RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455953.1

NCBP2-208, Transcript of nuclear cap binding protein subunit 2, human

TSL 5

Gene NCBP2, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCBP2-208	ENST00000455953	TMEM18	Q96B42	140 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	MRAP2	Q96G30	205 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	RNF185	Q96GF1	192 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	ST20	Q9HBF5	79 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	OCC1	Q8TAD7	63 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	ISOC2	Q96AB3	205 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953		A0A1B0GUT8	65 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	ZNF727	A8MUV8	499 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	RIG	Q13278	110 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	KIR2DL4	Q99706	377 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	PPP1R2P9	O14990	202 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	S100A8	P05109	93 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	FGF6	P10767	208 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	XCL1	P47992	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	MAJIN	Q3KP22	176 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	NRAC	Q8N912	160 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	GATD1	Q8NB37	220 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	GTSF1	Q8WW33	167 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	FAM231B	A6NCW3	169 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	HIGD1C	A8MV81	97 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	TCAP	O15273	167 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	APOM	O95445	188 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	TSKU	Q8WUA8	353 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	CNFN	Q9BYD5	112 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953		F8W036	122 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953		K7EN84	100 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	VCY	O14598	125 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	CCL25	O15444	150 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	COX6A2	Q02221	97 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	ADIRF	Q15847	76 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	CARD19	Q96LW7	228 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953		A0A1B0GW15	77 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	PEA15	Q15121	130 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953		Q6ZRU5	148 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	STPG4	Q8N801	248 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	OSTC	Q9NRP0	149 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953		A0A087WYN8	130 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	COX7A2L	O14548	114 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	CKS2	P33552	79 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	LINC01551	Q86U37	167 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	PHOX2A	O14813	284 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	RAB5A	P20339	215 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	CAMP	P49913	170 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	SYCN	Q0VAF6	134 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	AMN1	Q8IY45	258 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	C15orf56	Q8N910	161 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	NAT8	Q9UHE5	227 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	LINC00862	A6NCI5	91 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	CHTF8	P0CG12	524 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	RAB4A	P20338	218 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCBP2-208	ENST00000455953	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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