RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-201ENST00000284957 A6NDN8 102 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-201ENST00000284957 WFDC2Q14508 124 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-201ENST00000284957 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-201ENST00000284957 UBE2D3P61077 147 aa6.59□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 UBE2D2P62837 147 aa6.59□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.59□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 BAALCQ8WXS3 180 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 GAGE12JA6NER3 117 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 GAGE4Q13068 117 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 GAGE5Q13069 117 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 GAGE13Q4V321 117 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM104AQ969W3 186 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 PCP2Q8IVA1 136 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A087WX48 190 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 LINC00694P0DN24 101 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 TIMM17AQ99595 171 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1W2PPM0 123 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 LINC01549A6NIU2 74 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 K7EIL1 84 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 H3BMG7 143 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 COX8AP10176 69 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM141Q96I45 108 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 A4D1N5 150 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 DAD1P61803 113 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 SEC11AP67812 179 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 H3BRM9 83 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 DNHD1Q96M86 4753 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 F8VRH5 84 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 IGKCP01834 107 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 PRO0255Q9UI72 69 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 DPM2O94777 84 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 FXYD2P54710 66 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 PMVKQ15126 192 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.53□□□□□ -1.36
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RABGEF1-201ENST00000284957 GYPEP15421 78 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1B0GWB2 263 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 C12orf74Q32Q52 190 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-201ENST00000284957 B5MCH6 92 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 J3QR89 54 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 ATP5G1P05496 136 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 PLNP26678 52 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A0J9YY99 117 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 PAX4O43316 350 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 SPINK8P0C7L1 97 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 AMELXQ99217 191 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 COL7A1Q02388 2944 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A0J9YWU9 116 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 C11orf86A6NJI1 115 aa6.51□□□□□ -1.37
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RABGEF1-201ENST00000284957 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 F5H768 121 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 MT-ATP8P03928 68 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 HERV-K104P63124 156 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 MRAPQ8TCY5 172 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 VCX2Q9H322 139 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 FGF6P10767 208 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 HTN3P15516 51 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A096LPF7 62 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM243Q9BU79 118 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
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