RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM136Q6ZRR5 245 aa16.26■□□□□ 0.19
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 SS18Q15532 418 aa16.13■□□□□ 0.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MAP1LC3AQ9H492 121 aa16.13■□□□□ 0.17
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 C1orf196B1AJZ1 125 aa16.08■□□□□ 0.16
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C5orf38Q86SI9 138 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LINC00528Q8N1L1 170 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CYSLTR1Q9Y271 337 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IFITM10A6NMD0 228 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SNAPINO95295 136 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NDUFA5Q16718 116 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MT-ND6P03923 174 aa15.96■□□□□ 0.15
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa15.95■□□□□ 0.14
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