RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395211.6

TMOD1-203, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-203ENST00000395211 CRPP02741 224 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD1-203ENST00000395211 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD1-203ENST00000395211 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD1-203ENST00000395211 BPESC1Q9GZL8 116 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD1-203ENST00000395211 G3V318 75 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD1-203ENST00000395211 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD1-203ENST00000395211 RNF5Q99942 180 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD1-203ENST00000395211 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
TMOD1-203ENST00000395211 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa6.96□□□□□ -1.3
TMOD1-203ENST00000395211 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.96□□□□□ -1.3
TMOD1-203ENST00000395211 ATMQ13315 3056 aa6.96□□□□□ -1.3
TMOD1-203ENST00000395211 PROK1P58294 105 aa6.96□□□□□ -1.3
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TMOD1-203ENST00000395211 CCKP06307 115 aa6.95□□□□□ -1.3
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TMOD1-203ENST00000395211 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TMOD1-203ENST00000395211 DMXL1Q9Y485 3027 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD1-203ENST00000395211 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.95□□□□□ -1.3
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TMOD1-203ENST00000395211 MED14OSP0DP75 135 aa6.95□□□□□ -1.3
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TMOD1-203ENST00000395211 CCDC140Q96MF4 163 aa6.95□□□□□ -1.3
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TMOD1-203ENST00000395211 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa6.94□□□□□ -1.3
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TMOD1-203ENST00000395211 SEM1Q6ZVN7 128 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD1-203ENST00000395211 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.93□□□□□ -1.3
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TMOD1-203ENST00000395211 MOB4Q9Y3A3 225 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD1-203ENST00000395211 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
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TMOD1-203ENST00000395211 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.93□□□□□ -1.3
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TMOD1-203ENST00000395211 Q9UF83 564 aa6.93□□□□□ -1.3
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TMOD1-203ENST00000395211 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD1-203ENST00000395211 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
TMOD1-203ENST00000395211 UBL5Q9BZL1 73 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD1-203ENST00000395211 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.92□□□□□ -1.3
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TMOD1-203ENST00000395211 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD1-203ENST00000395211 LY6HO94772 140 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD1-203ENST00000395211 IGHV3-11P01762 117 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD1-203ENST00000395211 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.91□□□□□ -1.3
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TMOD1-203ENST00000395211 U3KQE9 123 aa6.91□□□□□ -1.3
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TMOD1-203ENST00000395211 A0A087WZ39 114 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD1-203ENST00000395211 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD1-203ENST00000395211 BLCAPP62952 87 aa6.91□□□□□ -1.3
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TMOD1-203ENST00000395211 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD1-203ENST00000395211 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.9□□□□□ -1.3
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TMOD1-203ENST00000395211 KAAG1Q9UBP8 84 aa6.9□□□□□ -1.3
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TMOD1-203ENST00000395211 LINC00158P58513 81 aa6.9□□□□□ -1.31
TMOD1-203ENST00000395211 Q6ZTI0 123 aa6.9□□□□□ -1.31
TMOD1-203ENST00000395211 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
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TMOD1-203ENST00000395211 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD1-203ENST00000395211 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TMOD1-203ENST00000395211 LAMA5O15230 3695 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD1-203ENST00000395211 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD1-203ENST00000395211 PAX4O43316 350 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD1-203ENST00000395211 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD1-203ENST00000395211 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TMOD1-203ENST00000395211 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD1-203ENST00000395211 SCXQ7RTU7 201 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD1-203ENST00000395211 NBASA2RRP1 2371 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD1-203ENST00000395211 PRM2P04554 102 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD1-203ENST00000395211 Q8N9W7 124 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD1-203ENST00000395211 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
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TMOD1-203ENST00000395211 H0YGX0 51 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD1-203ENST00000395211 KLKP1Q107X0 134 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD1-203ENST00000395211 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD1-203ENST00000395211 FAM215AQ9Y5M1 114 aa6.86□□□□□ -1.31
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TMOD1-203ENST00000395211 Q96MF0 132 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD1-203ENST00000395211 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD1-203ENST00000395211 IGKV2D-28P01615 120 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD1-203ENST00000395211 SAA4P35542 130 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD1-203ENST00000395211 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD1-203ENST00000395211 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TMOD1-203ENST00000395211 KLLNB2CW77 178 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD1-203ENST00000395211 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD1-203ENST00000395211 MIFP14174 115 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD1-203ENST00000395211 PLA2G2CQ5R387 149 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD1-203ENST00000395211 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD1-203ENST00000395211 CUL9Q8IWT3 2517 aa6.85□□□□□ -1.31
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