RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437028.5

SNHG11-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 11, human

TSL 3

Gene SNHG11, Length 1,169 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG11-208	ENST00000437028	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SNHG11-208	ENST00000437028	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
SNHG11-208	ENST00000437028	KLK12	Q9UKR0	248 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SNHG11-208	ENST00000437028	TRGC2	P03986	189 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SNHG11-208	ENST00000437028	FCER1G	P30273	86 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SNHG11-208	ENST00000437028	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SNHG11-208	ENST00000437028		Q0VG73	95 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SNHG11-208	ENST00000437028	UBE2W	Q96B02	151 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SNHG11-208	ENST00000437028	C14orf177	Q52M58	125 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SNHG11-208	ENST00000437028	KIR2DL4	Q99706	377 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SNHG11-208	ENST00000437028	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SNHG11-208	ENST00000437028	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SNHG11-208	ENST00000437028	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SNHG11-208	ENST00000437028	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SNHG11-208	ENST00000437028	AMT	P48728	403 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SNHG11-208	ENST00000437028	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SNHG11-208	ENST00000437028	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SNHG11-208	ENST00000437028	CRP	P02741	224 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SNHG11-208	ENST00000437028	PKIA	P61925	76 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SNHG11-208	ENST00000437028	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SNHG11-208	ENST00000437028	SCX	Q7RTU7	201 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SNHG11-208	ENST00000437028	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SNHG11-208	ENST00000437028	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SNHG11-208	ENST00000437028	TMEM262	E9PQX1	116 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SNHG11-208	ENST00000437028	TCAP	O15273	167 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SNHG11-208	ENST00000437028	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SNHG11-208	ENST00000437028	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SNHG11-208	ENST00000437028		Q8N8P6	123 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SNHG11-208	ENST00000437028	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SNHG11-208	ENST00000437028	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SNHG11-208	ENST00000437028	PRSS47	A8MTI9	375 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SNHG11-208	ENST00000437028	UBE2L6	O14933	153 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SNHG11-208	ENST00000437028	TSHB	P01222	138 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SNHG11-208	ENST00000437028	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SNHG11-208	ENST00000437028	LINC01620	Q4KN68	170 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SNHG11-208	ENST00000437028	TMEM243	Q9BU79	118 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SNHG11-208	ENST00000437028	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SNHG11-208	ENST00000437028	FA2H	Q7L5A8	372 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SNHG11-208	ENST00000437028	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SNHG11-208	ENST00000437028	GAGE6	Q13070	117 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SNHG11-208	ENST00000437028	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SNHG11-208	ENST00000437028	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SNHG11-208	ENST00000437028	RAB5B	P61020	215 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SNHG11-208	ENST00000437028	BAGE3	Q86Y29	109 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SNHG11-208	ENST00000437028	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SNHG11-208	ENST00000437028	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SNHG11-208	ENST00000437028	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SNHG11-208	ENST00000437028	MPV17L2	Q567V2	206 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SNHG11-208	ENST00000437028	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SNHG11-208	ENST00000437028	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SNHG11-208	ENST00000437028	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SNHG11-208	ENST00000437028	TMEM18	Q96B42	140 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SNHG11-208	ENST00000437028		K7EMI3	77 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SNHG11-208	ENST00000437028	MIA	Q16674	131 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SNHG11-208	ENST00000437028	ENHO	Q6UWT2	76 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SNHG11-208	ENST00000437028	LINC00614	P0C842	121 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SNHG11-208	ENST00000437028	ESD	P10768	282 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SNHG11-208	ENST00000437028	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SNHG11-208	ENST00000437028		H7C423	109 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SNHG11-208	ENST00000437028	OXT	P01178	125 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SNHG11-208	ENST00000437028	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SNHG11-208	ENST00000437028	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SNHG11-208	ENST00000437028	USP17L23	D6RBM5	183 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SNHG11-208	ENST00000437028	FGF6	P10767	208 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SNHG11-208	ENST00000437028	G0S2	P27469	103 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SNHG11-208	ENST00000437028	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SNHG11-208	ENST00000437028	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SNHG11-208	ENST00000437028	TMEM101	Q96IK0	257 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SNHG11-208	ENST00000437028	HIST1H2BK	O60814	126 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SNHG11-208	ENST00000437028	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SNHG11-208	ENST00000437028	HIST1H2BO	P23527	126 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SNHG11-208	ENST00000437028	HIST1H2BB	P33778	126 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SNHG11-208	ENST00000437028	HIST1H2BD	P58876	126 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SNHG11-208	ENST00000437028	HIST1H2BC	P62807	126 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SNHG11-208	ENST00000437028	RBX1	P62877	108 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SNHG11-208	ENST00000437028	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
SNHG11-208	ENST00000437028	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SNHG11-208	ENST00000437028	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
SNHG11-208	ENST00000437028	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SNHG11-208	ENST00000437028	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SNHG11-208	ENST00000437028	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SNHG11-208	ENST00000437028	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SNHG11-208	ENST00000437028	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
SNHG11-208	ENST00000437028	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		10	□□□□□ -0.81
SNHG11-208	ENST00000437028	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		10	□□□□□ -0.81
SNHG11-208	ENST00000437028	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		10	□□□□□ -0.81
SNHG11-208	ENST00000437028	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
SNHG11-208	ENST00000437028	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		10	□□□□□ -0.81
SNHG11-208	ENST00000437028	PRR34	Q9NV39	138 aa		10	□□□□□ -0.81
SNHG11-208	ENST00000437028	LINC01546	A6NGU7	62 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SNHG11-208	ENST00000437028	HSBP1	O75506	76 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SNHG11-208	ENST00000437028	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
SNHG11-208	ENST00000437028		A0A1B0GUV1	79 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SNHG11-208	ENST00000437028	SERF1A	O75920	110 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
SNHG11-208	ENST00000437028	NDUFA6	P56556	154 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SNHG11-208	ENST00000437028	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SNHG11-208	ENST00000437028	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SNHG11-208	ENST00000437028	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SNHG11-208	ENST00000437028	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		9.97	□□□□□ -0.81

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 151.6 ms