RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460328.5

TTC3-211, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 3

Gene TTC3, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-211ENST00000460328 TTC9CQ8N5M4 171 aa-0.82□□□□□ -2.54
TTC3-211ENST00000460328 AMELXQ99217 191 aa-0.82□□□□□ -2.54
TTC3-211ENST00000460328 MYO7BQ6PIF6 2116 aa-0.82□□□□□ -2.54
TTC3-211ENST00000460328 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
TTC3-211ENST00000460328 LRRC37A2A6NM11 1700 aa-0.83□□□□□ -2.54
TTC3-211ENST00000460328 PXDNQ92626 1479 aa-0.83□□□□□ -2.54
TTC3-211ENST00000460328 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa-0.83□□□□□ -2.54
TTC3-211ENST00000460328 COX6B1P14854 86 aa-0.83□□□□□ -2.54
TTC3-211ENST00000460328 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
TTC3-211ENST00000460328 ALX1Q15699 326 aa-0.83□□□□□ -2.54
TTC3-211ENST00000460328 KLK9Q2XQG4 91 aa-0.83□□□□□ -2.54
TTC3-211ENST00000460328 AKAP14Q86UN6 197 aa-0.83□□□□□ -2.54
TTC3-211ENST00000460328 PYDC1Q8WXC3 89 aa-0.83□□□□□ -2.54
TTC3-211ENST00000460328 LZICQ8WZA0 190 aa-0.83□□□□□ -2.54
TTC3-211ENST00000460328 TSLPQ969D9 159 aa-0.83□□□□□ -2.54
TTC3-211ENST00000460328 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
TTC3-211ENST00000460328 DPH3Q96FX2 82 aa-0.83□□□□□ -2.54
TTC3-211ENST00000460328 AQP10Q96PS8 301 aa-0.83□□□□□ -2.54
TTC3-211ENST00000460328 RNF213Q63HN8 5207 aa-0.83□□□□□ -2.54
TTC3-211ENST00000460328 TNFP01375 233 aa-0.84□□□□□ -2.54
TTC3-211ENST00000460328 Q8N8P6 123 aa-0.84□□□□□ -2.54
TTC3-211ENST00000460328 LENEPQ9Y5L5 61 aa-0.84□□□□□ -2.54
TTC3-211ENST00000460328 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
TTC3-211ENST00000460328 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa-0.84□□□□□ -2.54
TTC3-211ENST00000460328 PATJQ8NI35 1801 aa-0.85□□□□□ -2.54
TTC3-211ENST00000460328 WDR7Q9Y4E6 1490 aa-0.85□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 SVEP1Q4LDE5 3571 aa-0.85□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 MT4P47944 62 aa-0.85□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 BAGE2Q86Y30 109 aa-0.85□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 COPZ2Q9P299 210 aa-0.85□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 SMIM21Q3B7S5 101 aa-0.86□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 Q6AWC8 147 aa-0.86□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 PDCD10Q9BUL8 212 aa-0.86□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa-0.86□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa-0.87□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 IGLC7A0M8Q6 106 aa-0.87□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 F8VRH5 84 aa-0.87□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 COX17Q14061 63 aa-0.87□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 SMCO1Q147U7 214 aa-0.87□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 TMEM191AQ9H0A3 160 aa-0.87□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 CEP152O94986 1710 aa-0.87□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 SBF2Q86WG5 1849 aa-0.87□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 DOCK2Q92608 1830 aa-0.87□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 M0R2T5 61 aa-0.88□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 DR1Q01658 176 aa-0.88□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 WNK1Q9H4A3 2382 aa-0.88□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 UQCR11O14957 56 aa-0.89□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa-0.89□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 DEFB123Q8N688 67 aa-0.89□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 MAFIPQ8WZ33 124 aa-0.89□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa-0.89□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 MYOM3Q5VTT5 1437 aa-0.89□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 STARD9Q9P2P6 4700 aa-0.9□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 HMGN4O00479 90 aa-0.9□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 DEFB105AQ8NG35 78 aa-0.9□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 TCEAL4Q96EI5 215 aa-0.9□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 NSD3Q9BZ95 1437 aa-0.9□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 TGP01266 2768 aa-0.91□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 LAMA5O15230 3695 aa-0.91□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 HIVEP1P15822 2718 aa-0.91□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP-0.91□□□□□ -2.55
TTC3-211ENST00000460328 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP-0.91□□□□□ -2.56
TTC3-211ENST00000460328 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa-0.91□□□□□ -2.56
TTC3-211ENST00000460328 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa-0.91□□□□□ -2.56
TTC3-211ENST00000460328 APOC3P02656 99 aa-0.91□□□□□ -2.56
TTC3-211ENST00000460328 MGST2Q99735 147 aa-0.91□□□□□ -2.56
TTC3-211ENST00000460328 DYNLRB1Q9NP97 96 aa-0.91□□□□□ -2.56
TTC3-211ENST00000460328 CCDC167Q9P0B6 97 aa-0.91□□□□□ -2.56
TTC3-211ENST00000460328 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa-0.91□□□□□ -2.56
TTC3-211ENST00000460328 BTAF1O14981 1849 aa-0.92□□□□□ -2.56
TTC3-211ENST00000460328 SPINK4O60575 86 aa-0.92□□□□□ -2.56
TTC3-211ENST00000460328 SERP1Q9Y6X1 66 aa-0.92□□□□□ -2.56
TTC3-211ENST00000460328 PSME4Q14997 1843 aa-0.92□□□□□ -2.56
TTC3-211ENST00000460328 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP-0.92□□□□□ -2.56
TTC3-211ENST00000460328 CFTRP13569 1480 aa-0.92□□□□□ -2.56
TTC3-211ENST00000460328 GRIN2AQ12879 1464 aa-0.92□□□□□ -2.56
TTC3-211ENST00000460328 IQSEC2Q5JU85 1478 aa-0.92□□□□□ -2.56
TTC3-211ENST00000460328 RYR2Q92736 4967 aa-0.93□□□□□ -2.56
TTC3-211ENST00000460328 PKHD1P08F94 4074 aa-0.93□□□□□ -2.56
TTC3-211ENST00000460328 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa-0.93□□□□□ -2.56
TTC3-211ENST00000460328 TPPP2P59282 170 aa-0.93□□□□□ -2.56
TTC3-211ENST00000460328 ARPC4P59998 168 aa-0.93□□□□□ -2.56
TTC3-211ENST00000460328 LINC00474Q9P2X8 69 aa-0.93□□□□□ -2.56
TTC3-211ENST00000460328 MXRA5Q9NR99 2828 aa-0.93□□□□□ -2.56
TTC3-211ENST00000460328 PI4KAP42356 2102 aa-0.94□□□□□ -2.56
TTC3-211ENST00000460328 BICRAQ9NZM4 1560 aa-0.94□□□□□ -2.56
TTC3-211ENST00000460328 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa-0.94□□□□□ -2.56
TTC3-211ENST00000460328 SFT2D2O95562 160 aa-0.94□□□□□ -2.56
TTC3-211ENST00000460328 C12orf73Q69YU5 71 aa-0.94□□□□□ -2.56
TTC3-211ENST00000460328 PFDN5Q99471 154 aa-0.94□□□□□ -2.56
TTC3-211ENST00000460328 RERGLQ9H628 205 aa-0.94□□□□□ -2.56
TTC3-211ENST00000460328 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa-0.94□□□□□ -2.56
TTC3-211ENST00000460328 GAPVD1Q14C86 1478 aa-0.94□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.6 ms