RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 TSHBP01222 138 aa4.82□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 LINC00467Q9BRT7 94 aa4.82□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 FSTL3O95633 263 aa4.82□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 TMEM254Q8TBM7 123 aa4.82□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 DCANP1Q8TF63 244 aa4.82□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 LIMD2Q9BT23 127 aa4.82□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa4.81□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 COX17Q14061 63 aa4.81□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 EP400Q96L91 3159 aa4.81□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 DEFB124Q8NES8 71 aa4.81□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 DEFB105AQ8NG35 78 aa4.81□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 Q8N3U1 123 aa4.81□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 LINC00846Q9NV44 126 aa4.81□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 POM121L12Q8N7R1 296 aa4.81□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 COX7BP24311 80 aa4.8□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 UBE2E2Q96LR5 201 aa4.8□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 H3BUX3 64 aa4.8□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 K7ENP7 123 aa4.8□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 IGLV1-47P01700 117 aa4.8□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 ANGP03950 147 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa4.8□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 LINC00336Q6ZUF6 198 aa4.8□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa4.8□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 Q8N814 137 aa4.8□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 E7EQL1 145 aa4.8□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa4.79□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 SCXQ7RTU7 201 aa4.79□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa4.79□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 GPHB5Q86YW7 130 aa4.79□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 ZFAND3Q9H8U3 227 aa4.79□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 CTSZQ9UBR2 303 aa4.79□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 Q8N6K4 173 aa4.79□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 FHL2Q14192 279 aa4.79□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 DKK4Q9UBT3 224 aa4.79□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 A0A087WYN8 130 aa4.79□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 K7EMT4 169 aa4.79□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 C22orf34Q6ZV56 151 aa4.78□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 CLPSL2Q6UWE3 100 aa4.78□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa4.78□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa4.78□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 CASC2Q6XLA1 102 aa4.78□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 CLPSL1A2RUU4 121 aa4.78□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 RMI2Q96E14 147 aa4.78□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 C16orf74Q96GX8 76 aa4.78□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
SBNO1-202ENST00000420886 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa4.77□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 ATRXP46100 2492 aa4.77□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 PRR15Q8IV56 129 aa4.77□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 PTPN13Q12923 2485 aa4.77□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 LRCOL1A6NCL2 159 aa4.77□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 DEFB130BP0DP73 79 aa4.77□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 DEFB130AP0DP74 79 aa4.77□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 AMELXQ99217 191 aa4.77□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 EDN2P20800 178 aa4.77□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 HILS1P60008 231 aa4.77□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 EPOPA6NHQ4 379 aa4.77□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 MUC7Q8TAX7 377 aa4.77□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 Q8N9W7 124 aa4.77□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 C5orf56Q8N8D9 126 aa4.76□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 ESM1Q9NQ30 184 aa4.76□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 FAM30AQ9NZY2 134 aa4.76□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 Q6ZSV7 163 aa4.76□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 SMCR5Q8TEV8 140 aa4.76□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 C11orf21Q9P2W6 132 aa4.76□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa4.75□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa4.75□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 LINC01548A6NM66 108 aa4.75□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 SPAG11BQ08648 103 aa4.75□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 WFDC10AQ9H1F0 79 aa4.75□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 APRG1Q8IVJ8 170 aa4.75□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 CCDC140Q96MF4 163 aa4.75□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 KLKP1Q107X0 134 aa4.75□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 LINC01561Q8N1V8 128 aa4.75□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 BRI3O95415 125 aa4.75□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 TMEM89A2RUT3 159 aa4.75□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 HTN3P15516 51 aa4.75□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 C6orf99Q4VX62 202 aa4.75□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 KLLNB2CW77 178 aa4.75□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 BRD3OSQ6XYD6 125 aa4.75□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 ERC2-IT1O76042 136 aa4.75□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 GPR179Q6PRD1 2367 aa4.74□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 CCL24O00175 119 aa4.74□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa4.74□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 U3KQA8 63 aa4.74□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 C3orf84H3BNL1 204 aa4.74□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 SEM1Q6ZVN7 128 aa4.73□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.73□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 CELA1Q9UNI1 258 aa4.73□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 A0A087WZ39 114 aa4.73□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 IL17DQ8TAD2 202 aa4.73□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 IGF1P05019 195 aa4.73□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa4.73□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 PRR9Q5T870 116 aa4.72□□□□□ -1.65
SBNO1-202ENST00000420886 Q6ZVQ6 151 aa4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms