□□ -1.07
HPS1-211ENST00000478087 RAB5BP61020 215 aa8.37□□□□□ -1.07
HPS1-211ENST00000478087 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa8.37□□□□□ -1.07
HPS1-211ENST00000478087 CFAP161Q6P656 301 aa8.37□□□□□ -1.07
HPS1-211ENST00000478087 FA2HQ7L5A8 372 aa8.37□□□□□ -1.07
HPS1-211ENST00000478087 CBLN2Q8IUK8 224 aa8.37□□□□□ -1.07
HPS1-211ENST00000478087 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.37□□□□□ -1.07
HPS1-211ENST00000478087 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
HPS1-211ENST00000478087 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.36□□□□□ -1.07
HPS1-211ENST00000478087 C1orf196B1AJZ1 125 aa8.36□□□□□ -1.07
HPS1-211ENST00000478087 C2orf66Q6UXQ4 117 aa8.36□□□□□ -1.07
HPS1-211ENST00000478087 SDIM1Q6ZPB5 146 aa8.36□□□□□ -1.07
HPS1-211ENST00000478087 hDV102S1A0JD36 115 aa8.35□□□□□ -1.07
HPS1-211ENST00000478087 GAGE12HA6NDE8 117 aa8.35□□□□□ -1.07
HPS1-211ENST00000478087 RPL39P62891 51 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
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