RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467095.5

SYN3-208, Transcript of synapsin III, human

TSL 3

Gene SYN3, Length 742 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SYN3-208	ENST00000467095	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	WFDC2	Q14508	124 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	C6orf223	Q8N319	242 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	TMEM243	Q9BU79	118 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	PRR34	Q9NV39	138 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	KLK12	Q9UKR0	248 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095		A0A096LNJ9	63 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095		A0A1B0GUV1	79 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095		Q8N8P6	123 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	TMEM262	E9PQX1	116 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	PPP1R17	O96001	155 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	MT-ND6	P03923	174 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	TRGC2	P03986	189 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	FGF6	P10767	208 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	COX19	Q49B96	90 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095		Q9HAA7	133 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095		H7C423	109 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095		K7EP13	123 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	LAGE3	Q14657	143 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	TTC32	Q5I0X7	151 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095		Q6ZUT4	128 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095		A0A087WX48	190 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	NUPR1	O60356	82 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	RAB5A	P20339	215 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	UBE2W	Q96B02	151 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	IGIP	A6NJ69	53 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	FCER1G	P30273	86 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	REG3A	Q06141	175 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	KIR2DL4	Q99706	377 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SYN3-208	ENST00000467095	HSPG2	P98160	4391 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYN3-208	ENST00000467095		A0A087WTM6	91 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYN3-208	ENST00000467095	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYN3-208	ENST00000467095	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYN3-208	ENST00000467095	UBE2L6	O14933	153 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYN3-208	ENST00000467095	LECT2	O14960	151 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYN3-208	ENST00000467095	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SYN3-208	ENST00000467095	S100A1	P23297	94 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYN3-208	ENST00000467095	PMCHL1	Q16048	86 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYN3-208	ENST00000467095	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYN3-208	ENST00000467095	BAALC	Q8WXS3	180 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYN3-208	ENST00000467095	TOMM6	Q96B49	74 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYN3-208	ENST00000467095	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYN3-208	ENST00000467095	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYN3-208	ENST00000467095	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYN3-208	ENST00000467095	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYN3-208	ENST00000467095	LINC00614	P0C842	121 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYN3-208	ENST00000467095	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SYN3-208	ENST00000467095	COX6A2	Q02221	97 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYN3-208	ENST00000467095		Q0VG73	95 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYN3-208	ENST00000467095	FOXI1	Q12951	378 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYN3-208	ENST00000467095	MIA	Q16674	131 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYN3-208	ENST00000467095	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYN3-208	ENST00000467095	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYN3-208	ENST00000467095	AMELX	Q99217	191 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYN3-208	ENST00000467095		K7EMI3	77 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYN3-208	ENST00000467095	HIST1H2BK	O60814	126 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYN3-208	ENST00000467095	SLPI	P03973	132 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYN3-208	ENST00000467095	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYN3-208	ENST00000467095	HIST1H2BO	P23527	126 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYN3-208	ENST00000467095	HIST1H2BB	P33778	126 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYN3-208	ENST00000467095	HIST1H2BD	P58876	126 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYN3-208	ENST00000467095	PKIA	P61925	76 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYN3-208	ENST00000467095	HIST1H2BC	P62807	126 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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